Baş-boyun kanserine neden olan genlerin genefishing tekniği kullanılarak tanımlanması
Identification of genes contributing to head and neck cancer using genefishing technique
- Tez No: 458340
- Danışmanlar: PROF. DR. ALİ NUR TURGUT ULUTİN
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Genetik, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2017
- Dil: Türkçe
- Üniversite: İstanbul Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 110
Özet
Larenks kanseri dünya genelinde görülen baş-boyun kanserleri arasında en sık görülen 2. tiptir. Bu çalışmada larenks tümörlerinde farklı ifade edilen genleri saptamak için GeneFishing deneyi yaptık ve 27 farklı ifade edilen gen saptadık. Bunlardan iki tanesi PRR4 ve SLC22A23 genleridir. PRR4 proteini insan lakrimal bezin asiner hücrelerinde sentezlenir ve öküler yüzeyi ve ağız içini koruyan antimikrobiyal protein olarak işlev görmektedir. SLC22A23 ise; çeşitli dokularda birçok ilacın, ksenobiyotiklerin ve endojen metabolitlerin emilimi veya atılımından sorumlu olan organik iyon taşıyıcı ailesine aittir. SLC22A23 birçok dokuda ifade olmaktadır fakat substratı veya işlevi tanımlanmamıştır. SLC22A23 genindeki tek nükleotit polimorfizmleri bazı hastalıklar ve antipsikotik ilaçların atılımı ile ilişkilendirilmiştir. PRR4 ve SLC22A23 genlerinin larenks kanserindeki rolünü anlamak için, larenks tümör dokularında ve bu dokulara komşu normal dokularda gerçek zamanlı nicel polimeraz zincir tepkimesi ile bu genlerin ifade seviyelerini araştırdık. Aynı zamanda SLC22A23 genindeki bazı polimorfizmler (rs4959235, rs6923667, rs9503518) için genotipleme analizi yaptık. İfade analizi sonucunda; PRR4 gen ifadesinin 90 tümör dokusunun 65'inde (%72,2) normal dokuya kıyasla azaldığını ve SLC22A23 gen ifadesinin 83 tümörlü dokunun 46'sında (%55,4) normal dokuya kıyasla arttığını saptadık. SLC22A23'teki polimorfizmler için genotip analizi yapılan hastaların %77,2'sinin rs9503518 için AA genotipine sahip olduğunu ve bu hastaların daha çok histolojik derecesi 2 ve 3 tümörlere sahip olduğunu saptadık. Ayrıca rs9503518-AA genotipinin artmış SLC22A23 gen ifadesi ile ilişkili olduğunu tespit ettik. Yaptığımız bu çalışma sonuçları PRR4 ve SLC22A23 genlerinin larenks kanserinin gelişiminde önemli rolü olabileceğini göstermektedir.
Özet (Çeviri)
Larynx cancer (LC) is the second most common subtype in head and neck cancers. To identify differentially expressed genes (DEGs) in larynx tumors, we performed GeneFishing Assay and identified 27 DEGs. Two of these DEGs were PRR4 and SLC22A23 genes. The PRR4 protein is synthesized in the acinar cells of the human lacrimal glands and act as an antimicrobial protein protecting both the ocular surface and the oral cavity. SLC22A23 belongs to a family of organic ion transporters which are responsible for the absorption or excretion of many drugs, xenobiotics and endogenous compounds in a variety of tissues. SLC22A23 is expressed in various tissues but no substrates or functions have been identified for it. Single nucleotide polymorphisms which are located in SLC22A23 gene were associated with some diseases and the clearance of the antipsychotic drugs. To understand the role of the PRR4 and SLC22A23 genes in LC, we investigated their expression level in laryngeal tumor and adjacent non-cancerous tissue samples by qRT-PCR and genetic variations in SLC22A23 gene (rs4959235, rs6923667, rs9503518) were genotyped. We found that PRR4 expression was decreased in 65 of 90 tumor tissues (72.2%) and SLC22A23 expression was increased in 46 of 83 tumor tissues (55.4%) compared to normal counterparts. 77.2% of patients were homozygous for rs9503518-AA and they most frequently had histological grade 2 and 3 tumors. We also found that rs9503518-AA genotype is associated with increased SLC22A23 expression. Our results indicate that PRR4 and SLC22A23 may play an important role in the development of LC.
Benzer Tezler
- Larinks kanserinde MGMT promotör bölge metilasyon paterninin sağkalım, rekürrens ve kemoterapi duyarlılığı üzerine etkisi
MGMT promoter region methylation patern and its effect on survival, recurrence and chemosensitivity in laryngeal cancer
ÖZLEM ÖNERCİ ÇELEBİ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2013
Kulak Burun ve BoğazHacettepe ÜniversitesiKulak Burun Boğaz ve Baş-Boyun Cerrahisi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ALİ ŞEFİK HOŞAL
- Safran ekstratı olan krosetin'in baş-boyun kanser hücreleri üzerindeki etkisinin incelenmesi
Investigation of effect of crocetin extracted from saffron on head and neck cancer cell lines
BİLGE KALYONCU
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
GenetikTurgut Özal ÜniversitesiTıbbi Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ESRA GÜNDÜZ
- ALA-mediated photodynamic therapy and delivery of genes by novel polymers
ALA-aracılı fotodinamik terapi ve genlerin özgün polimerler ile taşınması
GÖZDE DEMİRCİ
Yüksek Lisans
İngilizce
2020
Polimer Bilim ve TeknolojisiKoç ÜniversitesiMalzeme Bilimi ve Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HAVVA YAĞCI ACAR
- PLGA-kurkumin nano-formülasyonunun kanser hücrelerinde NF-kB'nin p65 alt birimi düzeyi üzerindeki etkisinin incelenmesi
Investigation of the effect of PLGA-curcumin nano- formulation on the p65 sub-unit level of NF-kBb in cancer cell lines
ŞEYMA BULUT
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
BiyoteknolojiBezm-i Alem Vakıf ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ FATEMEH BAHADORİ
DOÇ. DR. PINAR OBAKAN YERLİKAYA
- Larenks kanseri olgularında HLA antijenlerinin dağılımı
The Distribution of HLA antigens in larynx cancer patients
ÖZLEM DALGIÇ
Yüksek Lisans
Türkçe
2000
OnkolojiTrakya ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ÇETİN ALGÜNEŞ