Balçova yüzeysel termal su kaynaklarından arsenik metabolize eden bakterilerin izolasyonu ve identifikasyonu
Isolation and identification of arsenic metabolizing bacteria from Balcova surface thermal water resources
- Tez No: 479704
- Danışmanlar: PROF. DR. İSMAİL KARABOZ
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyoloji, Mikrobiyoloji, Biology, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Balçova, termal su, yüzeysel su, arsenik, bakteri, Balcova, thermal water, surface water, arsenic, bacteria
- Yıl: 2017
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ege Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 136
Özet
Bakteriyel arsenik metabolizması son yıllarda ilgi çeken konulardandır. Ağır metaller termal sularda boldur. İzmir Balçova'daki termal sularının karıştığı yüzey sularından izole edilen arsenik dirençli bakteriler üzerine bilenenler yok denecek kadar azdır. Bu çalışmanın amacı bu bakterileri tanımlamak ve literatürdeki arsenik metabolizma deneylerini uygulayarak ileriye yönelik veri elde edilmesini sağlamaktır. Bu çalışmada 500 mM arsenat içeren PCA'da üreyebilen on iki izolat tanımlanmıştır. Api 50 CH ve Api 20 E ile fenotipik karekterizasyonları belirlenen izolatların kısmi 16S rDNA dizi benzerliklerine göre birer tanesi Rhodococcus sp., Pannonibacter phragmitetus, Micrococcus sp., Enterobacter sp., Microbacterium sp. iken yedisi Pseudomonas sp.'dir. LB sıvı besiyerleri kullanılarak yüksek değerde arsenik MİK'leri saptandı. Detoksifikasyon genlerinden arsA PCR ürünleri üç suşta; arsB PCR ürünleri altı suşta; arsC PCR ürünleri yedi suşta,; arsD PCR ürünleri sekiz suşta; arsM PCR ürünleri üç suşta; arsH PCR ürünleri onbir suşta; arsR PCR ürünü sadece Enterobacter sp. L'de saptanmıştır. Solunumsal arsenat redüktaz genlerinden arrA PCR ürünü Pseudomonas sp. I'da; arrB PCR ürünü beş Pseudomonas sp. suşunda saptanmıştır. Gümüş nitrat deneyi Pseudomonas sp. G suşu haricinde CDM'de üreyenlerin hepsinde olumludur. Bu çalışma Türkiye'den elde edilen izolatlardan bakteriyel arsenik metabolizma çalışması bakımından ilk sıralarda olup arsenik gibi mikro kirleticilere dikkat çekme ve literatürde kullanılan yöntemlerin geliştirilmesi bakımından veri oluşturmuştur.
Özet (Çeviri)
Bacterial arsenic metabolism is a topic of interest in recent years. Heavy metals are abundant in thermal waters. There is little to be known about the arsenic-resistant bacteria isolated from the surface waters contaminated by thermal waters of İzmir Balçova. The aim of this study is to identify these bacteria and apply the arsenic metabolism experiments in the literature in order to obtain prospective data. In this study, twelve bacteria identified which can grow on PCA containing 500 mM arsenate. Isolates which phenotypic characterizations are determinated with Api 50 CH and Api 20 E, identified according to partial 16S rDNA sequence as Rhodococcus sp., Pannonibacter phragmitetus, Micrococcus yunnanensis, Enterobacter sp., Microbacterium sp and other seven isolate identified as Pseudomonas sp. By using LB broth, high value of arsenic MICs detected. For arsenic detoxification genes; arsA PCR products are detected on three strains, arsB PCR products are detected on six strains; ars C PCR products are detected on seven strains; arsD PCR products are detected on eight strains; arsM PCR products are detected on three strains; arsH PCR products are detected on eleven strains; arsR PCR product is detected on only Enterobacter sp. strain L. For respiratory arsenate reductase genes; arrA is detected on Pseudomonas sp. strain I and arrB is detected on five Pseudomonas sp. strains. Silver nitrate experiment is positive for all isolates which can grow on CDM except a Pseudomonas sp. strain G. This study is pioneer in about arsenic metabolism experiments on bacteria which are isolated from Turkey. This study generates data for pointing out micro pollutants and developing methods of arsenic metabolism experiments in literature.
Benzer Tezler
- Gebe kadınların süt ve süt ürünleri ile ilgili bilgi düzeylerinin ve tüketim durumlarının belirlenmesi
Determination of knowledge level and consumption status of pregnant women about milk and dairy products
SENCER TAŞKIN
Yüksek Lisans
Türkçe
2020
Gıda MühendisliğiTekirdağ Namık Kemal ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ BİNNUR KAPTAN
- Balçova kaplıcalarının (İzmir) jeokimyasal özellikleri ve alanın jeotermal enerji kaynakları
Başlık çevirisi yok
SERVET YILMAZER
- Balçova ilçesi ve çevresinin aktif tektoniği ve depremselliği: Jeolojik ve sismolojik verilerin karşılaştırılması
Active tectonics and seismicity of Balçova district and surrounding: Comparison of geologic and seismological data
İRFAN RAMAZANOĞLU
Yüksek Lisans
Türkçe
2008
Jeoloji MühendisliğiDokuz Eylül ÜniversitesiUygulamalı Jeoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HASAN SÖZBİLİR
- Balçova Barajı (İzmir) civarı unkurtları (Ordo: Coleoptera; familya; Tenebrionidae) faunası
Başlık çevirisi yok
BEKİR KESKİN
- Numerical modeling of Balçova geothermal field
Balçova jeotermal sahasının sayısal modellenmesi
CAN POLAT
Yüksek Lisans
İngilizce
2010
Petrol ve Doğal Gaz MühendisliğiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiPetrol ve Doğal Gaz Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MAHMUT PARLAKTUNA
PROF. DR. SERHAT AKIN