Mikotoksin üretme potansiyelinin fusarium türlerinde pzr analizi ile belirlenmesi
Identification of mycotoxin production potential in fusarium species by pcr analysis
- Tez No: 462923
- Danışmanlar: PROF. DR. GÜLRUH ALBAYRAK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Genetik, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2017
- Dil: Türkçe
- Üniversite: İstanbul Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 41
Özet
Fusarium graminearum ve F. culmorum Türkiye'de olduğu gibi dünya genelinde başak yanıklığı ve kök çürüklüğünün önde gelen patojenleridir. Bu patojenler ekin kalite ve miktarında düşüşe neden olurlar. Farklı tipteki mikotoksinler bu patojenlerle enfekte olan tahıllar üzerinde birikmektedir. Bu nedenle patojenlerin mikotoksin üretme potansiyellerinin belirlenmesi hastalıkların kontrolünde önem taşımaktadır. Bu çalışmada, Yurdumuzda enfeksiyonlara yol açan F. graminearum ve F. culmorum izolatlarının zearalenon, fusarin C ve butenolid üretim potansiyelleri polimeraz zincir reaksiyonu (PZR) ile incelendi. Beş F. graminearum ve 5 F. culmorum izolatı SCAR markır analizi ile tür seviyesinde tanımlandı. Zearalenon, butenolid ve fusarin C üretimiyle ilişkili PKS13, FG08079.1 ve PKS10 genlerinin varlığı 10 izolatta PZR ile araştırıldı ve sırasıyla 1213, 1151 ve 1296 bç'lik ürünler genomik DNA'lardan çoğaltıldı. Ancak, PKS13 geni 2F izolatının genomunda 750 bç boyutundaydı. Bu çalışmadan elde edilen veriler her izolatın bu üç toksini üretme potansiyeline sahip olduğunu gösterdi. PKS13 geninin 2F izolatındaki varyasyonunun toksin üretimini etkileyebileceği ortaya kondu. Ek olarak, mikotoksin biyosentez yolağında görevli enzimleri şifreleyen genlerin analizi ile mikotoksin üretim potansiyeli hakkında dolaylı bilgi sahibi olunabileceği gösterildi.
Özet (Çeviri)
Fusarium graminearum and F. culmorum are major pathogens of head blight and root rot worldwide as well as in Turkey. These pathogens lead to loses in crop quality and quantity. Different types of mycotoxins accumulate on cereals, infected by these pathogens. Therefore, determination of mycotoxin production potentials of the pathogens is important in terms of controlling the diseases. In this study, zearalenon, fusarin C and butenolide production potentials of F. graminearum and F. culmorum isolates, caused infections in Turkey, were investigated via polymerase chain reaction (PCR). Five F. graminearum and 5 F. culmorum isolates were identified by SCAR marker analysis at species level. PKS13, FG08079.1 and PKS10 genes, associated with production of zearalenone, butenolide and fusarin C, respectively, were investigated by PCR. Products with 1213, 1151 and 1296 bp length were amplified from genomic DNAs of the isolates, respectively. However, PKS13 gene was 750 bp length in 2F isolate. Findings obtained from this study showed that each isolate had the production potential of these three mycotoxins. It was revealed that variation of PKS13 gene in 2F isolate could affect the toxin production. In addition, it was shown that the analysis of the genes coding the enzymes which are responsible for mycotoxin biosynthetic pathways, give indirect information about the potential of mycotoxin production.
Benzer Tezler
- Fusarium graminearum ve Fusarium culmorum izolatlarının RAPD markırlarına dayalı genetik tiplendirmesi
Genotyping of Fusarium graminearum and Fusarium culmorum isolates by RAPD markers
EMRE YÖRÜK
Yüksek Lisans
Türkçe
2009
Genetikİstanbul ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. GÜLRUH ALBAYRAK
- Sofralık siyah zeytin işleme sürecinde mikotoksik fungal türlerin moleküler karakterizasyonu ve toksin oluşturma potansiyelleri
Molecular characterization of mycotoxigenic fungal species and their toxin producing potential during table black olive processing
NİSA ÖZSOY
Doktora
Türkçe
2019
Gıda MühendisliğiÇanakkale Onsekiz Mart ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ÇİĞDEM PALA
DR. ÖĞR. ÜYESİ HİLAL ÖZKILINÇ
- Çeşitli tahıl unlarındaki mikotoksijenik fungusların tanımlanarak temel mikotoksin potansiyellerinin araştırılması
Research on identification of mycotoxigenic fungi and main mycotoxin potantial in various cereal flours
RASİME ÖZİÇ
Doktora
Türkçe
2011
MikrobiyolojiAnadolu ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. NALAN YILMAZ SARIÖZLÜ
- Gıda izolatı mayaların gıda bulaşanı küfler üzerindeki biyokontrol etkisinin araştırılması
Research of food isolator yeasts' biocontrol effects on food infecting moulds
PINAR BİLGİN
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
Gıda MühendisliğiSüleyman Demirel ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. PERVİN BAŞARAN AKOCAK
- Türk peynirlerinde aflatoksinlerin mevcudiyeti üzerine araştırmalar
Başlık çevirisi yok
GÜNER ÖZAY
Yüksek Lisans
Türkçe
1984
Besin Hijyeni ve Teknolojisiİstanbul ÜniversitesiBesin Hijyeni ve Teknolojisi Ana Bilim Dalı