Association analysis and mapping of fiber quality in cotton
Pamukta ilişkilendirme haritalaması yöntemiyle lif kalite özellikleri ile ilişkili markör belirleme
- Tez No: 493802
- Danışmanlar: DOÇ. DR. İSMAİL AKYOL, YRD. DOÇ. DR. ADEM BARDAK
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyomühendislik, Bioengineering
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2018
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyomühendislik ve Bilimleri Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 186
Özet
Gossipum cinsi tüm dünyadaki en iyi doğal lif kaynağıdır. Ekonomik değeri yüksek olan karakterlerlerin kalıtımının karmaşık olması ve bunlar hakkında yeterli bilginin bulunmamasından dolayı, klasik ıslah proğramları ile genetik ilerleme sınırlı kalmaktadır. DNA polimorfizmlerinin belirlenmesi ve açıklanmasında moleküler markörlerin kullanılması etkin bir seleksiyon için en önemli anahtarlardan bir tanesidir. Sekanslama yoluyla genotipleme (GBS) germplazmlardaki genetikvaryosyonun açıklanmasında kullanılabilir. Bağlantı denksizliği (LD) kullanılarak ilişkilendirme haritalarının yapılması, tüm bitkilerde kantitatif özellik lokuslarının (QTLs) belirlenmesi için en önemli amaçtır. Bu çalışmada, lif kalitesi özellikleri ile markör ilişkilerini belirlemek için 286 genotip taranmıştır. Biz Acala Maxxa, Paymaster2379 (USA), Delcerro (Venezuela), Carmeen (Australia), NSCH777 (India) gibi küresel koleksiyonlardan ve Türkiye'den Carla, Nazilli84S, Flora gibi elit çeşitleri içeren genotipleri inceledik. Fenotipik analizler sonucunda AB-80, Flora ve Delcerro çırçır randımanı, lif uzunluğu ve lif mukavemetinin arttırılması için potansiyel ebeveyn olarak kullanılabilir. İlikilendirme haritalaması için 4730 tek nükleotid polimorhizmi (SNPs) alleli kullanılmıştır. 95 tane SNP markörü çok önemli (p
Özet (Çeviri)
Gossypium genus is the ultimate source of natural fiber all over the globe. Limitations in conventional breeding program for genetic improvement are due to the complexity of the genetic pattern for economically important traits. The use of molecular markers for the detection and exploitation of DNA polymorphism is one of the most significant key for effective selection. Genotyping-by-sequencing (GBS) can be used to explore genetic variation in germplasms. Association mapping using linkage disequilibrium is the most important goal for searching QTLs in all crops. In the present study, 286 genotypes were screened for determining marker-trait associations related to fiber quality. We investigated genotypes from global collection such as Acala Maxa, Paymaster2379 (USA), Delcerro (Venezuela), Carmeen (Australia), NSCH777 (India) and elite cultivars from Turkey including Carla, Nazilli84S, Flora. Phenotypically analysis resulted that AB-80, Flora and Delcerro can be used as potential parents for increasing ginning outturn, fiber length and strength. 4730 single nucleotide polymorphsims (SNPs) allels used for association mapping. 95 highly informative SNPs identified at (p
Benzer Tezler
- Molecular genetic analysis in cotton (Gossypium hirsutum L.)
Pamukta (Gossypium hirsutum L.)moleküler genetik analizler
ASENA AKKÖSE BAYTAR
Doktora
İngilizce
2021
Genetikİzmir Yüksek Teknoloji EnstitüsüMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SAMİ DOĞANLAR
PROF. DR. ANNE FRARY
- Pamukta (Gossypium hirsutum L.) ilişkilendirme haritalaması analiziyle solgunluk hastalığı (Verticillium dahliae Kleb.) ile ilişkili DNA markörlerinin belirlenmesi
Determination DNA markers associated with verticilliumwilt disease (Verticillium dahliae Kleb.) with association mapping analysis in cotton (Gossypium hirsutum L.)
SADETTİN ÇELİK
Doktora
Türkçe
2018
BiyoteknolojiKahramanmaraş Sütçü İmam ÜniversitesiTarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ ADEM BARDAK
DOÇ. DR. OKTAY ERDOĞAN
- Seçilmiş yulaf hatlarında yağ ve yağ asitleri ile bazı kalite özelliklerinin ilişkili haritalama analizleri
Association mapping analysis of oil content and fatty acid composition with some quality traits in selected oat genotypes
SELÇUK SUNULU
Doktora
Türkçe
2021
ZiraatKahramanmaraş Sütçü İmam ÜniversitesiTarla Bitkileri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MUSTAFA YILDIRIM
DOÇ. DR. ZİYA DUMLUPINAR
- Antepfıstığında (Pistacia vera L.) ilişkili haritalama yöntemi kullanılarak bazı meyve kalite özellikleri ile bağlantılı lokusların belirlenmesi
Determination of loci related with some fruit quality traits in pistachio (Pistacia vera L.) using the assocation mapping method
LEYLA NUREFŞAN GÜNDÜZ
Doktora
Türkçe
2024
BiyoteknolojiÇukurova ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SALİH KAFKAS
- Kanserin beslenme epidemiyolojisine moleküler bir bakış: Diyet fiber, mikro-besin alımı ve kanser riski: meta-meta analizi ile kapsamlı bir haritalama incelemesi
A molecular overview of the nutritional epidemiology of cancer: dietary fiber, micronutrient intake, and cancer risk: A comprehensive mapping review with meta-meta analysis
MEHMET EMİN ARAYICI
Doktora
Türkçe
2023
BiyoistatistikDokuz Eylül ÜniversitesiOnkoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HÜLYA ELLİDOKUZ