Kırım kongo kanamalı ateşi hastalarında hulc ve 7SL RNA ifade düzeylerinin araştırılması
Evaluation of hulc and 7SL RNA expression levels in patients with crimean congo hemorrhagic fever
- Tez No: 468789
- Danışmanlar: DOÇ. DR. SERDAL ARSLAN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Tıbbi Biyoloji, Medical Biology
- Anahtar Kelimeler: Gen ifadesi, Hemorajik ateş-Kırım, RNA, Transkripsiyon-genetik, Virüs hastalıkları, Virüsler, Gene expression, Hemorrhagic fever-Crimean, RNA, Transcription-genetic, Virus diseases, Viruses
- Yıl: 2017
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Cumhuriyet Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Kırım Kongo kanamalı ateşi (KKKA), Kırım Kongo kanamalı ateş virüsünün (KKKAV) neden olduğu kene kaynaklı bir hastalıktır. Uzun kodlama yapmayan RNA'lar (lncRNA'lar) genellikle 200 nükleotitten daha uzun transkriptler olarak sınıflandırılırlar. Viral enfeksiyonlar lncRNA'lar da dahil olmak üzere hücre transkriptomunda güçlü değişiklikler meydana getirmektedirler. Enfekte olmuş hücrelerde ifade olan çeşitli lncRNA'lar viral ve konak genlerinin ekspresyonunu düzenlemede görev almaktadırlar. Son yıllarda, bazı lncRNA'ların terapötik hedefler ve hastalığın ilerlemesinde prognostik belirteçler olarak kullanılabileceği düşünülmektedir. Bu çalışma KKKA hastalarında HULC ve 7SL RNA ekspresyon düzeylerinin araştırıldığı ilk çalışmadır. Bu amaçla, 100 bireyin (60 hasta ve 40 kontrol) kan örnekleri alındı ve total RNA izolasyonu yapıldı. Çalışma popülasyonunda HULC ve 7SL RNA ekspresyon düzeylerini belirlemek için SYBR Green yöntemi kullanılarak kantitatif polimeraz zincir reaksiyonu (qPCR) gerçekleştirildi. Hasta ve kontrol grubu karşılaştırıldığında, hastalarda HULC ekspresyon seviyesinin artışı istatistiksel olarak anlamlı bulundu (p=0.04). 7SL RNA ifadesinin hastalarda 1.88 kat azaldığı (p=0.93) gözlendi. Ayrıca hastalarla karşılaştırıldığında ölenlerde HULC'un ifadesinin 100 kat arttığı (p<0.01) ve 7SL RNA'nın ifadesinin ise azaldığı (1.04 kat, p=0.03) tespit edildi. Bunlara ek olarak uluslararası normalize edilmiş oran (INR) ve protrombin zamanı (PT) normal değerlerin üzerinde olan hastalarla normal değerler arasında olanlar karşılaştırıldığında INR ve PT'si normal değerin üzerinde olanlarda HULC ifadesinin 3 kat artması istatistiksel olarak önemli bulundu (p=0.01 ve p=0.02, sırasıyla). Klinik parametreleri normalin üzerinde olan ölmüş ve hayatta kalan hastalar karşılaştırıldığında ölmüş bireylerde HULC ifadesi artmıştır. HULC; aspartat aminotransferazı (AST) yüksek olanlarda 90 kat (p<0.01), alanin aminotransferazı (ALT) yüksek olanlarda 80 kat (p<0.01), PT'si yüksek olanlarda 165 kat (p=0.01), aktive parsiyel tromboplastin zamanı (aPTT) yüksek olanlarda 131 kat (p<0.01) ve laktat dehidrogenazı (LDH) yüksek olanla da 97 kat (p<0.01) artmıştır. Bulgularımız HULC ve 7SL RNA'nın KKKA hastalığının patogenezinde önemli oluğunu göstermektedir.
Özet (Çeviri)
Crimean-Congo hemorrhagic fever (CCHF) is a tick-borne disease caused by the Crimean-Congo hemorrhagic fever virus (CCHFV). Long non-coding (lncRNAs) are generally classified as transcripts longer than 200 nucleotides. Viral infections cause strong changes in cell transcriptomics, including lncRNAs. The various lncRNAs expressed in infected cells are responsible for regulating the expression of viral and host genes. In recent years, it has been thought that some lncRNAs may be used as therapeutic targets and prognostic markers in the progress of disease. This is the first study to investigate HULC and 7SL RNA expression levels in CCHF patients. For this purpose, blood samples were taken from 100 individuals (60 patients and 40 controls) and total RNA isolation was performed. Quantitative polymerase chain reaction (qPCR) was performed using the SYBR Green method to determine HULC and 7SL RNA expression levels in the study population. When the patient and control groups were compared, the increase in HULC expression level in the patients was statistically significant (p=0.04). 7SL RNA expression was decreased 1.88 times (p=0.93) in patients. It was also found that the expression of HULC was increased 100 fold (p<0.01) and 7SL RNA was decreased (1.04 fold, p=0.03) in fatal cases when compared to patients. In addition, HULC was increased 3 fold in patients who have higher international normalized ratio (INR) and prothrombin time (PT) values compared with patients with normal values and these were found statistically significant (p=0.01 and p=0.02, respectively). HULC was increased in the fatal cases with higher clinical parameters compared with patients with higher values. HULC expression in fatal cases with higher aspartate aminotransferase (AST), alanine aminotransferase (ALT), PT, active partial thromboplastin time (aPTT), and lactate dehydrogenase (LDH) increased 90 (p<0.01), 80 (p<0.01), 165 (p=0.01), 131 (p<0.01) and 97 fold (p<0.01), respectively. Our findings show that HULC and 7SL RNA are important in the pathogenesis of CCHF disease.
Benzer Tezler
- Kırım kongo kanamalı ateşi hastalarında serum nitrik oksit düzeylerinin klinik ve prognoz ile ilişkisi
Serum nıtrıc oxyde levels ın patıents wıth crımean an congo hemorrhagıc fever assocıated wıth clınıcal and prognosis
CEZMİ KARACA
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2012
Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik MikrobiyolojiAtatürk ÜniversitesiEnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ZÜLAL ÖZKURT
- Kırım-Kongo Kanamalı Ateşi hastalarında kemokin reseptör 5(CCR5) geni delta32 mutasyonunun analizi
Chemokine receptor 5 gene analysis of delta32 mutation in patients with Crimean-Congo Haemorrhagic Fever
DUYGU EKİNCİ
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
Tıbbi BiyolojiGaziosmanpaşa ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. AYDIN RÜSTEMOĞLU
- Kırım kongo kanamalı ateşi hastalarında mir-126-3p ve mir-142-5p ifade düzeylerinin araştırılması
Investigation of mir-126-3p and mir-142-5p expression levels in patients with crimean congo hemorrhagic fever
NAZIM ESERYEL
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
Tıbbi BiyolojiCumhuriyet ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SERDAL ARSLAN
- Kırım kongo kanamalı ateşi hastalarında DROSHA, dicer ve exportin-5 protein düzeylerinin belirlenmesi
Determination of drosha, dicer and export-5 protein levels in patients with crimean congo hemorrhagic fever
ZEHRA DOĞAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
BiyokimyaSivas Cumhuriyet ÜniversitesiBiyokimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SEVTAP BAKIR
- Kırım-kongo kanamalı ateşi hastalarında miRNA-1908 ve miRNA-144 RNA ifade düzeylerinin araştırılması
Investigation of miRNA-144 and miRNA-1908 expression levels in crimean-congo hemorrhagic fever patients
ÖZLEM ALDEMİR
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2019
Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik MikrobiyolojiSivas Cumhuriyet ÜniversitesiEnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AYNUR ENGİN