Identification of arterial input function in perfusion imaging with MR angiography-supported semi-automatic method
Perfüzyon görüntülemede MR anjiyografi destekli yarı otomatik metotla arteryal girdi fonksiyonu tanımlanması
- Tez No: 490261
- Danışmanlar: PROF. DR. MEHMED ÖZKAN
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyomühendislik, Bioengineering
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2018
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Boğaziçi Üniversitesi
- Enstitü: Biyo-Medikal Mühendislik Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyomedikal Mühendisliği Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 63
Özet
Bu tez DSC-MR görüntülemede damara ait girdi fonksiyonunun seçimini MR anjiyografi ve konsantrasyon zaman eğrilerinin parametrelerini sınıflandırma yöntemi kullanarak geliştirmeyi hedeflemektedir. MR anjiyografiden konsantrasyon zaman eğrilerinin parametrik değerlendirilmesi sırasında damar lokasyonlarının tespiti ve arteryel girdi fonksiyonunda olabilecek şekil bozukluklarından kaçınmak için faydalanılmıştır. Damar lokasyonlarının bilinmesi bu araştırma için önem taşımaktadır çünkü MCA'in üzerindeki ve etrafındaki piksellere ait konsantrasyon zaman eğri parametrelerinin sınıflandırma analizinde rehberlik etme değerine sahiptir. Buna ilave olarak, AIF kriterlerine sahip olanların yanında konsantrasyon zaman eğrilerinde şekil bozukluğu gözlenen piksellerin damar lokasyonuna göre konumlarını tespit edebilmemizi sağlar. Önceki çalışmalar AIF seçimi için şu kriterleri geliştirmiştir: tepe noktasının yüksek olması, tepe noktasının yarısındaki eğri genişliğin küçük olması, zirve zamanının erken olması ve kontrast madde varış zamanının erken olması. Bununla birlikte, tepe noktasının çok yüksek olması ve tepe yüksekliğinin yarısında eğri genişliğinin çok küçük olması kısmi hacim etkisine bağlı şekil bozukluğunun göstergesi olduğu bulunmuştur. Tek bir vokselin içinde hem beyin dokusu hem damar bulunduğunda oluşan kısmi hacim etkisi, AIF seçiminde sıkça karşılaşılan bir problemdir. Bundan kaçınmak için çalışmamızda, konsantrasyon zaman eğrisinin son kısmındaki denge düzeyi ile kontrast maddenin ilk geçiş bölümünün altında kalan alanın oranı olarak tanımlanmış olan SS:AUC parametresini kullandık. AIF in SS:AUC değeri referans değerden uzak olduğunda CBF nin %41.1 +- 14.3 düşük veya %36.6 +- 19.2 yüksek hesaplanmasına sebep olduğu görülmüştür.
Özet (Çeviri)
This thesis aims to improve arterial input function (AIF) selection in DSC-MRI by using the information gathered through magnetic resonance angiography (MRA) and cluster analysis of the concentration time curve (CTC) parameters. MRA was utilized with a dual-purpose, identifying arterial locations during the parametric evaluation of CTCs in DSC-MRI, and avoiding shape distortions in AIF. The knowledge of arterial locations is essential to the research, as it guided the cluster analysis carried out with the CTC parameters of voxels located within and around the middle cerebral artery (MCA). Additionally, it enabled us to identify the voxels that meet the AIF criteria and those with distorted CTCs. The literature has developed the following criteria for selecting AIF: high peak height (PH), small full-width-at-half-maximum, (FWHM), early time-to-peak (TTP), and early arrival time (AT). However, it has been found that high PH and small FWHM may indicate a shape distortion due to partial volume effect (PVE). PVE is a common problem in AIF identification, which emerges when a voxel contains both artery and brain tissue. To avoid PVE, we included in our cluster analysis a recently introduced parameter, the SS:AUC ratio, which indicates the ratio of the mean steady state (SS) value (post-bolus equilibrium) to the area under the curve (AUC) of the first passage of contrast agent. We calculated the SS:AUC of VOF and used it as a reference in selecting AIF. By using this reference value, we managed to detect the CTCs that were not distorted by PVE. If the SS:AUC of AIF was far from the reference value, CBF was either under- or over-estimated by a maximum of 41.1 +- 14.3 and 36.6 +- 19.2%, respectively.
Benzer Tezler
- Kardiyovasküler sistemde pulsatil akışın modellenmesi ve kontrolü
Modelling and control of pulsatile flow in cardiovascular system
SERDAR YILMAZ
Doktora
Türkçe
2011
Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve KontrolYıldız Teknik ÜniversitesiElektronik ve Haberleşme Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ONUR TOKER
PROF. DR. HERMAN SEDEF
- İntrakranial arterlerin seyri boyunca uzaysal eksenleri ve yüzeylerinin isimlendirmesi
The axis of the intracranial arteries along their courses and the nomenclature of their arterial surfaces
İHSAN DOĞAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2012
AnatomiAnkara ÜniversitesiBeyin ve Sinir Cerrahisi Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HASAN ÇAĞLAR UĞUR
- Trombozlu hastalarda faktör V leiden sıklığı
Frequency of factor V leiden in patients with thrombosis
ERAY YILDIZ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2010
İç HastalıklarıSağlık Bakanlığıİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. FUNDA MÜŞERREF TÜRKMEN
- Vascular function in chronic end-organ damage: pharmacological characterization of vasomotor function in systemic vasculature
Kronik uç-organ hasarında vasküler fonksiyon: Sistemik damarlarda vazomotor fonksiyonun farmakolojik karakterizasyonu
NADİR ULU
Doktora
İngilizce
2009
Eczacılık ve FarmakolojiUniversity of Groningen (Rijksuniversiteit Groningen)Tıbbi Farmakoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ROBERT HENK HENNING