Acinetobacter baumannii OXPHOS inhibitörleri hakkında kuantum kimyasal ve QSAR çalışması
The quantum chemical and QSAR studies on Acinetobacter baumannii OXPHOS inhibitors
- Tez No: 461010
- Danışmanlar: PROF. DR. FATMA KANDEMİRLİ, YRD. DOÇ. DR. HAKAN SEZGİN SAYINER
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyomühendislik, Bioengineering
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2017
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Kastamonu Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Genetik ve Biyomühendislik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 82
Özet
Bir pleomorfik aerobik gram negatif basil olan Acinetobacter baumannii, birçok antibiyotiğe dirençli hastanelerde bir salgına neden olan bir patojendir. Bir baumannii su organizmasıdır ve tercihan su ortamlarını kolonileştirmektedir. Bakteriyel kontaminasyon yara iyileşmesinin zayıflamasından kaynaklanmaktadır. Çözülmemiş bakteriyel enfeksiyonlar, yaranın kapanmasını inhibe eder ve alttaki dokuyu yok eder. Patojenik bakterilerin salgıladığı güçlü eksotoksinler ve proteazlar nedeniyle yaranın kapanmasını ve patojenik bakterilerin salgıladığı güçlü eksotoksinler ve proteazlar nedeniyle altta yatan dokuları yok eder Bu tezde, ATP formundaki enerji üretiminde önemli bir rol oynayan bakteriyel oksidatif fosforilasyon (OxPhos) sistemini seçici olarak hedefleyen bazı moleküllerin kuantum kimyasal özellikleri incelenmiştir. B3LYP yöntemi ile 6-311G` (d, p) ve 6-311 ++ G (2d, 2p) baz kümeleri ile yapılan kimyasal hesaplamalarla elde edilen en yüksek dolu moleküler orbital enerjisi (EHOMO), en düşük boş moleküler orbital enerjisi (ELUMO), Mulliken atomik yükler ve bağ uzunlukları değerlendirmiştir. Ayrıca global sertlik (), yumuşaklık (S), elektronegatiflik (), kimyasal potansiyel (), elektrıfilisite (ω) gibi tanımlayıcıların hesaplaması yapılmıştır. DRAGON yazılımını kullanarak, 3224 tanımlayıcılar, Geometrik,yapısal ve topolojik tanımlayıcılar atom merkezli parçalar, moleküler özellikler ve diğerleri orijinal değişkenler olarak hesaplanarak aktivite ile tanımlayıcılar aradında ilişki incelenmiştir.A.baumanii'ye karşı iyi bir antibakteriyel etki gösteren 1H-benzo[d]imidazoaul-2(3H)-imin alt türevlerınin kuantum kımyasal çalışmaları yapılarak moleküler yapı arasındaki ilişkiler 1 ila 12 arasındaki kimyasal bileşenler için doğrusal regresyon modeli kullanılarak yapılmış , 13 ila 29 arasındaki kimyasal bileşenler için ANNs yöntemi kullanılarak incelenmiştir.
Özet (Çeviri)
Acinetobacter baumannii, which is a pleomorphic aerobic gram-negative bacillus, is a pathogen causing concern of an outbreak in hospitals with resistance to many antibiotics. A baumannii is a water organism and preferentially colonizes aquatic environments. Bacterial contamination is due to impairment of wound healing. Unresolved bacterial infections inhibit wound closure and destroy underlying tissue due to the potent exotoxins and proteases secreted by pathogenic bacteria. In this Thesis some molecules are given that selectively target the bacterial oxidative phosphorylation (OxPhos) system, which plays an essential role in energy production in the form of ATP. Some of the electronic and molecules properties of molecules such as the highest occupied molecular orbital energy (EHOMO), lowest unoccupied molecular orbital energy (ELUMO), the energy gap between EHOMO and ELUMO, Mulliken atomic charges, bond lengths obtained from the quantum chemical calculation using B3LYP with 6-311G(d,p) and 6-311++G(2d,2p) basis sets were evaluated. Besides. Calculations of some QSAR descriptors such as global hardness (), softness (),electronegativity (),chemical potential (), Global Electrophilicity (ω), and nucleofugaliti (En), electrofugality (Ee) were performed. The relationship between quantum chemical descriptors of 1H-benzo [d] imidazoaul-2 (3H) -imine sub-derivatives showing a good antibacterial effect against A. baumanii and The relationship between activity and descriptors obtained byuUsing DRAGON software, 3224 descriptors calculated as the original variables, including geometrical, constitutional and topological descriptors, atom-centered fragments, molecular properties and many others were studied.
Benzer Tezler
- Çok-ilaca-dirençli klebsiella pneumoniae ve acinetobacter baumannii'ye özgü bakteriyofaj izolasyonu ve bu fajların biyofilme etkisi
Specific bacteriophage isolation TO multi-DRUG-resistant klebsiella pneumoniae and acinetobacter baumannii and effect of this phages on biofilm
YELDA İŞLEK
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
Mikrobiyolojiİstanbul Üniversitesi-CerrahpaşaTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FATMA KÖKSAL ÇAKIRLAR
- Molecular study of carbapenems resistant Acinetobacter baumannii isolated from clinical
Klinik kaynaklardan izole edilen karbapenemlere dayanıklı Acınetobacter baumannıı'nin moleküler çalışması
MOHAMMED ADNAN FADHIL AL-NAJJAR
Yüksek Lisans
İngilizce
2023
BiyolojiÇankırı Karatekin ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ŞİNASİ AŞKAR
- Yoğun bakım Ünitelerinde acinetobacter baumannii enfeksiyonları: Epidemiyolojik, klinik ve mortaliteyi etkileyen özelliklerinin retrospektif değerlendirilmesi
Acinetobacter baumannii infections in intensive care units: Evaluation of clinical and epidemiological charecteristics and effect on mortality retrospectively
HAYDAR ÜRÜN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2013
Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıErciyes ÜniversitesiEnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. HAYATİ DEMİRASLAN
- Acınetobacter baumannii enolazının klonlanması ve ın silico analizi
Cloning and in silico analysis of enolase from acinetobacter baumannii
ANIL ATA
Yüksek Lisans
Türkçe
2020
BiyomühendislikYıldız Teknik ÜniversitesiBiyomühendislik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. DİLEK BALIK
- Hastane enfeksiyonlarından izole edilen a.baumannii suşlarının AFLP ve pfge yöntemi ile moleküler karakterizasyonu
Molecular characterization of a. baumannii strains isolated from nosocomial infections by AFLP and pfge methods
IŞILAY GÖKÇE BENK
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2013
MikrobiyolojiÇukurova ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FATİH KÖKSAL