Geri Dön

Raf-1 kinaz inhibitörleri olarak sübstitüe olmuş üreaz üzerine mcet metodunda fukui indisleriyle 4d-qsar analizi

4d-qsar analysis by fukui distribution in mcet method on substitute ureas as raf-1 kinase inhibitors

PDF İndir

  1. Tez No: 467797
  2. Yazar: EKREM MESUT SU
  3. Danışmanlar: PROF. DR. YAHYA GÜZEL
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Kimya, Chemistry
  6. Anahtar Kelimeler: Raf-1 Kinaz, 4D-QSAR, LOO-CV, ETM, MCET, Raf-1 Kinase, 4D-QSAR, LOO-CV, ETM, MCET
  7. Yıl: 2017
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Erciyes Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Kimya Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 105

Özet

Biyoaktif-yapıyı belirlemek için, ligand temeline dayanan Moleküler Konformer Elektron Topolojiksel (Moleculer Conformer Electron Topological-MCET) metot, üreaz türevine sahip olan ligandlara uygulandı. Biyoyapı, 5 farklı bileşiğe ait seçilmiş konformerlerin 3D alt-yapılarından bulundu. Elektron Topolojiksel Matris (ETM) içinde hazırlanmış atomların elektronik özellikleri, moleküllerin 3D Yapısal Tanımlayıcıları (3DSDs) olarak kullanıldı. Aktivitede rol oynayan bu tanımlayıcıları analiz etmek ve bağlanma yatkınlığını öneren bir model oluşturmak için Genetik Fonkisyon Yaklaşımı (Genetic Function Approximation-GFA) kullanıldı. Ligandın reseptöre bağlanma yatkınlığını değerlendirmek üzere bölgesel reaktivite parametreleri olarak Atomic Fukui indeksleri ele alındı. Ligandın reseptör bağlanma noktaları ile olan nükleofilik ve elektrofilik atak doğası hakkında görüş kazanmak için etkileşim alanları tanımlandı. Birini Dışarda Bırakarak Çapraz Doğrulama (Leave One Out-Cross Validation-LOO-CV) uygulanarak modelin geçerliliği ispat edildi. Farmakofor (Pharmacophore-Pha) yapı ile birlikte Aktiviteyi artırıcı (Auxiliary Group-AG) ve Aktiviteyi Azaltıcı (Anti-Pharmacophore Shielding Group-APS) grupları aktivitede rol aldı. 4D-QSAR model lineer olmayan eşitlikten türetilerek oluşturuldu. Sonuç olarak Q2 ve R2 için elde edilen, sırasıyla, (0.71 ve 0.60) yüksek verimli değerleri yeterlidir.

Özet (Çeviri)

To detect the bioactive structure, the ligand-based Molecular Conformer Electron Topological (MCET) method was applied to ligands having a urease derivative. The electronic properties of the atoms prepared in the Electron Topological Method (ETM) were used as 3D Structural Definers (3DSDs) of the molecules. The Genetic Function Approximation (GFA) was used to analyze these identifiers that play an active role and to create a model that suggests the binding propensity. Atomic Fukui indices were used as regional reactivity parameters to assess ligand-receptor binding potency. Points of interaction have been identified to gain insight into the nature of nucleophilic and electrophilic attack with receptor binding sites of the ligand. The validity of the model was verified by applying Leave One Out-Cross Validation (LOO-CV). Auxiliary Group AG and Anti-Pharmacophore Shielding Group (APS) groups were involved in the activity with the Pharmacophore-Pha structure. The 4D QSAR model was derived from a nonlinear equation. As a result, the high efficiency values for Q2 and R2 are satisfactory (0.71 and 0.60), respectively.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    781985

    İnsan nöroblastom hücre hattında glikoziltransferazların prognostik rollerinin belirlenmesi

    Determination of the prognostic roles of glycosyltransferases in the human neuroblastoma cell line.

    DİLARA BENİM

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    BiyoteknolojiTrakya Üniversitesi

    Temel Eczacılık Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ELVAN BAKAR

  2. Tez No

    374353

    Systems biology approach for targeted therapy of liver cancer pi3k/akt/mtor pathway inhibitors: an ally or rival for sorafenib

    Karaciğer kanseri tedavisine sistem biyolojisi yaklaşımı pı3k/akt/mtor sinyal yolağı inhibitörleri: sorafenib'e müttefik veya rakip

    TÜLİN ERŞAHİN

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2014

    Biyolojiİhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. RENGÜL ÇETİN ATALAY

  3. Tez No

    439664

    Investigation of the autophagy and apoptosis relation through BAG-1, BcL-2 and Beclin 1

    Otofajı̇ ve apoptoz ı̇lı̇şkı̇sı̇nı̇n BAG-1, BcL-2 ve Beclin 1 üzerı̇nden ı̇ncelenmesı̇

    GİZEM ALKURT

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2016

    Biyolojiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. GİZEM DİNLER DOĞANAY

  4. Tez No

    816740

    Drug repurposing in Ras/Raf/Mek/ERK signaling pathway

    Ras/Raf/Mek/ERK sinyal yolağında ilaç yeniden konumlandırma

    AHENK ZEYNEP SAYIN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2023

    BiyokimyaKoç Üniversitesi

    Kimya ve Biyoloji Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ZEHRA ÖZLEM KESKİN ÖZKAYA

    PROF. DR. ATTİLA GÜRSOY

  5. Tez No

    768486

    Karaciğer kanseri hücrelerinde plexinc1 ifadesinin çoklu-kinaz inhibitör yanıtına etkisinin araştırılması

    Investigation of the effect of plexinc1 expression on multikinase inhibitory response in liver cancer cells

    ŞEVVAL DİK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    BiyolojiGebze Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. TAMER YAĞCI

Geri Dön