Geri Dön

Kolorektal kanser hastalarında APC ve K-RAS genleri ile ilişkili miRNA ekspresyonlarının incelenmesi

Investigation of miRNA expressions associated with APC and krasgenes in colorectal cancer patiens

PDF İndir

  1. Tez No: 482879
  2. Yazar: NESİBE YILMAZ
  3. Danışmanlar: PROF. DR. HAYRİYE ARZU ERGEN
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Moleküler Tıp, Molecular Medicine
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2017
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: İstanbul Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Moleküler Tıp Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 110

Özet

Kolorektal kanser tüm dünyada en sık görülen kanser türlerinden biridir. Kolorektal kanser gelişiminde önemli patojenik yollardan biri adenomatöz polipozis koli (APC)/β- katenin yoludur. Bu yolda ilk olarak APC tümör baskılayıcı geninin mutasyonu, ardından tipik olarak K-ras mutasyonu, 18q21'deki kanser baskılayıcı geninin delesyonu ve son olarak bir tümör baskılayıcı gen olan tümör protein 53 (TP53) geninin kaybı gelişir. Mikro RNA (miRNA)' lar, tek iplikli, 18-24 nükleotid uzunluğunda, protein kodlamayan, hücreler tarafından doğal olarak üretilen RNA'lardır. Hedef mesajcı RNA' ya (mRNA) bağlanarak genin ifadesini (ekspresyonunu) düzenlerler. miRNA' ların farklı kanser tiplerinde anormal ifade paternleri göstermesi, tümörigenezde önemli rol oynadıklarını akla getirmiştir. Bugüne kadar yapılan çalışmalarda kolorektal kanser gelişiminde rol oynayan APC ve K-ras genlerinin mutasyonları üzerinde durulmuş olsa da bu genlerin düzenlenme mekanizmasında yer alan miRNA' lar üzerinde geniş çaplı bir araştırma yapılmamıştır. Bu çalışmaya, kolorektal kanser tanısı almış 47 hasta ile ailesinde ve kendisinde kanser hikayesi bulunmayan 50 sağlıklı birey dahil edildi. Hasta grubundaki bireylerin serum, tümör ve tümör içermeyen dokularındaki ve sağlıklı kişilerin serumlarındaki miR-27, miR-663, miR-217, miR-181d' nin ve APC ile K-ras genlerinin ekspresyon düzeyleri qRT-PCR yöntemiyle incelendi Verilerimiz, miR-217, mR-181d, miR-663, miR-27 ve K-ras ifadelerinin kolorektal kanser dokularında normal dokulardan daha yüksek olduğunu gösterdi. APC geni ifadesi normal dokularda daha yüksek bulundu (p = 0,007; % 95 CI = 0,47-2,95). Kolorektal kanser hastalarının serum örneklerinde sağlıklı kontrollere göre miR-663 düzeyleri istatistiksel olarak artmıştı (p = 0,02; % 95 CI = 0,16-2,14). Kolorektal kanserli dokularda, miR-217, miR-181d ve miR-27 düzeyleri daha yüksek bulunurken (p = 0,004; p = 0,001 ve p = 0,001 sırasıyla), hastaların serum örneklerinde miR-663 seviyeleri daha yüksek bulundu (p = 0,02). Tümör dokularında artmış miR-27 ve miR-663 ekspresyon seviyelerinin, tümör dokularında azalmış olan APC geni ifadeleri ile ilişkili olduğu sonucuna varılmıştır. Tümör baskılayıcı gen olan APC'nin ifadesini baskılayan miR-27 ve miR-663'ün kolorektal kanser gelişiminde onkojenik miRNA'lar olarak rol oynadığı söylenebilir. Ayrıca, tümör dokuda artan miR-181d, miR-217 ve K-ras ifade seviyelerinin kolorektal kanser gelişiminde rol oynadığı düşünülmektedir.

Özet (Çeviri)

Colorectal cancer is one of the most common cancers throughout the world. One of the important pathogenic pathways in the development of colorectal cancer is adenomatous polyposis coli (APC)/β-catenin pathway. Mutation in the APC tumor suppressor gene occurs at first in this pathway, typically followed by K-ras mutation, deletion of cancer suppressor gene at 18q21, and finally loss of tumor protein 53 (TP53) gene which is a tumor suppressor gene. MicroRNAs (miRNAs) are produced by cells naturally, singlestranded, non-coding RNAs of 18-24 nucleotides in length. They regulate gene expression by binding to its target messenger RNA (mRNA). The abnormal expression patterns of miRNAs in different cancer types suggest that they play key roles in tumorigenesis. Although mutations in APC and K-ras genes which play a role in the development of colorectal cancer were emphasized in the studies carried out so far, miRNAs that are involved in the regulation of those genes were not investigated extensively. Forty seven patients with colorectal cancer and 50 healthy individuals who did not have a cancer history were included in this study. In the serum, tumor and non-tumoral tissues of colorectal cancer patients and serum of healthy subjects, expression levels of miR-27, miR-663, miR-217, miR-181d, and APC and K-ras genes were detected by qRT-PCR. Our data showed that the expressions of miR-217, mR-181d, miR-663, miR-27 and Kras were higher in colorectal cancer tissues than normal tissues. The APC gene expression was found higher in normal tissues (p=0,007; %95 CI=0,47-2,95). miR-663 levels were statistically increased in sera samples of colorectal cancer patients according to the healty controls (p=0,02; %95 CI=0,16-2,14). While miR-217, miR-181d and miR-27 levels were found higher in colorectal cancer tissues (p=0,004; p=0,001 and p=0,001; respectively), miR-663 levels were found higher in sera samples of patients (p=0,02). We concluded that, the expression levels of miR-27 and miR-663 increased in tumor tissues are related tuo APC gene expressions which is decreased in tumor tissues.It can be said that miR-27 and miR-663, which suppress the expression of the APC gene, the tumor suppressor gene, can function as oncogenic miRNAs in the development of colorectal cancer. Also, it is thought that miR-181d, miR-217 and K-ras expression levels increased in tumor tissue plays role in the development of colorectal cancer.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    692010

    Investigation of p53 gene polymorphisms in colorectal cancer

    Kolorektal kanserde p53 gen polimorfizmlerinin araştırılması

    HÜSEYİN AYHAN

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2021

    Moleküler TıpYeditepe Üniversitesi

    Moleküler Tıp Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. TURGAY İSBİR

  2. Tez No

    750364

    Kolorektal adenokarsinom tanılı olgularda yeni nesil dizileme ile saptanan mutasyon profili ve klinikopatolojik korelasyonu

    Mutation profile determined by NGS and clinicopathological correlation in colorectal adenocarcinoma cases

    SİBEL OSMAN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    PatolojiAdnan Menderes Üniversitesi

    Tıbbi Patoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. İBRAHİM METEOĞLU

  3. Tez No

    534139

    Mutational spectrum of the Turkish hereditary breast and colon cancer patients

    Türkiye'deki kalıtsal meme ve kolon kanseri hastalarında mutasyon spektrumu

    ELİFNAZ ÇELİK

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2018

    Biyoteknolojiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. GİZEM DİNLER DOĞANAY

  4. Tez No

    632546

    Effect of doxorubicin and microrna-140-3p on pd-L1 expression in colon cancer

    Kolon kanserinde doxorubıcın ve mıcrorna-140-3p'nin pd-L1 ifadesine olan etkisi

    NOEL MOPOUGUINI NABA

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2020

    Allerji ve İmmünolojiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    Assoc. Prof. Dr. AYÇA SAYI YAZGAN

  5. Tez No

    639585

    Adenomatöz polipozis koli geni negatif polipozis koli olgularının moleküler genetik yöntemler ile miyozin ağır zincir mutasyonları açısından değerlendirilmesi

    Evaluation of adenomatous polyposis coli gene negative polyposis coli patients in terms of myosin heavy chain mutations using molecular genetic methods

    FİRDEVS ÖZDEMİR

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    GastroenterolojiFırat Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MEHMET YALNIZ

Geri Dön