Geri Dön

Enterokok izolatlarında vanA, vanB ve vanC genlerinin belirlenmesi

Investigations of vana, vanB and vanC genes in enterococcus isolates

PDF İndir

  1. Tez No: 471430
  2. Yazar: MÜMİN SARGIN
  3. Danışmanlar: PROF. DR. AHMET ÜNVER
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2017
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Çanakkale Onsekiz Mart Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 88

Özet

Enterokokların hastane ve toplum kökenli enfeksiyon etkenleri arasındaki önemi hızla artmaktadır. Bu etkenlerde gelişen vankomisin direnci ve vankomisine dirençli türlerin birçok antibiyotiğe de dirençli olması, enterokokal enfeksiyonların tedavisini güçleştirmektedir. Vankomisin direnci ile ilişkili genlerin belirlenmesi bu önemli direncin özelliklerini daha iyi anlamaya ve etkin tedavi ve mücadele yöntemlerine yardımcı olmaktadır. Bu çalışmada vankomisin direnci ve tür özellikleri farklı enterokok izolatlarında vankomisin direnciyle ile ilişkili önemli genlerden vanA, VanB ve VanC'nin PCR ile belirlenmesi amaçlanmıştır. Çalışma materyali olarak, Çanakkale Onsekiz Mart Üniversitesi Sağlık Uygulama ve Araştırma Hastanesi Mikrobiyoloji Laboratuvarında Haziran 2013 – Mart 2014 tarihleri arasında Vitek-2 Compact ile tanımlanmış 91'i (%45,5) (biri vankomisin dirençli) E. faecalis, 102'si (%51) (66'sı vankomisin dirençli) E. faecium, beşi (%2,5) E. gallinarum ve ikisi (%1) E. avium'dan oluşan 200 izolat kullanıldı. Bakterilerden DNA izolasyonu ve özgün genleri amplifiye eden PCR gerçekleştirildi. Toplamda 97 (%48,5) vanA, dört (%2) vanC, iki (%1) vanA+vanC direnç genleri pozitif izolat tespit edilirken, 97 (%48,5) izolat direnç genleri bakımından negatif olarak belirlendi. Doksan E. faecalis izolatından 19'u (%21,1) vanA pozitif olarak tespit edilirken, 71 (%78,9) suş ise negatif olarak belirlendi. Otuz altı E. faecium suşundan 16 tanesi (%44,4) vanA pozitif bulunurken 20 izolat (%55,6) ise negatif olarak belirlendi. Beş E. gallinarum izolatından dördü (%80) vanC pozitif olarak tespit edilirken, bir (%20) suşun vanC negatif olduğu bulundu. İki E. avium izolatı analiz edilen tüm direnç genleri açısından negatif olarak ortaya konuldu. Vitek-2 tarafından VR E. faecium olarak tanımlanmış 66 suşun 61'i (%92,4) vanA, ikisi (%3) vanA+vanC olarak tespit edilirken, üç (%4,6) izolat negatif olarak belirlendi. Bu araştırmada izole edilen hem VRE hem de VSE suşlarında belirlenen yüksek düzeyde direnç geni varlığı, başta vanA, vanB ve vanC olmak üzere direnç ilişkili genlerin dikkatle izlenmesinin etkin kontrol ve önleme yöntemleri için gerekli olduğunu ortaya koymaktadır. Bu çalışmanın enterokokların direnç özelliklerini ve epidemiyolojisini daha iyi anlamaya ve ilgili genlerin belirlenmesi şeklindeki tanısal desteğin önemini daha iyi kavramaya katkı sunması beklenmektedir.

Özet (Çeviri)

Enterococci has increasing importance in both community and hospital acquired infections. The development of resistance to vancomycin leading to multiple drug resistance is complicating the treatment of enterococcal infections. Identification of genes associated with vancomycin resistance helps better understanding of resistance properties and effective treatment and control strategies. The present study aimed to determine the vanA, VanB and VanC, important genes associated with vancomycin resistance, in enterococcal isolates. For this purpose, 200 Enterococci strains isolated from surveillance and clinical samples in the Microbiology Laboratory of Çanakkale Onsekiz Mart University Hospital were analyzed. These strains, isolated between June 2013 – March 2014 and identified by Vitek-2 Compact system, consisted of 91 (45.5%) E. faecalis (one vancomycin resistant), 102 (51%) E. faecium (66 vancomycin resistant), five (2.5%) E. gallinarum and two (1%) E. avium. Bacterial DNA isolation and PCR targeting to vanA, VanB ve VanC genes were performed. Total of 97 (48,5%) vanA, four (2%) vanC and two (1%) vanA+vanC PCR positive isolates were determined and 97 (48.5%) isolates were found to be negative for resistance genes. Of the ninety E. faecalis isolates, 19 (21.1%) were found to be positive for vanA and 71 (78.9%) for negative. Among 36 E. faecium strains, 16 (44.4%) were positive for vanA and 20 (55.6%) were negative. Four out of five E. gallinarum isolates (80%) were identified as vanC, while a strain was found to be vanC negative (20%). Two E. avium strains were negative for all resistance genes analyzed. Among 66 isolates identified as VR E. faecium by Vitek-2, 61 (92.4%) and 2 (3%) were determined as vanA and vanA+vanC, respectively while three (4.5%) strains were found to be PCR negative. The existence of high level of resistance genes in both VRE and VSE strains isolated in this study suggests that careful monitoring of resistance-related genes, particularly vanA, vanB and vanC, is essential for effective treatment, control and preventive measures. The results of this study may help better understand resistance properties of enterococci, epidemiology of enterococcal infections and importance of resistance gene determination in diagnostic contribution.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    391980

    Sucuktan enterokokların izolasyonu ve antibiyotik duyarlılık profillerinin belirlenmesi

    Isolation of enterococci from traditional fermented Turkish sausage (sucuk) and determination of their antibiotic susceptibility patterns

    FURKAN DEMİRGÜL

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    Gıda MühendisliğiSüleyman Demirel Üniversitesi

    Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. YASİN TUNCER

  2. Tez No

    582464

    Yoğun bakım hastalarından izole edilen enterokok izolatlarında çeşitli virulans ve direnç genlerinin varlığının araştırılması

    Investigation of the presence of various virulance and resistance genes in enterococci isolates isolated from intensive care patients

    ŞEHRİSTAN IŞIK BAYTAR

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    BiyolojiMuş Alparslan Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. HANİFİ KÖRKOCA

  3. Tez No

    581503

    Çeşitli klinik örneklerden izole edilen vankomisine direçli enterokok suşlarının fenotipik ve genotipik değerlendirilmesi

    Phenotypic and genotypic evaluation of vancomycin-resistant enerococcal strains isolated from various clinical specimens

    SEMRA BİLEN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    MikrobiyolojiVan Yüzüncü Yıl Üniversitesi

    Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. MEHMET PARLAK

  4. Tez No

    773003

    Peynirlerden izole edilen enterococcus faecium ve enterococcus faecalis izolatlarında glikopeptid direnç geni ve virülans gen varlığının araştırılması ve rektal sürveyans izolatlarıyla klonal ilişkinin irdelenmesi

    Investigation of the presence of glycopeptide resistance gene and virulence gene in enterococcus faecium and enterococcus faecalis isolates isolated from cheese and investigation of clonal relationship with rectal surveillance isolates

    BÜŞRA PEMBE

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    MikrobiyolojiKahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ FİLİZ ORAK

  5. Tez No

    331386

    Çeşitli hayvan türlerinden izole edilen vankomisine dirençli enterokok izolatlarında VANA, VANB, VANC1 ve VANC2 genlerinin moleküler yöntemle araştırılması

    The investigation of vana, VANB, VANC1 AND VANNC2 GENES in vancomycin resistant enterococci isolates from various animal species by molecular method

    DEVRİM SARIGÜZEL

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2012

    Veteriner HekimliğiErciyes Üniversitesi

    Mikrobiyoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. FUAT AYDIN

Geri Dön