Investigation of the effects of HIV-1 and SIV AGM TAT proteins on SLPI gene expression in Chlorocebus sabaeus kidney (Vero) cell line
Chlorocebus sabaeus böbrek (vero) hücre hattında HIV-1 ve SIV AGM TAT proteinlerinin SLPI gen ekspresyonu üzerindeki etkisinin araştırılması
- Tez No: 482472
- Danışmanlar: DOÇ. DR. ALPER ARSLANOĞLU
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Genetik, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2017
- Dil: İngilizce
- Üniversite: İzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü
- Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 78
Özet
İnsan Bağışıklık Yetmezliği Virüsü (HIV) Eski Dünya Maymunu (örneğin Afrika Yeşil Maymunu) hücrelerine girse bile, virüsün çoğalması viral genom konakçı hücre genomuna entegre olmadan çeşitli engelleyici mekanizmalarla engellenir. Konakçı genomuna viral genomun entegre olmasından sonra, virüs çoğalmasında diğer proteinlerin ortaya çıkmasında önemli rol oynayan HIV-1 TAT protein eksprese edilir.. Laboratuvarımızda gerçekleşen önceki çalışmalar SLPI geninin HIV-1 TAT protein varlığında çok fazla eksprese olduğu göstermiştir. Bu sonuç, 2D-PAGE, qRT-PCR ve Western Blot yöntemleriyle doğrulanmıştır. Bu çalışmanın amacı, HIV-1 TAT protein üreten, transfekte edilmis ¸ Vero stabil Hücre Hatlarında SLPI ekspresyon seviyesinin nasıl etkilendiğini anlamaktır. SLPI ekspresyonu mRNA seviyesinde qRT-PCR ile doğrulanmıştr. HIV-1 TAT varlığında SLPI ekspresyon seviyesinin protein seyiyesinde ölçmek için Western Blot, Sandwich Elisa yöntemleri kullanılmıştır. SLPI HIV-LTR üzerindeki etkisini ölçmek için Lüsiferaz Analizi yapılmıştır. Sonuç olarak, transfekte edilmis ¸ Vero Stabil Hücre Hatları'nda SLPI ekspresyonu HIV-1 TAT proteini varlığında artar. Buna ek olarak, SLPI HIV-LTR işlevini HIV-LTR içinde bulunan NF-κB promotorunu baskılayarak engeller.
Özet (Çeviri)
Even though Human Immunodeficiency Virus (HIV) can infect Old World Monkey (i.e African Green Monkey) cells, replication of the virus is hampered with different kinds of restriction mechanisms before the integration of viral genome to host genome. After viral integration to host genome, HIV-1 TAT protein is expressed, which plays an important role for the generation of other proteins for viral production. Previous studies which were performed in our laboratory indicate that Secretory Leukocytes Protease Inhibitor (SLPI) overexpressed in existence of HIV-1 TAT protein. This result was confirmed with 2D-PAGE, qRT-PCR and Western Blot Analysis. The aim of this study is to understand how Vero Stable Cell Lines which produces HIV-1 TAT protein can affect expression levels of SLPI. At mRNA level of SLPI expression was confirmed with qRT-PCR. In order to measure SLPI expression at the protein level in the presence of HIV-1 TAT, Western Blot and Sandwich Elisa methods were used. Luciferase Assay process was performed in order to measure the effects of SLPI on HIV-LTR. Consequently, expression of SLPI in Vero Stable Cell Line increased in the existence of HIV-1 TAT protein. Additionally, SLPI inhibits HIV-LTR function through suppressing NF- κB promoter which exists in HIV-LTR.
Benzer Tezler
- Investigation of the effects of SIV AGM Tat protein on SLPI gene expression in primate cells
SIV AGM Tat proteininin primat hücrelerindeki salgısal lökosit proteaz inhibitörü geni ifadelenmesi üzerindeki etkisinin incelenmesi
DİLARA DEMİRCİ
Yüksek Lisans
İngilizce
2017
Genetikİzmir Yüksek Teknoloji EnstitüsüMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ALPER ARSLANOĞLU
- İnsan bağışıklık eksikliği virusu (HIV) ile infekte kişilerde insan pegiviruslarının (HPgV) sıklığının ve genotip çeşitliliğinin araştırılması
Investigation of frequency and genotype diversity of human pegiviruses (HPgV) in people infected with human immunodeficiency virus (HIV)
EBRU YÜCEBAĞ
Yüksek Lisans
Türkçe
2020
Mikrobiyolojiİstanbul Üniversitesi-CerrahpaşaTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. KENAN MİDİLLİ
- Investigation of the effects of HIV-1 regulatory genes on African green monkey cell lines
HIV-1 regülatör genlerinin Afrika yeşil maymunu hücre hatları üzerindeki etkilerinin araştırılması
BURCU ŞENGEZ SÜNBÜL
Yüksek Lisans
İngilizce
2010
Biyoteknolojiİzmir Yüksek Teknoloji EnstitüsüMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. ALPER ARSLANOĞLU
- Investigation of the effects of HIV-1 tat gene on the expression of Secretory Leucocyte Protease Inhibitor in Primate Cell Lines.
HIV-1 tat geninin, primat hücrelerindeki salgısal lekosit proteaz inhibitörünün ifadelenmesi üzerine olan etkisinin incelenmesi.
SELÇUK ÖZDEMİR
Doktora
İngilizce
2015
Genetikİzmir Yüksek Teknoloji EnstitüsüMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ALPER ARSLANOĞLU
- HIV-1 T transaktivasyonunun antisens oligonükleotid teknolojisi kullanılarak inhibe edilmesi
Inhibition of HIV-1 transactivation by antisense olignucleotide technology
ÖMER FARUK ARICI
Doktora
Türkçe
2015
Eczacılık ve FarmakolojiErciyes ÜniversitesiEczacılık Biyokimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. İLHAN DEMİRHAN