Geri Dön

Türkiye'de yayılış gösteren muscari mill. cinsine ait türlerin filogenetik ilişkisinin kloroplast dna bölgeleri kullanılarak belirlenmesi

Determination of phylogenetic relationships of muscari mill. species in Turkey using chloroplast dna regions

  1. Tez No: 450438
  2. Yazar: OKTAY YİĞİT
  3. Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. AYTEN DİZKIRICI TEKPINAR
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Filogeni, matK, Muscari, trnL intron, trnL-F trnT-L, Muscari, matK, phylogeny, trnT-L, trnL intron, trnL-F
  7. Yıl: 2016
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Yüzüncü Yıl Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 98

Özet

Muscari Mill. (Asparagaceae) cinsi Dünya'da yaklaşık 48 (Govaerts, 2016),ülkemizde 35 tür ile temsil edilmektedir (Yıldırım, 2016). Bugüne kadar bu cins ile ilgili yapılan çalışmalar, Muscari türlerinin evrimsel ilişkilerini anlamak için yeterli olmamıştır. Tez çalışmamızda Muscari türleri arasındaki evrimsel ilişkiyi anlayabilmek için morfolojik karakterler ile moleküler teknikler beraber kullanılmıştır. Toplanan örnekler morfolojik karakterler kullanılarak teşhis edilip isimlendirilmiş ve moleküler çalışmalarda kullanabilmek için CTAB metoduyla total DNA izolasyonları yapılmıştır. Morfolojik karakterler olarak soğan tunik rengi, yaprak sayısı, yaprak özellikleri ve diğer çiçek özellikleri gibi karakterler kullanılmıştır. Moleküler çalışmalar için ise kloroplast DNA'dan seçilmiş bölgelerin (trnT-L IGS, trnL intron, trnL-F IGS ve matK) DNA dizileri kullanılmıştır. Ülkemizde bulunan Muscari cinsine ait 32 türün morfolojik özellikleri yeniden betimlenmiş ve bu türlerin doğal habitatları sunulmuştur. Kullanılan bölgeler içerisinde en fazla varyasyon gösteren bölge matK bölgesidir. Transkripsiyona uğrayan bölge olmasına rağmen kullanılan bölgeler içerisinde en yüksek varyasyona sahip olması şaşırtıcıdır. Muscari türleri arasındaki filogenetik ayrımı en az yapan bölgenin trnL intron olduğu görülmüştür. trnT-L IGS, trnL-F IGS ve matK bölgeleri benzer filogenetik ilişkileri göstermiştir. Moleküler verilere dayanarak hernekadar Muscari cinsinin monofiletik olduğunu söyleyebilsekte, alt cins bazında bunu söylemek mümkün görünmemektedir. Botryanthus alt cinsine ait türler iki ana atadan türemişlerdir.

Özet (Çeviri)

Genus Muscari Mill. (Asparagaceae) is represented with approximately 48 species in the world (Govaerts, 2016) and 35 species in Turkey (Yıldırım, 2016). Studies related with this genus are not enough to understand evolutionary relationships of Muscari species. In this study, morphological characters and molecular techniques were used together to find out evolutionary relationships between the species of Muscari genus. Collected samples were identified by using morphological characters and for molecular studies total DNA isolations were done with CTAB method. Bulb tunic colour, leaf number, leaf characteristics and other features of flower were used as morphological characters. DNA sequences of selected regions (trnT-L IGS, trnL intron, trnL-F IGS and matK) from chloroplast DNA were used for molecular studies. Morphological characters of 32 Muscari species found in Turkey were described again and natural habitats of them were represented. The most variable region within used ones was matK. Even though it is a transcribed region, it is suprising to see that it had the highest variation among used regions. It was seen that the least phylogenetic discrimination among Muscari species was observed when trnL intron region was used. trnT-L IGS, trnL-F IGS and matK regions showed similar phylogenetic relationships. Based on molecular outcomes, Muscari genus can be described monophyletic. However, the argument can not be claimed on the subgenus level. Species belonging to Botryanthus subgenus derived from two common ancestor.

Benzer Tezler

  1. Bazı Muscari mill. türlerinin karyolojik yönden incelenmesi

    Some Muscari mill. kariological examination of species

    LEYLA YILDIRIM

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    BiyolojiFırat Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. YAŞAR KIRAN

  2. Türkiye'de yayılış gösteren Muscari mill. (Asparagaceae) cinsi taksonlarına ait morfoloji, palinoloji ve tohum yüzeyi araştırmaları

    Morphology, palinology and seed surface researches on the taxa of genus Muscari mill. (Asparagaceae) spreads in Turkey

    HÜSEYİN EROĞLU

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    BotanikVan Yüzüncü Yıl Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ SÜLEYMAN MESUT PINAR

  3. Türkiye'de yayılış gösteren endemik Muscari aucheri (boiss.) baker ve Muscari discolor boiss. ve Hausskn türlerinin anatomik özellikleri

    The anatomical characteristics of endemics Muscari aucheri (boiss.) baker and Muscari discolor boiss. and Hausskn species distributed in Turkey

    RABİA AÇIKGÖZ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2007

    BiyolojiSelçuk Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MUSTAFA KÜÇÜKÖDÜK

  4. Türkiye'de doğal yayılış gösteren Muscari aucheri (Boiss.) Baker (Asparagaceae) türüne ait popülasyonların genetik analizleri

    Genetic analyses of populations of the species Muscari aucheri (Boiss.) Baker (Asparagaceae) showing natural distribution in Turkey

    AQSA AWAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    BiyolojiSelçuk Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. MERYEM BOZKURT

  5. Muscari mirum speta (Asparagaceae) ve yakın akrabaları (Muscari massayanum grunert, Muscari tenuiflorum tausch ve Muscari latifolium kirk)'nın morfolojik, anatomik ve ekolojik özellikleri

    Morphological, anatomical and ecologigal features of Muscari mirum speta (Asparagaceae) and it's allied (Muscari massayanum grunert, Muscari tenuiflorum tausch and Muscari latifolium kirk) species

    MURAT GÜRSOY

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    BiyolojiCelal Bayar Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. LEVENT ŞIK