Geri Dön

İstanbul Tıp Fakültesi hastanesinde izole edilen karbapenemlere dirençli gram-negatif enterik çomaklarda antibiyotik direnç oranları, mekanizmaları ve antibiyotik direnç gelişimine neden olan risk faktörlerinin araştırılması

Evaluation of risk factors leading to development of antibiotic resistance, ratios and mechanisms of antibiotic resistance in carbapenemase-resistant GRAM negative enteric bacilli cultured in İstanbul Medical Faculty

PDF İndir

  1. Tez No: 447265
  2. Yazar: ASİYE YİR
  3. Danışmanlar: PROF. DR. ARİF ATAHAN ÇAĞATAY
  4. Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
  5. Konular: Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon Hastalıkları, Clinical Microbiology and Infectious Diseases
  6. Anahtar Kelimeler: Karbapenemaz, NDM, OXA-48, Gram-negatif enterik çomak, RAPD PCR, Carbapenemase, NDM, OXA-48, Gram-negative enteric rods, RAPD PCR
  7. Yıl: 2016
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: İstanbul Üniversitesi
  10. Enstitü: Tıp Fakültesi
  11. Ana Bilim Dalı: Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 79

Özet

1 Ocak 2013- 31 Aralık 2015 tarihleri arasında İstanbul Üniversitesi İstanbul Tıp Fakültesi servislerinde en az 48 saat süreyle yatan 18 yaş üstü hastalardan infeksiyon etkeni olarak disk difüzyon yöntemi ile ertapenem ve/veya imipenem, meropeneme dirençli Gram-negatif enterik çomak (GNEÇ) izole edilen 94 hastanın laboratuvar, klinik bilgileri ve risk faktörleri kaydedildi. Hastane infeksiyonları Centers for Diseases Control and Prevention (CDC) tanımlamalarına göre belirlenmiştir. İzole edilen suşlarda fenotipik yöntemlerden MHT ile karbapenemaz varlığı araştırıldı. Karbapeneme direnç enzimlerinden karbapenemaz ve metallobetalaktamaz varlığını araştırmak için moleküler yöntemlerle karbapenem direncinden sorumlu genler ve klonal ilişki araştırıldı. Dünyada en yaygın olarak saptanan OXA-48, NDM, KPC, IMP ve VIM direnç genlerinin varlığını tespit için klasik Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PCR) yöntemi kullanıldı. İzole edilen suşlar arasındaki klonal ilişkiyi değerlendirmek için RAPD PCR yöntemi kullanıldı. Çalışmaya 79 tane Klebsiella pneumoniae, 8 tane Escherichia coli, 6 Enterobacter aerogenes ve 1 adet Serratia marcescens suşu alındı. Çalışmaya alınan 94 suş kan (46, %48.9), endotrakeal aspirat (15, % 15.96), dren (7, % 7.4), balgam (6, % 6.4), yara (5, % 5.3), idrar (4, % 4.25), apse (4, % 4.2), batın sıvısı (4, % 4.2), doku (2, % 2.1), plevral sıvı (1, % 1.06) olmak üzere pek çok klinik örnekten izole edilmiştir. OXA-48 direnç geni pozitifliği 74 (% 78.7) suşta saptanırken, NDM pozitifliği ise sadece 9 (% 9.5) suşta saptanmıştır. 1, 75 ve 107 no' lu suşlarda OXA-48 ve NDM pozitifliği bir arada saptanmıştır. 14 tane suşta PCR yöntemi ile bakılan OXA-48, NDM, KPC, IMP ve VIM genlerinden herhangi birinin pozitifliği saptanmamıştır. PCR deneyleri sonucunda tüm suşlarda beta-laktamaz üretiminden sorumlu KPC, IMP ve VIM gen bölgeleri negatif bulunmuştur. Hastanemizde karbapeneme dirençli GNEÇ ile infeksiyon etkeni olarak sık karşılaşılmaktadır. Birçok hastada infeksiyon etkeni olarak saptamadan once bu mikroorganizmalarla asemptomatik kolonizasyon gelişmektedir. Çalışmamızda karbapeneme dirençli bakteri üremesi saptanmasından önceki dönemde geniş spektrumlu antibiyotik maruziyetinin olduğu ve çoğunun karbapenem grubu antibiyotik kullandığı tespit edilmiştir. Uygunsuz antibiyotik kullanımı antibiyotik direncini tetikleyen en önemli faktördür. Empirik antibiyotik kullanımından endikasyonlar dışında kaçınılmalı, kültür sonuçlarına göre de-askalasyon yapılmalı, pre-operatif başlanan antibiyotik profilaksilerinin uygun şekilde sonlandırılması ve takibi yapılmalı, gereksiz kombinasyon tedavisinden kaçınılmalı ve antibiyotik tedavisi mümkün olan en kısa sürede kesilmelidir.

Özet (Çeviri)

The study recorded the laboratory clinical data and risk factors of 94 patients from whom ertapenem, imipenem and meropenem resistant Gram-negative enteric rods have been cultured. Between 01.01.2013 and 31.12.2015, among the patients older than age 18 who were internalized in Istanbul University, Istanbul Faculty of Medicine clinics for at least 48 hours. Hospital infections were identified by using the definitions of Centers of Diseases Control and Prevention (CDC). Isolated strains were evaluated for the presence of carbapenemeses by using Modified Hodge's Test, a phenotypic technique. To evaluate the presence of carbapenemases and metallo beta-lactamases, the genes responsible for carbapeneme resistance and clonal relationships were researched. Classical polymerase chain reaction method (PCR) was used to evaluate the most globally frequent resistance genes OXA-48, NDM, KPC, IMP and VIM. PAPD PCR technique was used to evaluate the clonal relationships among the isolated strains. 79 Klebsiella pneumoniae, 8 Escherichia coli, 6 Enterobacter aerogenes and 1 Serratia marcescens strains were studied. These total 94 strains in this study were isolated from a wide variety of clinical samples including blood (46, %48.9), endotracheal aspirates (15, &15.96), samples from drainage catheters (7, %7.4), sputum (6, %6.4), samples from wounds (5, %5.3), urine (4, %4.25), samples from abscesses (4, %4.2), peritoneal fluid (4, %4.2), tissue samples (2, %2.1) and pleural fluid (1, %1.06). 74 strains (%78.7) were positive for OXA-48 resistance gene whereas NDM positivity was detected in only 9 strains (%9.5). The strains numbered 1, 75 and 107 were both OXA-48 and NDM positive. 14 strains weren't detected positive for any of OXA-48, NDM, KPC, IMP and VIM, which were evaluated by using PCR. All of the strains were negative for KPC, IMP and VIM gene loci responsible for beta-lactamase production. Carbapeneme-resistant Gram-negative rods are frequently encountered as infectious causes in our hospital. A lot of patients develop colonisation with these microorganisms before they cause infection. In our study, we detected that most patients were exposed to broad spectrum antibiotics, most of them being treated with carbapenems, before a carbapenem-resistant organism could be cultured. Improper antibiotic usage is an important factor that triggers carbapenem resistance. Empirical antibiotic usage should be avoided except its indications, de-escalation process should be done according to the culture results, preoperative antibiotic prophylaxes should be properly followed and terminated, unnecessary antibiotic combinations should be avoided and antibiotic treatment should be stopped as soon as possible.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    445283

    Kan kültürlerinden izole edilen pseudomonas cinsi bakterilerde metallobetalaktamaz varlığının araştırılması

    Detection of metallo-betalactamase in carbapenem resistant pseudomonas strains that are i̇solated from the blood cultures

    FADİME YILMAZ YÜCEL

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    Mikrobiyolojiİstanbul Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. FATMA KÖKSAL ÇAKIRLAR

  2. Tez No

    236706

    Nonfermentatif gram negatif çomaklarda metallo-beta-laktamazların araştırılması

    Investigation of metallo-beta-lactamases in nonfermenting gram-negative bacilli

    MEHMET BERFE CANBERK

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2009

    Mikrobiyolojiİstanbul Üniversitesi

    Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ARİF KAYGUSUZ

  3. Tez No

    447290

    Karbapeneme dirençli klebsiella pneumoniae suşlarında direnç genleerinin belirlenmesi ve direnç plazmitlerinin polimeraz zincir reaksiyonu temelli replikon tiplendirmesi

    Characterization of resistance genes and polymerase chain reaction based replicon typing in carbapenem resistant klebsiella pneumoniae, department of clinical microbiology

    FATMA ERDEM

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    Mikrobiyolojiİstanbul Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ZERRİN AKTAŞ

  4. Tez No

    194113

    Genişlemiş spektrumlu beta laktamaz oluşturan E.coli ve Klebsiella suşlarında izoelektrik fokuslama yöntemi ile beta laktamaz tiplerinin saptanması ve plazmid profil analizi

    Detection of beta lactamase types of extended spectrum beta lactamase producing E.coli and Klebsiella spp by method for isoelectric focusing and plasmid profile analysis

    LÜTFİYE ÖKSÜZ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2005

    Mikrobiyolojiİstanbul Üniversitesi

    Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. NEZAHAT GÜRLER

  5. Tez No

    427087

    Kan kültürlerinden izole edilen enterobacteriaceae üyelerinde karbapenemaz varlığı ve tiplerinin araştırılması

    Investigation of the presence and types of carbapenemase in enterobacteri̇aceae strains isolated from blood cultures

    VİCDAN ŞEMEN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    Mikrobiyolojiİstanbul Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ÖMER KÜÇÜKBASMACI

Geri Dön