Inhibition of MEIS1 allows expansion of hematopoietic stem cells
MEIS1 inhibisyonu ile hematopoietik kök hücrelerin çoğaltılmasının sağlanması
- Tez No: 472621
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. FATİH KOCABAŞ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2017
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Yeditepe Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 122
Özet
HKH'lerin en belirleyici özellikleri kendini yenileme ve birden çok hücre tipine farklılaşabilme yetenekleridir. Bu yetenekleri sayesinde HKH'ler tüm kan hücresi tiplerine dönüşebilirken, aynı zamanda vücudun gelecekteki hematopoetik aktivitesi için gerekli olan rejenerasyon kapasitesini de korumuş olurlar. HKH'ler, kendini yenileme yetenekleri sayesinde hematolojik rahatsızlıkların tedavisi için HKH nakillerinde sıklıkla kullanılmaktadır. Bu nedenle bu gibi tedavi edici uygulamalar için ex vivo HKH çoğaltılmasına yönelik çalışmalara ihtiyaç duyulmaktadır. Daha önceki çalışmalarımızda Meis1 HKH suskunluk geninin farelerdeki delesyonunun HKH çoğalmasına yol açtığı gösterilmiştir. Meis1 geninin inhibisyonu kök hücre çoğaltılması teknolojilerinde terapötik bir hedef olarak karşımıza çıkmaktadır. Biz bu çalışmada Meis1 inihibisyonu ile birlikte HKH ekspansiyon teknolojileri geliştirmeyi hedefledik. Bu sebeple in siliko ve in vitro yaklaşımlar geliştirilmiştis. İn siliko çalışmalarda, Autodock Vina – PaDel ADV platformu ile kristalize Meis 1 homodomaine karşı bir milyondan fazla küçük molekül incelenmiştir. Bunu takiben, Meis1 lusiferaz raportör deneyleri, gerçek zamanlı PZR ile hedef gen analizleri , akış sitometrisi ile ex vivo ve in vivo HKH karakterizasyonu gerçekleştirilmiştir. Meis1 inhibisyonunun Meis1 hedef genlerin ve sikline bağımlı kinaz inhibitörlerinin ekspresyonlarını azalttığını ve hem fare hem de insan HKH'lerinin expansiyonunu tetiklediğini belirledik. Bu bulgular, Meis1 inhibisyonunun ex vivo HKH ekspansiyon teknolojilerinin geliştirilmesine önemli katkıları olacağını ve sitokinlere bağımlılığın azaltılabileceğini göstermektedir.
Özet (Çeviri)
Hematopoietic stem cells (HSCs) are characterized by high capacity of self-renewing and differentiation to all blood lineages. HSCs have been generally used in HSC transplantation (HSCT) to treat the hematological diseases due to their self-renew and differentiation capacities. There are ex vivo studies carried out to expand HSC to improve HSCTs. We have been previously shown that deletion of HSC quiescence-related gene Meis1 induces the expansion of HSCs. Targeting Meis1 levels in HSCs appears as a plausible therapeutical target on stem cell expansion technologies. We aimed the development of HSC technologies through inhibition of Meis1 in this study. Therefore, we employed in silico and in vitro strategies. In silico screening of over a million small molecules against crystalised Meis1 homeodomain was carried out by Autodock Vina – PaDel Adv platform. In vitro activity of hits were analyzed with Meis1 luciferase reporter assays, gene target analysis by RT-PCR and flow cytometric profiling of HSCs ex vivo and in vivo. We have shown that inhibition of Meis1 leads to downregulation of Meis1 target genes, downregulation of CDKIs, and expansion of murine and human HSCs. These findings suggest that inhibition of Meis1 could provide important contributions to stem cell expansion technologies needed on stem cell transplantation and decrease dependency to the cytokines used for stem cell expansion.
Benzer Tezler
- Structure based design of peptidomimetic inhibitors of the MLL1-WDR5 interaction
Başlık çevirisi yok
HACER KARATAŞ
- Development of small molecule Meis inhibitors for mitigating lung cancer growth
Akciğer kanseri büyümesini azaltmak için küçük molekül Meis inhibitörlerinin geliştirilmesi
FEYZA POLAT
Yüksek Lisans
İngilizce
2020
BiyoteknolojiYeditepe ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. FATİH KOCABAŞ
- Effectiveness of MEISi-2 treatment in prostate cancer cell lines
Prostat kanseri hücre hatlarında MEISi-2 tedavisinin etkinliği
BİRKAN GİRGİN
Yüksek Lisans
İngilizce
2021
Bilim ve TeknolojiYeditepe ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. FATİH KOCABAŞ
- Development and evaluation of multiferroic nanoparticle-based drug delivery system
Multiferroik özellikli nanoparçacık tabanlı ilaç taşıyıcı sistemin geliştirilmesi ve değerlendirilmesi
GENÇAY SEVİM
Doktora
İngilizce
2023
BiyofizikEskişehir Teknik Üniversitesiİleri Teknolojiler Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. GÜLAY BÜYÜKKÖROĞLU
- Meis protein inhibitörü yüklü albümin nanopartiküllerini ve iRGD peptidini içeren in situ jelleşen sistemin hazırlanması ve karakterizasyonu
Preparation and characterization of in situ gelling system containing meis protein inhibitor loaded albumin nanoparticles and iRGD peptide
GİZEM DEĞER
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
BiyoteknolojiAnadolu ÜniversitesiFarmasötik Teknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. GÜLAY BÜYÜKKÖROĞLU