Klinik örneklerden izole edilen trichosporon asahii türü mantarların genotiplendirilmesi ve antifungal duyarlılığının belirlenmesi
Genotyping and antifungal susceptibility of trichosporon asahii strains isolated from the clinical samples
- Tez No: 487608
- Danışmanlar: PROF. DR. NİLGÜN ÇERİKÇİOĞLU
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2017
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Marmara Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 54
Özet
Amaç: Trichosporon asahii mortalitesi yüksek ve son yıllarda sıklığı giderek artan enfeksiyonlara yol açmaktadır. Bu çalışmanın amacı hastanemizde izole edilen kökenlerin genotiplendirilmesi ve antifungal duyarlılık profillerinin belirlenmesidir. Gereç ve Yöntem: 2006-2016 yılları arasında klinik örneklerden izole edilen 70 adet T. asahii kökeninin IGS1 gen bölgesine göre dizi analizi yapılmış ve kökenlerin genotipleri belirlenmiştir. Bu kökenlerin amfoterisin B, flukonazol, vorikonazol ve posakonazole karşı duyarlılıkları sıvı mikrodilüsyon yöntemi ile çalışılmıştır. Bu iki parametre ile ilgili sonuçlar karşılaştırılarak istatistiksel analizler yapılmıştır. Bulgular: İzolatlar arasında en fazla genotip 1 (%77,1) saptanırken genotip 3, 4 ve 5 de bulunmuştur. Genotip 4'e ait kökenler 2014-2016 yılları arasında kümelenmiştir. Kökenler en fazla (%88,6) idrardan izole edilmiştir. Kökenlerin %70'inde amfoterisin B MİK'i ≥ 2 μg/ml ve MİK geometrik ortalamaları flukonazol için 2,019; vorikonazol ve posakonazol için 0,107 μg/ml olarak saptanmıştır. Flukonazol, vorikonazol ve posakonazol MİK GM'sine göre bu iki genotip arasında anlamlı farklılık bulunurken (p≤0,05), amfoterisin B açısından anlamlı bir farklılık saptanmamıştır (p>0,05). Sonuçlar: Yaptığımız tek merkezli çalışma ile Türkiye'de en fazla genotip 1 bulunduğu doğrulanmıştır. Genotip 4'ün son yıllarda artış eğilimi gösterdiği görülmüştür. Kökenlerimizde literatürle uyumlu olarak amfoterisin B ve flukonazol için yüksek MİK değerleri saptanırken, kullanılabilecek en aktif ilaçlar vorikonazol ve posakonazol olarak belirlenmiştir.
Özet (Çeviri)
Aim: Trichosporon asahii infections with high mortality are getting increased in frequency in recent years. The purpose of this study was genotyping and determining the antifungal susceptibility profiles of the strains isolated in our hospital. Materials and Methods: Gene sequencing analysis of 70 T. asahii strains isolated between 2006-2016 from the clinical samples was done according to their IGS1 region and the genotypes of the strains were determined. The susceptibilities of these strains for amphotericin B, fluconazole, voriconazole and posaconazole was studied by using broth microdilution method. By comparing the results of the two parameters statistical analyses were done. Results: Among the isolates mostly encountered genotype 1 (77.1%) other isolates of T. asahii belonged to genotype 3, 4 and 5. The isolation of genotype 4 strains were accumulated between 2014 and 2016. Most of the isolates were recovered from urine samples (88.6%). In 70% of the strains amphotericin MIC was ≥2 μg/ml and MIC GM detected for fluconazole was 2.019; for voriconazole and posaconazole was 0.107 µg/ml. According to fluconazole, voriconazole and posaconazole MIC GMs the difference between the two genotypes was significant (p≤ 0.05), but there was no significant difference for amphotericin B (p> 0.05). Conclusion: According to our single center study it was confirmed that genotype 1 was the most frequently isolated genotype in Turkey. The frequency of genotype 4 was shown to have a tendency to increase in recent years. In our strains high MIC values were detected for amphotericin B and fluconazole in accordance with the literature, while voriconazole and posaconazole were determined to be the most active drugs for the strains tested.
Benzer Tezler
- Klinik örneklerden izole edilen Trıchosporon.asahii suşlarında Triazol grubu antifungal ilaçların inhibitör ve fungisidal aktivitelerinin farklı yöntemlerle araştırılması
Evaluation of inhibitor and fungicidal activities of triazoles against clinical isolates of t.asahii by different methods
GÜLŞEN HAZIROLAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2010
MikrobiyolojiHacettepe ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SEVTAP ARIKAN AKDAĞLI
- Klinik örneklerden izole edilen candida, trichosporon, geotrichum ve rhodotorula kökenlerinin dna dizi analizi yöntemli ile tanımlanması
Identification of candida, trichosporon, geotrichum and rhodotorula strains that are isolated from the clinical samples by DNA sequencing analysis method
MERVE AYDIN
Doktora
Türkçe
2012
MikrobiyolojiGazi ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SEMRA KUŞTİMUR
- Hastanede yatan hastaların klinik örneklerinden izole edilen Trichhosporon asahii kökenlerinde bazı virulans faktörlerinin araştırılması
Investigation of some virulence factors of Trichosporon asahii strains isolated from the clinical samples of hospitalized patients
AYLİN DAĞ
Yüksek Lisans
Türkçe
2005
MikrobiyolojiMarmara ÜniversitesiMikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ.DR. NİLGÜN ÇERİKÇİOĞLU
- Yüzeyel mikoz infeksiyonu düşünülen hastalardan etkenlerin izolasyonu, identifikasyonu ve antifungal ilaçlara in vitro duyarlılıkları
Isolation, identification and in vitro susceptibility to antifungal drugs of the agents isolated from patients with superficial mycoses infection
NURİYE KARACA
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2002
MikrobiyolojiErciyes ÜniversitesiMikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ.DR. A. NEDRET KOÇ
- Klinik örneklerden izole edilen Trichosporon türlerinin fenotipik olarak tanımlanması, antifungal duyarlılıklarının araştırılması
Phenotypic identification of Trichosporon species isolated from clinical specimens, investigation of antifungal susceptibilities
ZEYNEP YAZGAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2017
MikrobiyolojiKahramanmaraş Sütçü İmam ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MUSA GÖGEBAKAN
PROF. DR. GÖKHAN AYGÜN