Geri Dön

Characterization of xyloglucan endotransglycosylase (XET) enzymes from different plant species

Farklı bitki türlerinden ksiloglukan endotransglikozilaz (XET) enzimlerinin karakterizasyonu

PDF İndir

  1. Tez No: 472597
  2. Yazar: MERVE SEVEN
  3. Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. ANDREW JOHN HARVEY
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Biyokimya, Biyoloji, Biyoteknoloji, Biochemistry, Biology, Biotechnology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2017
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Yeditepe Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 369

Özet

Türler arası engin çeşitlilik gösteren ve Dünya üzerindeki bağlı organik karbonun büyük kısmını sağlayan Bitkiler Alemi, özgül ayırt edici bir özelliğe sahiptir; polisakkaritlerden ve fonksiyonel ve yapısal proteinlerden oluşmuş bir hücre duvarı. Bitki hücre duvarları, pektik polisakkaritlerinden oluşmuş bir matriks içine gömülmüş ve selülozik olmayan β-bağlı polisakkaritler ile çapraz bağlanmış selüloz mikrofibrillerinden oluşmuştur. Ksiloglukan, otsu olan, otsu olmayan ve Equisetum gibi evrimsel olarak uzak türlerde çokça bulunan, başlıca selülozik olmayan β-bağlı polisakkaritlerden biridir ve yük taşıyıcı bir yapı oluşturmak üzere primer hücre duvarında selüloz mikrofibrillerini çapraz bağlamaktadır. Hücre duvarı, bitkinin yaşamı boyunca değişmektedir. Bu değişim, veya adaptasyon, hücre duvarını değiştirebilen enzimler ile sağlanmaktadır. Tarımsal öneme sahip bitki türleri de dahil olmak üzere çoğu bitkide çok üyeli izozim aileleri şeklinde bulunan ksiloglukan endotransglikozilaz/ hidrolaz (XTH) enzimleri, hücre duvarında ksiloglukanın ve büyük ihtimalle diğer polisakkaritlerin endotransglikozilasyonu ve/veya hidrolizini katalizleyerek hücre duvarını değiştirmektedir. XTH enzimleri, amino asit dizileri temel alınarak altı adet filogenetik grup oluşturmaktadır ki enzimlerin substrat özgüllüklerinin de gruplar arası değiştiği gösterilmiştir. Bu çalışmada gösterildiği gibi Grup I XTH enzimleri baskın bir ksiloglukan tercihi gösterirken atasal grup üyeleri daha geniş bir substrat tercihi sergilerler ki Arabidopsis AtXTH3 üyesinin tercihi substratı karışık-bağlı β-glukandır. Bir diğer yandan, Equisetum fluviatile bitksinde karışık-bağlı β-glukanın keşfi ile, karışık-bağlı β-glukan; ksiloglukan endotransglikozlaz (MXE) olarak isimlendirilen bir enzim tanımlanmıştır. Türkiye'de yaygın olarak bulunan E. telmateia eksplant olarak kullanılıp MXE-benzeri enzim saflaştırılmış, karakterize edilmiş ve tanımlanmıştır. MXE, atasal grup ve Grup I üyesi enzimlerin karakterizasyonu ile bitki XTH'lerinin bakteri likeninaz atalarından evriminin aydınlatılması hedeflenmiştir.

Özet (Çeviri)

Kingdom Plantae, which has extensive variety between species and provides the planet with most of the fixed organic carbon, is a very important kingdom with a specific distinctive feature; cell walls made of polysaccharides and functional and structural proteins. Plant cell walls are made of cellulose microfibrils embedded in a matrix of pectic polysaccharides and cross-linked with non-cellulosic β-linked polysaccharides. Xyloglucan is a major non-cellulosic β-linked polysaccharide, it is ubiquitous in the cell walls of non-graminaceous, graminaceous and evolutionarily distant species like Equisetum plants, and it links cellulose microfibrils to form load-bearing structures in the primary cell wall. The cell wall changes during the lifespan of a plant. This change, or adaptation, is achieved by enzymes that are capable of modifying cell wall polysaccharides. Xyloglucan endotransglycosylase/hydrolase enzymes (XTH), found as multi-member isozyme families in most plant species, including agriculturally important species, catalyse endotransglycosylation and/or hydrolysis of xyloglucan and possibly other polysaccharides within the plant cell wall, resulting in modifications of the wall. XTH enzymes group into six phylogenetic clades depending on their amino acid sequences, which are also proven to differ in their substrate specificity. As demonstrated in this thesis, Group I XTH family members show dominant preference to xyloglucan whereas ancestral clade members have a broader substrate specificity, with Arabidopsis ATXTH3 members acting preferentially on mixed-linked β-glucan. On the other hand, with the discovery of mixed-linked β-glucan in Equisetum fluviatile, a new enzyme was identified named as mixed-linked β-glucan: xyloglucan endotransglycosylase (MXE). E. telmateia, an Equisetum species commonly found in Turkey, was used as an explant in order to purify, characterize and identify an MXE-like enzyme. With enzyme characterizations of MXE, ancestral clade and Group I members, evolution of XTHs in plants from bacterial licheninase ancestors is aimed to be enlightened.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    446611

    Substrate characterization of putative ancestral xyloglucan endotransglycosylase/hydrolases

    Atasal ksıloglukan endotransglikozilaz/hidrolazların substrat karakterizasyonu

    DİLARA TÜZÜN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2016

    Bilim ve TeknolojiYeditepe Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. ANDREW JOHN HARVEY

  2. Tez No

    472602

    Analysis of xyloglucan endotransglycosylase/hydrolases enzymes to seek their evolutionary origins

    Ksiloglukan endotransglikozilaz/hirolaz enzimlerinin evrim orijinlerini incelemek için analizi

    TUĞÇE BAYRAKDAR TURGUT

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2017

    BiyolojiYeditepe Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. ANDREW JOHN HARVEY

  3. Tez No

    560910

    A study of abiotic stress protecting xyloglucan endotransglycosylase (XTH) genes in plants

    Bitkilerde abiyotik strese karşı koruma sağlayan ksiloglukan endotransglikosilaz (XTH) genleri üzerine bir çalışma

    EZGİ TÜRKSEVER

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2019

    BiyoteknolojiYeditepe Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ ANDREW JOHN HARVEY

  4. Tez No

    80242

    Vankomisin içeren Poli(D,L-laktik-ko-glikolik asit) implantların karakterizasyonu ve in vitro-in vivo salım davranışlarının incelenmesi

    Characterization of vancomycin containing poly(d,l-lactide-co-glycolide) implants and investigation of their in vitro-in vivo release behaviour

    YILDIZ ÖZALP

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    1997

    Eczacılık ve FarmakolojiAnkara Üniversitesi

    Farmasötik Teknoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. NURTEN ÖZDEMİR

  5. Tez No

    82603

    Characterization of arylamine N-acetyltransferase in tissues from human breast cancer

    İnsan kanserli meme dokusunda arilamin N-asetiltransferaz enziminin karakterizasyonu

    YAŞASIN SENEM GEYLAN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    1999

    BiyokimyaOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Biyokimya Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. TÜLİN GÜRAY

Geri Dön