Trail gen varyantlari ve gen anlatim düzeylerinin küçük hücreli dişi akciğer kanserli hastalarda i̇ncelenmesi
Investigation of trail gene variants and gene expression levels in the NON-small cell lung cancer patients
- Tez No: 482878
- Danışmanlar: PROF. DR. İLHAN YAYLIM
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyokimya, Moleküler Tıp, Biochemistry, Molecular Medicine
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2017
- Dil: Türkçe
- Üniversite: İstanbul Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Tıp Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 146
Özet
Kansere bağlı ölümlerin en önde gelen nedeni olan akciğer kanseri multifaktöriyel bir hastalıktır. Küçük hücreli dışı akciğer kanseri (KHDAK) tüm akciğer kanserlerinin %80-85'ini oluşturmaktadır. Akciğer kanserini de içeren birçok kanser tipinin patogenezinde apoptozun düzenlenmesi ya da inhibe edilmesindeki bozukluklar rol oynamaktadır. Apoptoz mekanizmasında önemli bir molekül olan tümör nekroz faktör ile ilişkili apoptoz uyarıcı ligand (TRAIL) birçok tümör hücre tipinde apoptozu uyarır fakat normal hücreler TRAIL aracılı apoptoza duyarlı değildir. Bizim bu çalışmadaki amacımız, KHDAK'li hastalarda TRAIL moleküler yolağındaki gen polimorfizmlerinin ve TRAIL gen anlatım düzeylerinin araştırılması ve bu değerlerin aralarındaki olası bir ilişkinin hastalığın etyopatogenezi ve prognozu üzerine etkili olup olmadığına açıklık getirilmesidir. Çalışmada, TRAIL geninde 5. ekzonun 3'-kodlanmayan bölge (3'-UTR) C1595T pozisyonundaki tek nükleotid polimorfizmleri PZR-RFLP teknikleri kullanılarak belirlenmiştir. TRAIL gen anlatım düzeylerinin saptanması için, tümörlü doku ve tümörün çevre doku örneklerinden izole edilen RNA'lardan cDNA elde edilmiş ve gerçek zamanlı PZR tekniği uygulanmıştır. TRAIL genotipleriyle KHDAK yatkınlığı ve KHDAK'nin prognostik parametreleri arasında anlamlı bir ilişki bulunamamıştır. Ancak, hastalarda TRAIL geni C1595T varyantının CT genotipi sıklığının diğer genotiplere göre düşük olduğu gözlemlenmiş ve fark istatistiksel anlamlılığa oldukça yakın bulunmuştur (p=0,07). KHDAK hastalarının TRAIL gen anlatım düzeylerinin tümör dokusu grubunda kontrol grubuna oranla anlamlı olarak 28,8 kat azaldığı belirlenmiştir (p=0,026). Hastalar tümör evresine göre karşılaştırıldığında, ileri tümör evresinde TRAIL gen anlatımının erken tümör evresine göre anlamlı olarak 7,86 kat daha yüksek olduğu belirlenmiştir (p=0,028). TRAIL gen anlatım düzeyleriyle TRAIL geni C1595T varyantının genotipleri arasında anlamlı bir farklılık saptanmamıştır. Bu sonuçlar, TRAIL'in KHDAK gelişiminde önemli bir rol oynayabileceğini ve tümör gidişatında etkili potansiyel bir prognostik faktör olabileceğini öne sürmektedir.
Özet (Çeviri)
Lung cancer is a multifactorial disease that is the leading cause of cancer-related deaths. Non-small cell lung cancer (NSCLC) accounts for 80-85% of all lung cancers. Disorders in regulation or inhibition of apoptosis have been played role in the pathogenesis of many of cancer types including lung cancer. The tumor necrosis factor-related apoptosis-inducing ligand (TRAIL), an important molecule in the apoptosis mechanism, induces apoptosis in many tumor cell types, but normal cells are not susceptible to TRAIL-mediated apoptosis. Our purpose in this study is to investigate the critical gene polymorphisms in TRAIL molecular pathway and TRAIL gene expression levels in non-small cell lung cancer patients and to clarify whether the effect on the pathogenesis and prognosis of disease of a possible relationship between these values. In the study, single nucleotide polymorphisms at position C1595T of the 3'-untranslated region (3'-UTR) of exon 5 in the TRAIL gene were determined using PCR-RFLP techniques. To determine TRAIL gene expression levels, cDNA from RNAs isolated from tumor tissue and tumor surrounding tissue samples was obtained and real time PCR technique was applied. No significant relationship was found between NSCLC predisposition and prognostic parameters of NSCLC with TRAIL genotypes. On the other hand, the frequency of TRAIL gene 1595 CT genotype was observed to be lower in the patients compared to the other genotypes, and the difference was found to be very close to statistical significance (p=0.07). TRAIL gene expression levels of NSCLC patients were detected significantly 28.8 fold decrease in the tumor tissue group compared to the control group (p=0.026). When patients were compared to tumor stage, expression of TRAIL gene in advanced tumor stage was found to be significantly 7.86 fold higher than early tumor stage (p=0.028). Furthermore, no significant difference was determined between TRAIL gene expression levels and genotypes of the TRAIL gene C1595T variant. These results suggest that TRAIL may play an important role in the development of NSCLC and may be a potential prognostic factor in tumor progression.
Benzer Tezler
- Mide kanserli olgularda TRAIL ve TRAIL-DR4 gen polimorfizmlerinin ve TRAIL serum düzeylerinin araştırılması
Distribution of TRAIL and TRAIL-dr4 gene variants in gastric cancer patients
NAZLI YANIK
Doktora
Türkçe
2021
Moleküler Tıpİstanbul ÜniversitesiMoleküler Tıp Ana Bilim Dalı
PROF. DR. İLHAN YAYLIM
- An investigation of genetic factors in soft tissue injuries and muscle types within football players
Futbol oyuncularindaki yumuşak doku yaralanmalarinda ve kas tiplerinde genetik faktörlerin incelenmesi
YASEMİN ÜK
Yüksek Lisans
İngilizce
2022
Biyoistatistikİzmir Yüksek Teknoloji EnstitüsüBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. EFE SEZGİN
- Kahramanmaraş ilinde alfa talasemi genotipleri
Alpha thalassemia genotyps in Kahramanmaras
PERİHAN SÜMER
Yüksek Lisans
Türkçe
2016
BiyokimyaKahramanmaraş Sütçü İmam ÜniversitesiTıbbi Biyokimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ERGÜL BELGE KURUTAŞ
- Konjenital hipotiroidizmde yeni nesil dizileme ile hedeflenmiş gen mutasyon taraması
Gene mutation screening in congenital hypothyroidism by targeted next generation sequencing
CENGİZ KARA
Doktora
Türkçe
2021
Endokrinoloji ve Metabolizma HastalıklarıOndokuz Mayıs ÜniversitesiMoleküler Tıp Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AYHAN DAĞDEMİR
- Metilentetrahidrofolat redüktaz mutasyonlarının real time PCRile belirlenmesi
Determination of methylentetrahydrofolat reductase mutations by real-time PCR
ONUR ALBAYRAK
Yüksek Lisans
Türkçe
2010
BiyokimyaÇukurova ÜniversitesiTıbbi Biyokimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. M. AKİF ÇÜRÜK