Geri Dön

Bruselloz tanısında iki farklı polimeraz zincirleşme yöntemini kullanımı

Two different pcr methods in the diagnosis of brucellosis

  1. Tez No: 455937
  2. Yazar: SABAHAT ÇEKEN
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. SEDAT KAYGUSUZ
  4. Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
  5. Konular: Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon Hastalıkları, Clinical Microbiology and Infectious Diseases
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2008
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Kırıkkale Üniversitesi
  10. Enstitü: Tıp Fakültesi
  11. Ana Bilim Dalı: Klinik Mikrobiyoloji ve Enfeksiyon Hastalıkları Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 70

Özet

Brusella cinsi bakterilerin neden olduğu bruselloz, pek çok ülkede olduğu gibi ülkemiz için de önemli bir halk sağlığı sorunu olan zoonozdur. Özgül olmayan şikayetler ve bulgularla seyreden hastalığın tanısında altın standart olan kültürde bakteriyi üretmek oldukça zor ve zaman alıcıdır. Rutinde daha sık kullanılan serolojik yöntemlerin ise diğer proteinlerle olan çapraz reaksiyonlardan dolayı özgüllüğü düşüktür. Polimeraz zincirleşme reaksiyonu (PZR) gibi moleküler yöntemler pek çok infeksiyon hastalığı gibi brusellozun erken ve hızlı tanısında iyi bir alternatif yöntem olmaktadır.Bu çalışmada, brusellozun erken tanısı ve maliyet etkinliği yönlerinden iki farklı PZR yönteminin konvansiyonel yöntemlerle karşılaştırılması amaçlandı.Çalışma, K.Ü.T.F. İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji A.D. polikliniğine başvuran bruselloz ön tanılı 35 hasta (Grup 1) ve 20 sağlıklı gönüllüden (Grup 2) oluşturuldu. Gruplardan serolojik çalışma (SAT, Coombs) için serum, PZR için tam kan (EDTA'lı tüplere) alınırken, hastalardan ateşli oldukları dönemde kan kültürleri alındı. Tam kan örneklerinden elde edilen lökosit pelletlerinden DNA izolasyonu yapıldı ve hem in house hem de real time PZR (RT-PZR) yöntemleriyle brusella DNA'sı çalışıldı.Grup 1'deki hastaların SAT değeri 1 olguda 1/80 iken, diğerlerinde ? 1/160 idi. Bunların 16'sında kan kültürü pozitif bulundu. Grup 2'de ise SAT değerleri negatif idi. Nested PZR yöntemiyle yapılan çalışmada hastaların %97'sinde, RT-PZR `de ise % 57 oranında pozitiflik saptanırken, her iki yöntemde de kontrollerin hepsi negatif bulundu. Her iki yöntemde de özgüllük % 100 bulunurken, RT-PZR'de duyarlılığın düşük olmasının kullanılan farklı primerlere veya ekstraktların saklama şartlarına bağlı olabileceği düşünüldü. Kullanılan nested PCR yönteminin erken ve hızlı tanıda yüksek duyarlılıkta olduğu, aynı şekilde RT-PZR'ye göre daha duyarlı ve ucuz olduğu; bu nedenle brusellozun erken ve doğru tanısı için kullanılmasının doğru olacağı sonucuna varıldı.

Özet (Çeviri)

Brucellosis is a public health problem in our country like many parts of the world. The illness is a zoonosis caused by Brucella spp. and has non specific symptoms and physical signs. Bacterial culture is gold standard in the diagnosis of brucellosis but it is difficult and time consuming, so serologic techniques are used routinely. But they have low specificity because of the cross reactions. Molecular methods like polymerase chain reaction (PCR) are good alternatives in the early and rapid diagnosis of brucellosis, like other infectious diseases.The aim of this study is to use two different PCR methods in diagnosis of brucellosis and compare their efficiency and cost with conventional methods.The study included 35 patients who referred to Kırıkkale University Medical Faculty, department of Infectious Diseases and Clinical Microbiology with symptoms and laboratory findings of brucellosis (Group-1) and 20 healthy volunteers (Group-2). Sera for serology (SAT, Coombs test) and whole blood samples (collected in tubes with EDTA) for PCR were collected from each subject in both groups and two blood cultures were done for all patients in Group-1. DNA was extracted from peripheral mononuclear cells obtained from the blood samples and in house and real time PCR assays were used to detect brucella DNA.SAT titers of patients in Grup-1 were ? 1/160 except one patient that was 1/80. Blood cultures were of 16 patients were positive. The SAT titers of Group-2 were negative. Thirty-four (97%) of the patients in Group-1 had positive nested PCR results, while 20 (57%) were positive with RT-PCR. None of the 20 volunteers in Group-2 were positive with both methods. The low sensitivity we found with RT_PCR may be partly explained by primer used or inadequate preservation of the leukocyte pellets (4 months at ?20°C) before RT-PCR assay. Nested PCR has high sensitivity and it has low-priced when compared with RT-PCR; therefore it may be used in rapid diagnosis of brucellosis.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    414879

    İnsan brusellozunun laboratuvar tanısında kullanılan serolojik testlerin değerlendirilmesi

    Used in evaluation of diagnostic serologi̇c laboratory tests of human brucellosi̇s

    EMİNE EMEL KOÇMAN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    MikrobiyolojiEge Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MEMNUNE SELDA ERENSOY

  2. Tez No

    303412

    Şüpheli bruselloz olgularının altı farklı yöntemle değerlendirilmesi

    Evaluation of suspected brucellosis patients with six different methods

    METİN YÜCE

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2010

    MikrobiyolojiYüzüncü Yıl Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. GÖRKEM YAMAN

  3. Tez No

    340938

    Bruselloz ve atipik pnömoni şüpheli hastalarda coxıella burnetıı antikor varlığının ELISA ve IFA yöntemleri ile araştırılması

    Detection of coxiella burnetii antibodies in patients with suspicion of brucellosis and atypical pneumonia by ELISA and IFA methods

    ALEV ÇETİN DURAN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    MikrobiyolojiDokuz Eylül Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. CEM ERGON

  4. Tez No

    787786

    Sayısal haritalama teknikleri kullanılarak DNA dizilimleri üzerinden lösemi hastalığının temel türlerinin yapay zeka tabanlı algoritmalar ile sınıflandırılması

    Classification of main types of leukemia disease with artificial intelligence-based algorithms on the DNA sequences using digital mapping techniques

    FATMA AKALIN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve KontrolSakarya Üniversitesi

    Bilgisayar Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NEJAT YUMUŞAK

  5. Tez No

    230194

    Şanlıurfa ilindeki risk gruplarında brusellozisin seroprevalansı ve tanıda kullanılan serolojik yöntemlerin karşılaştırılması

    Seroprevalance of brucellosis among risk groups in şanliurfa and comparison of appleid serological tests

    İBRAHİM HALİL ŞAHİN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2008

    MikrobiyolojiHarran Üniversitesi

    Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. FADİLE YILDIZ ZEYREK

Geri Dön