Geri Dön

Meme kanserinde epigenetik değişim gösteren genlerde metilasyon paternlerinin bisülfid sekanslama yöntemiyle belirlemesi

Investigation of methylation patterns in epigenetically effected genes in breast cancer

  1. Tez No: 452954
  2. Yazar: SHOHREH ALİZADEH SHARGH
  3. Danışmanlar: PROF. DR. MERAL SAKIZLİ
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Genetik, Genetics
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2012
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Dokuz Eylül Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 254

Özet

Meme kanseri, Dünya Sağlık Örgütü (WHO) verilerine göre, en sık görülen kanser tipidir.Bu çalişmanın amacı; meme karsinogenezinde önemli rollerinin olduğu gösterilmiş olan, GSTP1 ve E-cadherin genlerin ekspresyon düzenleyici bölgelerinde bulunan CpG adalarının metillenme profillerinin, tümörlerün özellikleri ile ilişkilenrilimesidir.Hipotezimiz; GSTP1 ve E-cadherin genlerinin ifadelenmesinde DNA metillenmesinin değişebileceği ve bu farklılıkların meme kanserinin özelliklerini etikileyebileceğidir.Çalışmaya, Meme kanseri tanısı almiş 50 tümör örneği ile, aynı hastalara ait 50 adet çevre normal doku örneği, rastgele örnekleme yöntemiyle alınmiştır (patoloji Anabilim Dalı, türkiyenin 9 eylül üniversitesi hastanesinin arşivinde tarama ile). DNA izolasyonundan sonra, sodiyum bisülfit sekanslama yöntemiyle GSTP1 ve E-cadherin promotöründe CpG adacıkları belirlenerek, tümörün derecesi ve diğer kanser parametreleriyle ilişkileri `x2 korelasyon' analizleri ile yorumlanmıştır.Bu çalışmada meme kanserinde E-cadherin geninin promotör bölgesinde metillenme sıklıği %94 ve GSTP1 geninin promotörsinde % 41.3 bulundi.E-cadherin geni için tümör örneklerinin, % 44.0'ü( 50 örnekten,22'si), tam metillenmiş, % 50'si kısmen ( 50 örnekten, 25'i) ve % 6.0'I ( 50 örnekten, 3'tanesi) metillenmemiştir. Metillenme olayı tümör ve normal örneklerin arasında, anlamlı şekilde farklı gözlenmiştir. Tam olarak meme kanser dokuların % 94'ünde metillenme gözlenmiştir. Ayrıca normal meme dokuların % 76'sı ( 50 örnekten, 38'i) metillenmemiştir.GSTP1 geni için tümör örneklerinde % 28.3'ü (13 örnek 46 örnekten) tam metillenmiş, % 13'ü (6 örnek 46 örnekten) kısmen ve % 58.7'i (27 örnek 46 örnekten) metillenmemiştir. Ayrıca normal meme dokularında genellikte örneklerin % 87.2'i metillenmemiştir ve % 12.8'inda kısmen metillenme gözlenmiştir. Metillenme olayı tümör ve normal meme dokuların arasında anlamlı derecede farklıdır (p= 0.000).

Özet (Çeviri)

The purpose of this study was determining the role of GSTP1 and E-cadherin genes in breast tumorogenesis that their importance in breast cancer is established. Also it was shown that E-cadherin and GSTP1 genes are methylated then the methylation relationship with tumor?s features is evaluated. The hypothesis of the study is that GSTP1 and E-cadherin genes methylation is related to tumor?s features . 50 established breast cancer samples and 50 of their adjacent normal samples were obtained with random sampling method from pathology department archieve of 9 eylul university of Turkey . After isolation of DNA, sodium bisulfite sequencing was performed in promoter regions and the comparison between tumor and normal samples was made, the relationship with tumor?s grade, stage ,? is analyzed by x2 correlation and regression programs.In E-cadherin gene, for tumor samples of 44% ( 22 in 50) were full metyhlated, 50% partial ( 25 in 50) and 6.0% (3 in 50) were non- methylated. The methylation status shows meaningful differentiation between tumor and normal samples. Generally , 94% of tumor samples were full methylated and of normal samples 76% ( 38 in 50) were non-methylated.In GSTP1 gene, for tumor samples of 28.8% (13 in 50) were full methylated, 13% (6 in 46) partial and 58.7% ( 27 in 50 ) were non-methylated. In general, from normal samples there were 87.2% non-methylated and partial methylation has seen in 12.8% of samples. There is meaningful difference in methylation status between tumor and normal samples (p=0.000).

Benzer Tezler

  1. Tez No

    324204

    Meme kanserlerinde epigenetik değişim gösteren genlerde metilasyon paternlerinin bisülfid sekanslama yöntemiyle belirlenmesi

    Investigation of methylation patterns in epigenetically effected genes in breast cancers by

    SHOHREH ALİZADEHSHARGH

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2012

    GenetikDokuz Eylül Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MERAL SAKIZLI

  2. Tez No

    595793

    Meme kanserinde histon 4 lizin 20 üçlü metillenmesinin (h4K20ME3) öneminin araştırılması

    Investigation of histone 4 lysine 20 triple methylation (h4K20ME3) in breast cancer

    HÜSNİYE IŞIN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    Tıbbi Biyolojiİstanbul Üniversitesi

    Temel Onkoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. UĞUR GEZER

  3. Tez No

    314482

    Meme kanserinde GASC1 ekspresyonu

    GASC1 gen expretion in breast cancer

    BAHRİ ÇAKABAY

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2012

    Genel CerrahiAnkara Üniversitesi

    Genel Cerrahi Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SANCAR BAYAR

  4. Tez No

    833507

    DNA methylation profiling of ING1 gene in triple negative breast cancer

    Üçlü negatif meme kanserinde (ÜNMK) ıng1 geninin DNA metilasyon profilinin belirlenmesi

    ALAA ANWER EZZAT EZZAT

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2023

    BiyolojiGaziantep Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. IŞIK DİDEM KARAGÖZ

  5. Tez No

    433158

    Sitrat transport protein inhibisyonunun meme kanseri hücreleri üzerine olan etkilerinin araştırılması

    Investigating the effects of the inhibition of citrate transport protein on breast cancer cells

    ALİ BURAK ÖZKAYA

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    BiyokimyaEge Üniversitesi

    Tıbbi Biyokimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HİKMET HAKAN AYDIN

Geri Dön