Fasulye (Phaseolus vulgaris L.) bitkisinde genotyping by sequencing (GBS) metodunu kullanarak populasyon yapısının belirlenmesi
Determination of population structure by using genotyping by sequencing (GBS) in common bean (Phaseolus vulgaris L.)
- Tez No: 479763
- Danışmanlar: PROF. DR. MUHAMMED BAHATTİN TANYOLAÇ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2017
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ege Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 74
Özet
Bu çalışmada, Türkiye ve farklı ülkelerden toplanmış, 173 adet Phaseolus vulgaris genotipleri arasındaki genetik çeşitliliğin ve popülasyon yapısının Genotyping by Sequencing (GBS) metodu ile belirlenmesi amaçlanmıştır. Bu çalışma ile ilk kez fasulyede GBS metodu kullanılmıştır. GBS metodu ile fasulye genomunda bulunan Single Nucleotide Polymorphism (SNP) markırları saptanmıştır. GBS analizi sonucunda 1500 SNP elde edilmiştir. Markırların ortalama PIC değeri 0,2 olarak tespit edilmiştir. SNP markırları kullanılarak STRUCTURE programında popülasyon yapısı belirlenmiştir ve 173 genotip kendi arasında 3 guruba (K=3) ayrılmıştır. Elde edilen bulgulara göre Andean ve Mezoamerikan gruplarına başarılı bir şekilde ayrıldığı görülmüştür. Fasulyede ilk kez yüksek yoğunluklu markır kullanılarak genetik çeşitlilik analizi gerçekleştirilmiştir.
Özet (Çeviri)
The aim of this study was to determine genetic diversity among genotypes and population structure by using Genotyping by Sequencing (GBS) in common bean (Phaseolus Vulgaris L.) . In this study, x173 different genotypes from different regions of World were used. This is the first usage of GBS in common bean. We scored 1500 SNP's by using GBS method. Population structure was determined using STRUCTURE software and mainly three groups (K=3) were identified among 173 common bean genotypes. PIC value was determined as 0,2 . Overall Andean and Mezoamerican gene pools were succesfuly distinguish the population structure of common bean.
Benzer Tezler
- Bor toksik koşullarda çinko uygulamasının fasulye (Phaseolus vulgaris L.) bitkisinin gelişimi üzerine etkisi
Effect of zinc application on the development of bean (Phaseolus vulgaris L.) plant in boron toxic conditions
ERYİĞİT EMREM
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
ZiraatSelçuk ÜniversitesiToprak Bilimi ve Bitki Besleme Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MEHMET HAMURCU
- Bazı fasulye (Phaseolus vulgaris L.) çeşitlerinde Pseudomonas syringae pv. phaseolicola ve Xanthomonas campestris pv. phaseoli'ye dayanıklılığın belirlenmesi
Determination of resistance against Pseudomonas syringae pv. phaseolicola and Xanthomonas campestris pv. phaseoli in some bean (Phaseolus vulguras L.) genotypes
DURSUN AKBAŞ
- Fasulye (Phaseolus vulgaris L.) bitkisinde demir (Fe) ve çinko (Zn) birikiminin değerlendirilmesi için metal iyon taşıma proteinlerinin tanımlanması ve gen ifade analizi
Gene expression and identification of metal ion transport proteins to assess iron (Fe) and zinc (Zn) accumulation in common bean (Phaseolus vulgaris L.)
HİLAL YILMAZ
Doktora
Türkçe
2022
BiyoteknolojiBolu Abant İzzet Baysal ÜniversitesiTarla Bitkileri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. VAHDETTİN ÇİFTÇİ
DOÇ. DR. FAHEEM SHAHZAD BALOCH
- Fasulye (Phaseolus vulgaris L.) bitkisinde Yabby ve Dof genlerinin kuraklık stresi ile olan ilişkilerinin salisilik asit etkisiyle karşılaştırmalı olarak gen ifadesi düzeyinde incelenmesi
Investigation of the Yabby and Dof transcription factors at gene expression level during drought stress conditions in Phaseolus vulgaris L. and the effect of salicylic acid
ARZU GİZEM KIRICI
- Fasulye (Phaseolus vulgaris L.) bitkisinde WOX gen ailesi üyelerinin genom düzeyinde tanımlanması ve tuz stresi sırasında ifade profilleri
Genome-wide identification of WOX gene family members in Phaseolus vulgaris L. and their expression profiling during salt stress
SİMAY EZGİ AKBULUT