Erwinia amylovora EAKKB29 izolatının harpin geninin klonlanması ekspresyonu ve altındane ekmeklik buğday (Triticum aestivum L.) fideleri üzerinde etkilerinin araştırılması
Cloning, expression of harpin gene from a Erwinia amylovora EAKKB29 isolate and studying its effect on wheat (Triticum aestivum L.) seedlings
- Tez No: 456273
- Danışmanlar: PROF. DR. ALİ OSMAN BELDÜZ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2017
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Karadeniz Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 74
Özet
Harpin doğal olarak meydana gelen bakteriyel içerikli bir proteindir. Bitkinin doğal savunma mekanizmasını harekete geçiren harpin, ilk defa bakteriyel patojen olan Erwinia amylovora'dan izole edilmiştir.Bu çalışmada, Erwinia amylovora EAKKB29 hrpN geninin klonlanmasını, gen ürününün izolasyonunu ve Triticum aestivum bitkisi üzerine etkilerini konu almaktadır. hrpN geninin 1200 nt' lik baz dizini belirlenerek, pET-28a(+) ve pET-20b(+) vektörlerine klonlandı. Gen, E.coli BL21 hücresinde, ekspres edildi ve saflaştırıldı. Harpin proteininin moleküler ağırlığı 40 kDa olarak tespit edildi. Saflaştırılan HrpN(Ea)E, HrpN(Ea)E-His, HrpN(Ea)I ve HrpN(Ea)I-His proteinlerinin Triticum aestivum bitkisinin yaprak ve kök uzunluğuna, bitkinin kuru ve yaş ağırlığına etkileri araştırıldı. HrpN(Ea)I proteininin Triticum aestivum bitkisinde en iyi etkiyi gösterdiği belirlendi. Triticum aestivum fideleri üzerine en etkili konsantrasyonun 300 μl (4,5 μg) olduğu, 900 μl (13,5 μg)' den sonraki konsantrasyonlarda ise etkinin azaldığı tespit edildi.
Özet (Çeviri)
Harpin, occured naturally, is a bacterial based protein. Harpin, which mobilezes the natural defense mechanism of the plant, has been isolated from bacterial pathogen Erwinia amylovora.This study is about cloning of Erwinia amylovora EAKKB29 hrpN gene, isolation of its gene product and its effects on Triticum aestivum plant. Having defined the base sequencing of 1200 nt gene, which coding hrpN gene, was cloned to pET-28a(+) and pET- 20b (+) vectors. Clones were transformod to E.coli BL21, and expression was performed and Harpin protein was purified. The molecular weight of Harpin protein was determined as 40 kDa, effects of prufied HrpN(Ea)E, HrpN(Ea)E-His, HrpN(Ea)I and HrpN(Ea)I-His proteins on leaf length, root length, dry weight and wet weight of Triticum aestivum shoots were studied. HrpN(Ea)I was found the most effective one. The most effective concentration of it was determined as 300μl (4,5 μg). Over 900 μl (13,5 μg) applications have reducing effects on studied parameters.
Benzer Tezler
- Iğdır ilinde elma (Malus domestica L.) çeşitlerinin ateş yanıklığı (Erwinia amylovora (Burr.) Winslow et al.,). hastalığına karşı duyarlılık düzeylerinin araştırılması
The investigation of the susceptibility levels against fire blight disease (Erwinia amylovora (Burr.) Winslow et al.,) on apple (Malus domestica L.) in Iğdır
AYDIN KAYA
Yüksek Lisans
Türkçe
2020
ZiraatIğdır ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ MESUDE FİGEN YEŞİLDAĞ
PROF. DR. İRFAN ÇORUH
- Erwinia amylovora'ya dayanıklı elma çeşitlerini ve genotiplerini belirleyebilmek için erken seleksiyona olanak sağlayacak bir belirteç tespiti çalışması
A molecular marker identification study to allow early selection to identify apple varieties and genotypes resistant to Erwinia amylovora
ŞAHİN KAYA
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
BiyoteknolojiAtatürk ÜniversitesiTarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. EMİNE ORHAN
- Erwinia amylovora'ya karşı in vitro ve in vivo koşullarda bazı kimyasalların bitki ekstraktlarının ve antagonistlerin etkileri
Başlık çevirisi yok
ESİN HACIOĞLU
- Farklı konukçulardan elde edilen erwinia amylovora izolatlarının protein profillerinin virülenslik seviyeleri ile ilişkilerinin araştırılması
Investigation of the relationship between protein profiles and virulence levels of erwinia amylovora isolates obtained from different hosts
AYŞEGÜL GÜR
Doktora
Türkçe
2025
ZiraatSelçuk ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
PROF. DR. KUBİLAY KURTULUŞ BAŞTAŞ
- Erwinia amylovora enfeksiyonu sonucu farklı elma, armut ve ayva çeşitlerindeki konukçu protein miktarlarının belirlenmesi
Determination of quantities of host protein after infection with erwinia amylovora of different apple, pear and quince varieties
ŞERİFE ÇETİN
Yüksek Lisans
Türkçe
2014
ZiraatSelçuk ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. KUBİLAY KURTULUŞ BAŞTAŞ