Investigation of the effects of SIV AGM Tat protein on SLPI gene expression in primate cells
SIV AGM Tat proteininin primat hücrelerindeki salgısal lökosit proteaz inhibitörü geni ifadelenmesi üzerindeki etkisinin incelenmesi
- Tez No: 482471
- Danışmanlar: DOÇ. DR. ALPER ARSLANOĞLU
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Genetik, Mikrobiyoloji, Genetics, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2017
- Dil: İngilizce
- Üniversite: İzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü
- Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 71
Özet
Afrika Yeşil maymunu (AYM) gibi Eski Dünya maymunları HIV-1'e karşı dirençlidirler. Türlerine spesifik simian bağışıklık yetmezlik virüsü (SIV) ile enfekte olabilmelerine rağmen AIDS benzeri bir sendrom geliştirmezler. Bazı restriksiyon faktörlerinin, HIV-1 replikasyonunu engelleyerek bu organizmaları enfeksiyona karşı koruduğu bilinmektedir. Eski Dünya maymunları hücreleri çok yüksek viral yük kullanıldığında, başarılı bir şekilde enfekte edilebilmelerine rağmen, bu hücrelerde virüs sayısının zamanla saptanamayacak seviyelere düşmesi, bu hücrelere dirençlilik sağlayan henüz tanımlanmamış restriksiyon faktörlerinin varlığını göstermektedir. Eski Dünya maymunları viral proteinlerin üretimine karşılık olarak bazı genlerinin ekspresyonlarını değiştirerek bir direnç mekanizması oluşturmuş olabilirler. HIV-1 Tat, virüsün hücre içine girişinden sonra üretilen ilk viral protein olduğundan ve diğer HIV-1 proteinlerinin sentezlenmesi için varlığı gerekli olduğundan, bu maymunların geliştirdiği direnç mekanizmasında önemli bir rol oynaması mümkündür. Laboratuarımızda yapılan ön çalışmalarda, antiproteaz, antimikrobiyel ve antiviral aktivitesi olan Salgısal Lökosit Proteaz Inhibitor (SLPI) proteini olası bir restriksiyon faktörü olarak belirlenmiştir ve AYM hücrelerinde HIVtat varlığında bu proteinin aşırı ifadelendiği gözlemlenmiştir HIV ve SIV tat genlerinin işlevleri benzer olduğu halde, aminoasit dizilimleri çok farklıdır (≈%40 benzerlik). Bu nedenle HIV-1 Tat ve SIV-Tat proteinlerinin SLPI geni ifadelenmesine etkileri farklı olabilir. Bu çalışma AYM hücrelerinde SIV AYM Tat proteininin SLPI üretimine etkisini incelemeyi amaçlamaktadır. Bu amaçla, SIV tat genini kalıcı olarak ifadeleyen AYM hücrelerinde SLPI ifadelenmesi Q-PCR ve Western blotlama yöntemleriyle incelenmiştir. SIV Tat varlığında SLPI ifadelenmesi belirgin olmayan bir şekilde azalırken, HIV Tat varlığında anlamlı bir artış gözlemlenmiştir.
Özet (Çeviri)
Old World monkeys one of which is African Green monkey (AGM) have resistance against to HIV-1. They can be infected by species-specific simian immunodeficiencyviruses(SIV),howevertheydonotdevelopAIDS-likesyndrome. Thereareseveral restriction factors already known that prevent HIV-1 replication protecting these organisms from infection. However, although Old World monkey cells can be successfully infected with HIV-1 by using high viral loads, the virus eventually become undetectable, indicating the presence of yet unidentified anti HIV-1 factor(s) that confer resistance to these cells. Old world monkeys may have evolved resistance mechanisms by switching specific genes on in response to the synthesis of viral proteins. Since HIV-1 Tat protein is the first viral protein synthesized after viral entry and its presence is required for the synthesis of other HIV-1 proteins, it may also play an important role on the activation of such resistance mechanism. In the previous studies conducted in our laboratory, Secretory Leukocyte Protease Inhibitor (SLPI) which is a 11,7 kDa protein with antiprotease, antimicrobial and antiviral activities was identified as a candidate restriction factor. It was observed to be overexpressed in AGM cell lines in the presence of HIV tat. Although, HIV Tat and SIV Tat have similar functions in the infected cells, they are highly dissimilar in their aminoacid composition (≈40% similarity). Therefore the effects of HIV-1 Tat and SIV Tat on SLPI gene expression might be different. The aim of this study was to investigate the effects of SIV agm Tat on SLPI expression in AGM cells. For this purpose, CV-1cell lines stably expressing SIVtat gene were established and the expression of SLPI was determined by Q-PCR and Western blotting. A slight decrease in SLPI expression in stable monkey cells that express SIV Tat was observed while HIV Tat expressing stable cells showed SLPI overexpression.
Benzer Tezler
- Investigation of the effects of HIV-1 and SIV AGM TAT proteins on SLPI gene expression in Chlorocebus sabaeus kidney (Vero) cell line
Chlorocebus sabaeus böbrek (vero) hücre hattında HIV-1 ve SIV AGM TAT proteinlerinin SLPI gen ekspresyonu üzerindeki etkisinin araştırılması
AYSU ÖZKAN
Yüksek Lisans
İngilizce
2017
Genetikİzmir Yüksek Teknoloji EnstitüsüMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ALPER ARSLANOĞLU
- Karaciğer nakli olacak hastalara video destekli verilecek eğitimin semptom yönetimine etkisinin incelenmesi
Investigation of the effect of training on symptom management of video-supported patients with liver transplantation
ELİF GÜVENÇ
- Uyku yetersizliğinin anaerobik performans ve toparlanma sürecine etkisinin incelenmesi
Investigation of the effects of sleep deprivation on anaerobic performance and recovery process
KUTLU AYDIN
Doktora
Türkçe
2014
SporAbant İzzet Baysal ÜniversitesiAntrenörlük Eğitimi Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. ÜMİD KARLI
- Beslenmenin hipotalamik kontrolünde irisin hormonunun etkilerinin araştırılması
Investigation of the effects of irisin hormone on the hypothalamic control of feeding
SUAT TEKİN
- Ratlarda gebelik süresince uygulanan akrilamidin fetal beyin gelişimine etkilerinin ve E vitamini'nin koruyucu rolünün araştırılması
Investigation of the effects of acrylamide, administered during pregnancy on the fetal brain development and protective role of vitamine E in rats
MEHMET ERMAN ERDEMLİ
Doktora
Türkçe
2015
Anatomiİnönü ÜniversitesiTıbbi Biyokimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. YUSUF TÜRKÖZ
YRD. DOÇ. DR. ZÜMRÜT DOĞAN