Çeşitli meme kanseri hücre hatlarında apobec3b ve apobec3g genlerinin ifade düzeyinin analizi ve mutasyon taraması
Investigation of apobec3b and apobec3g genes' expression levels and mutations in different breast cancer cell lines
- Tez No: 455239
- Danışmanlar: DOÇ. DR. MEHRİ İĞCİ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Tıbbi Biyoloji, Medical Biology
- Anahtar Kelimeler: APOBEC3B-3G, meme kanseri, QRT-PCR, RT-PCR, mutasyon tarama, APOBEC3B-3G, breast cancer cell lines, qRT-PCR, RT-PCR, Expression level, Screening Mutaion, substitution mutation
- Yıl: 2016
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Gaziantep Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 99
Özet
APOBEC enzimleri bağışıklıkta önemli oyunculardır ve kanserleşmeye katkıda bulunabilir. APOBEC3B ve APOBEC3G, sitidini üridine dönüştürerek DNA ve RNA'da mutasyona yol açan sitidin deaminazlara mensuptur. Biz bu çalışmada dört meme kanseri hücre hattında (SK-BR-3, MCF-7, MDA-MB-231 ve CRL-2329) qRT-PCR kullanarak APOBEC3B ve APOBEC3G ifadelenme seviyelerini araştırdık ve gen dizileme kullanarak mutasyon analizi gerçekleştirdik. APOBEC3B MDA-MB-231'de yüksek derecede ifadelenmesine rağmen istatiksel olarak önemli bulunmamıştır (p>0.05). APOBEC3G CRL-2329' da yüksek derecede ifadelenmiştir ancak o da istatiksel olarak önemli bulunmamıştır (p>0.05). Ayrıca MDA-MB hücre hattında (c.239A> G) ve SK-BR hücre hattında (c. 492A> C) olmak üzere APOBEC3B geninde iki yer değiştirme mutasyonu tespit edilmiştir. APOBEC3G'de mutasyon bulunmamıştır. APOBEC3B ve APOBEC3G'nin moleküler mekanizmasının anlaşılması hastalıkların moleküler özellikleri hakkında kesin bilgi verebilir ve meme kanserlerindeki mutasyonun yeni kaynakları hakkında önemli bilgiler elde edilmesini sağlayabilir.
Özet (Çeviri)
APOBEC enzymes are important players in immunity and may contribute to carcinogenesis. APOBEC3B and APOBEC3G belong to cytidine deaminases that able to mutate DNA and RNA by converting cytidine to uridine. We investigated the expression levels of APOBEC3B and APOBEC3G in four breast cancer cell lines (SK-RB-3, MCF7, MDA-MB-231, CRL 2329) using qRT-PCR and gene sequencing to detect mutation. APOBEC3B was highly expressed in MDA-MB-231, however, statistically not significant (p > 0,05). APOBEC3G was highly expressed in CRL 2329, however, no significance was found (p > 0,05). Also, two substitution mutations in APOBEC3B were detected which are (c.239A> G) in MDA-MB cell line and (c. 492A> C) in SK-BR cell line. No mutation was found in APOBEC3G. Understanding the molecular mechanisms of APOBEC3B and APOBEC3G; may give definitive knowledge about the molecular characteristics of the disease and have aided the crucial information about new source of mutation in breast cancers.
Benzer Tezler
- PDT ile kanser tedavisi için yeni ışığa duyarlımoleküller
Novel photosensitizing molecules for cancer therapy with PDT
TUĞBA KÜÇÜK
- Bazı meme kanseri ve lösemi hücre hatlarında timokinon ve bazı kemoterapötik ajan kombinasyonlarının TNF sinyal yolağı üzerine etkilerinin incelenmesi
Investigation of the impact of combinations of thymoquinone and some chemotherapeutic agents on tnf signaling pathway in some breast cancer and leukemia cell lines
MUSTAFA ÇAKIR
Yüksek Lisans
Türkçe
2016
OnkolojiErciyes ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HAMİYET ALTUNTAŞ
- BRCA1 mutant olan ve olmayan meme kanser hücre hatlarında wısp-1 geninin ekspresyonunun araştırılması
Investigation of expression of wisp-1 gene in BRCA1 mutant and non-mutant breast cancer cell lines
BEYZA AKIN MUTLU
Yüksek Lisans
Türkçe
2020
Biyolojiİstanbul ÜniversitesiTemel Onkoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HÜLYA YAZICI
- Investigating possible involvement of miR-125b in the E2, NF-кB network
E2, NF-кB sinyal ağında miR-125b'nin olası rolünün araştırılması
ESRA YAVUZ
Yüksek Lisans
İngilizce
2015
BiyolojiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. AYŞE ELİF ERSON BENSAN
- Understanding the interplay between anti-apoptotic BAG-1 and AKT in mTORC1-mediated autophagy in breast cancer cell lines
mTORC1 aracılı otofajide anti-apoptotik BAG-1-AKT etkileşiminin meme kanseri hücre hatlarında araştırılması
ILGIN IŞILTAN
Yüksek Lisans
İngilizce
2015
Biyolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. GİZEM DİNLER DOĞANAY