Geri Dön

Uterin servikal kanser örneklerinde pyrosequencıng yöntemi ile human papillomavirus (HPV) genotiplerinin belirlenmesi

Detection of human papillomavirus (HPV) genotypes by pyrosequencing method in uterine cervical cancer samples

PDF İndir

  1. Tez No: 369797
  2. Yazar: MESUT BELHAN
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. YASEMİN BULUT
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Human papilloma virus, HPV, uterin servikal kanser, genotip, pyrosequencing, Human papilloma virus, HPV, uterine cervical cancer, genotype, pyrosequencing
  7. Yıl: 2014
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Fırat Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Temel Tıp Bilimleri Bölümü
  12. Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: 88

Özet

Servikal kanser kadınlarda göğüs kanserinden sonra görülen ikinci en yaygın kanser türüdür. Human papillomavirus (HPV) servikal kanserin primer etiyolojik ajanı olarak kabul edilmektedir. HPV tipleri epidemiyolojik ilişkilerine ve HPV genotiplerine göre kategorize edilir. Genom dizi analizine göre şimdiye kadar 100'den fazla HPV genotipi identifiye edilmiştir. HPV genotiplerinin tespiti için kullanılan moleküler testler aşılama stratejisinin oluşturulmasında ve epidemiyolojik amaçla oldukça önemlidir. Pyrosequencing yöntemi HPV genotiplerinin belirlenmesinde kullanılan yeni bir yöntemdir. Bu tezde pyrosequencing yöntemi ile uterin servikal kanseri tanısı olan hastaların HPV genotiplerinin belirlenmesi amaçlandı. Bu çalışmada Fırat Üniversitesi, Tıp Fakültesi Patoloji A.D. Laboratuvarından temin edilen 38 parafin bloktaki servikal kanser örneği kullanıldı. Örneklerin HPV pozitifliği real time-PCR yöntemi ile belirlendi. Daha sonra, HPV pozitif olarak tespit edilen örneklerden HPV genotipleri pyrosequencing yöntemi kullanılarak belirlendi. Real time-PCR sonucunda, 38 adet örneğin 35'inde (%92) HPV DNA pozitif saptandı. HPV DNA pozitif örneklerin 26'sında HPV 16 (%68.42), 2'sinde HPV 18 (%5.26) tespit edildi. Bir örnekte HPV 16 ve HPV 18'in süper enfeksiyonu (%2.63), 5 örnekte HPV 16 ve HPV 16 Africian subtip süper enfeksiyonu (%13.15) ve bir örnekte ise HPV 16 ile HPV 33 süper enfeksiyonu (%2.63) bulundu. Bu sonuçlara göre HPV 16 ve HPV 18 enfeksiyonlarının servikal kanserin en önemli etkeni olduğu gösterildi. Pyrosequencing yöntemi ile HPV genotiplerinin belirlenmesi diğer klasik DNA dizi analizi yöntemlerine göre kolay ve ucuzdur. Bu nedenle, rutin laboratuvarda HPV genotiplendirme için pyrosequencing yöntemini önermekteyiz.

Özet (Çeviri)

Cervical cancer is the second most common type of cancer in women after breast cancer. Human papillomavirus (HPV) is considered as the primary etiologic agent of cervical cancer. HPV types is categorized according to the epidemiological relationships and genotypes of HPVs. According to analysis of genome sequences of HPVs, HPV genotypes more than 100 have been identified. The molecular tests using for detection of HPV genotypes are very important for the detection of vaccine strategy and epidemiological purpose. The pyrosequencing method is one of the new method using for HPV genotypes. In this thesis, detection of HPV genotypes were aimed by pyrosequencing method in patients with uterine cervical cancer. For this study, 38 paraffin-embedded cervical cancer samples obtained from Department of Pathology, Faculty of Medicine, Firat University were used. The presence HPV DNA in samples were determined by real time-PCR. Then, HPV genotypes were determined from HPV DNA positive samples using pyrosequencing method. According to the results of real time-PCR, 35 (92%) of 38 samples were found as positive for HPV DNA. In the result of pyrosequencing method, of 35 HPV DNA positive samples HPV 16 in 26 (68.42%), HPV 18 in 2 (5.26%) were detected. In one sample, HPV 16 and HPV 18 super-infection (2.63%). In other one sample, HPV 16 and HPV 33 super-infection (2.63%) were detected. HPV 16 ve Africian subtip süper enfeksiyonu (%13.15) were detected fron in 5 samples. According to these results, HPV 16 and HPV 18 were shown to be the most important genotypes. Identification of HPV genotypes with pyrosequencing is cheaper and easier as compared to other methods such as classic nucleotite sequensing method. Thus, we suggest to use pyrosequencing method for genotyping in routine laboratories.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    846007

    Investigation of the regulation of LKB1 and STING genes in gynecologic cancers

    Jinekolojik kanserlerde LKB1 ve STING genlerinin düzenlenmesinin araştırılması

    BAHRA NAJİ HAMA SALİH

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2024

    BiyolojiTokat Gaziosmanpaşa Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ERCAN ÇAÇAN

  2. Tez No

    634253

    Postmenopozal kanamalı hastalarda transvajinal sonografide ölçülen endometrium kalınlığı ile histopatolojinin karşılaştırılması

    Comparison of eendometrial thickness measured with transvaginal sonography and histopathology results in postmenopausal bleeding ppatients

    TAYFUN VURAL

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    1997

    Kadın Hastalıkları ve DoğumSağlık Bakanlığı

    Kadın Hastalıkları ve Doğum Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. OYA GÖKMEN

  3. Tez No

    704983

    Uterin serviks kanserinde operasyon öncesi PET/ BT ve MRG görüntülemelerindeki lenf nodu pozitifliği ile operasyon sonrası patolojı sonuçlarında tespit edilen lenf nodu metastazının retrospektif olarak karşılaştırılması

    Retrospective comparison of lymp node position in pre-operational PET/CT and mri imaging and lymph node metastasis detected in post-operational pathology results in uterine cervical cancer

    ÜNZÜLE KORKMAZ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    Kadın Hastalıkları ve DoğumAkdeniz Üniversitesi

    Kadın Hastalıkları ve Doğum Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. TAYUP ŞİMŞEK

  4. Tez No

    428842

    Servikal neoplazik süreçte laminin-5Y2 ve P16 (INK4A) ekspresyonu ve sağkalım ile ilişkisi

    Laminin-5Y2 ve P16 (NIK4A) expression in cervical neoplasic process and relation with survival

    ENES TAYLAN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    Kadın Hastalıkları ve DoğumEge Üniversitesi

    Kadın Hastalıkları ve Doğum Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AHMET AYDIN ÖZSARAN

  5. Tez No

    598852

    Preoperatif endometrial hiperplazi saptanan ve histerektomi yapilan hastalarda postoperatif endometrial kanser sıklığının saptanması

    Preoperatif endometrial hiperplazi saptanan ve histerektomi yapilan hastalarda postoperatif endometrial kanser sıklığının saptanması

    PINAR KADİROĞULLARI

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2012

    Kadın Hastalıkları ve DoğumSağlık Bakanlığı

    Kadın Hastalıkları ve Doğum Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ÖZHAN ÖZDEMİR

Geri Dön