Geri Dön

Demir stresinin Schizosaccharomyces pombe hekzos taşıyıcıları üzerine etkileri

Effects of iron stress on Schizosaccharomyces pombe hexose transporter

PDF İndir

  1. Tez No: 490176
  2. Yazar: EGEMEN ÖZKAN
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. BEDİA PALABIYIK, PROF. DR. SEZAİ TÜRKEL
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Genetik, Genetics
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2018
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: İstanbul Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 53

Özet

Ökaryotlar için hayati öneme sahip olan demir iki redoks formunda bulunmaktadır. Demir kritik hücresel süreçlere dahil olan enzimlerin aktif bölgelerine bağlanan bir kofaktörken, belli koşullar altında da toksik bir ajandır. Öte yandan, ökaryotlarda temel karbon ve enerji kaynağı olan glukozun alımı ve kullanımı enerji tüketen hücresel süreçlerin sürdürülmesinde önem arz etmektedir. Hekzos taşıyıcılar bakteriden insana kadar çok çeşitli organizmalarda iyi korunmuştur. S. pombe'de 8 (ght1-ght8) hekzos taşıyıcı gen bulunmaktadır. Her bir taşıyıcının anlatımı, hücre içi ihtiyaca ve/veya çevresel hekzos tipi ve derişimine göre düzenlenmektedir. Anlatımları glukoz sinyaline göre düzenlenen hekzos taşıyıcılarının, S. pombe'de çeşitli stres faktörlerinden etkilendiğine dair literatürde yeteri kadar bulgu yer almamaktadır. Ancak, S. cerevisiae'de yüksek glukoz afiniteli hekzos taşıyıcılarından HXT2 ve HXT4'ün anlatımlarının ozmotik stresle düzenlendiği, karbon kaynağı olarak glukoz bulunduğu koşulda, aşırı demirin toksik etkisine karşın nikel ve kurşunun toksik etkisinin bulunmadığını açıklayan bazı çalışmalar bulunmaktadır. Bu tez çalışmasında ilk olarak, S. pombe yabani ırkı için demirin hafif ve orta düzeyde toksik dozları (2 mM ve 5 mM) belirlendi. Daha sonra, glukoz baskılayıcı koşulda demirin glukoz metabolizması ve hekzos taşıyıcı genlerin transkripsiyon düzeyinde anlatımlarına etkisi gerçek zamanlı polimeraz zincir reaksiyonu tekniği ile araştırıldı. Buna göre, glukoz baskılayıcı koşula rağmen artan demir stresinin glukoneogenik bir enzimi şifreleyen fbp1 geninin anlatımının artmasına; glikolitik yolağın ilk basamağını katalizleyen hekzokinaz2 enzimini şifreleyen hxk2 geninin de anlatımının düşmesine yol açtığı belirlendi. Demir stresinin S. pombe hekzos taşıyıcı genlerden ght1, ght3, ght4, ght6 ve ght7'nin anlatım düzeylerini değiştirmediği ancak, artan demir stresine bağlı olarak ght2, ght5 ve ght8 genlerinin anlatımlarının düştüğü saptandı. Bu çalışmada elde edilen bulgulardan, artan demir stresine bağlı olarak glukoz açlığı koşulunun taklit edildiği ve glikolitik akışın da yavaşlatıldığı, ayrıca bazı hekzos taşıyıcılarının (ght2, ght5 ve ght8) transkripsiyon düzeyinde anlatımlarının etkilendiği sonucuna varıldı.

Özet (Çeviri)

There are two redox forms of iron which play vital role in eukaryotic organisms. Iron is a cofactor binding to active site of enzymes which are participated in important cellular processes, but a toxic agent under certain conditions. On the other hand, intake and use of glucose, which is the main carbon and energy source in eukaryotes, is important for sustaining the energy-consuming cellular processes. Hexose transporters have been conserved in many different organisms. S. pombe has 8 (ght1-ght8) hexose transporter genes. Each transports expression is regulated depending on intracellular demand and/or environmental hexos types and their concentrations. There are not enough data in scientific literature about how S. pombe stress factors are affecting the hexose transporters expressions, which are regulated depending on glucose signaling. However, there are some studies those explaining how osmotic stress is important for regulation of high-affinity hexose transporters HXT2 and HXT4 in S. cerevisiae. In addition, it has been shown that high dose of iron displays toxic effect whereas nickel and lead have no toxic effect when glucose is the main carbon source. In this study, low and medium-level toxic effect of iron for S. pombe wild type is determined as 2 mM and 5 mM respectively. Later, effects of iron in (1) glucose represive conditions on glucose metabolism and (2) hexose transporter genes is examined with Real-Time PCR. Accordingly, despite glucose repression conditions, increasing of iron stress lead to upregulation of fbp1 gene expression, which encodes an enzyme in glyconeogenic pathway, and downregulation of hxk2 gene expression, which encodes hexokinase2 enzyme that catalyses first level of glycolytic pathway. Thus; iron stress did not change expression level some S. pombe hexose transporter genes such as ght1, ght3, ght4, ght6 and ght7 from, but downregulates some such as ght2, ght5 and ght8. According to the results of this study, it is decided depending on the excess iron stress; glucose starvation condition was imitated and glycolytic pathway was decelerated, also gene expressions at transcriptional level of some hexose transporters (ght2, ght5 and ght8) were affected.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    676265

    Schizosaccharomyces pombe'de demir stresi altında ght5 heksoz taşıyıcısının işlevsel analizi

    Functional analysis of ght5 hexose transporter under iron stress in Schizosaccharomyces pombe

    SEVİM NUR AKYÜZ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    Biyoteknolojiİstanbul Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. BEDİA PALABIYIK

    DR. ÖĞR. ÜYESİ AHMED SAYED IBRAHIM ALY

  2. Tez No

    383028

    Effect of boron and iron stress on phytosiderophore production in barley

    Arpada bor ve demir stresinin fitosiderofor üretimine etkisi

    YETKİN ÇAKA İNCE

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2015

    BiyolojiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AYŞE MERAL YÜCEL

  3. Tez No

    275542

    Anaç ve anaç özelliği olan bazı turunçgil genotiplerinde demir (Fe) klorozuna dayanıklılığın fizyolojik ve genetik yönden incelenmesi

    Investigation of genetic and physiological responses of some citrus rootstocks to iron chlorosis

    MERAL İNCESU

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2011

    ZiraatÇukurova Üniversitesi

    Ziraat Bölümü

    DOÇ. DR. SELİM EKER

    PROF. DR. TURGUT YEŞİLOĞLU

  4. Tez No

    844841

    Selekte edilen bazı kayısı (Prunus armeniaca L.) genotiplerinin ve şeftali (Prunus persica L.) melez bireylerinin demir klorozu ve kuraklık stresine dayanıklılığının saptanması

    Determination of resistance to iron chlorosis and drought stress of some selected apricot (Prunus armeniaca L.) genotypes and peach (Prunus persica L.) hybrids

    AYDIN MIZRAK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    ZiraatÇukurova Üniversitesi

    Bahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. BURHANETTİN İMRAK

  5. Tez No

    553541

    Tuz stresinin biyolojik sentez demir nanopartikülleri ile sulu ortamdan ağır metal giderimine etkisi

    Effect of salt stress on the removal of heavy metal from the aquatic environment by biological synthesized iron nanoparticles

    TUĞBA OĞUZPERDAHÇI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    BiyolojiErciyes Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. DİLEK DEMİREZEN YILMAZ

Geri Dön