Geri Dön

Topraktan dehalogenaz geni barındıran bakterilerin izolasyonu, karakterizasyonu ve tanımlanması

Isolation, characterization and identification of bacteria containing dehalogenase gene from soil

  1. Tez No: 494853
  2. Yazar: GÜLFİDAN KUYUMCU
  3. Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. YILMAZ KAYA
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2017
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Ondokuz Mayıs Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 99

Özet

2,2-Dikloropropionik asit (2,2 DCP), ksenobiyotik bir bileşik olup herbisit olarak kullanılmaktadır. Bakteriler herbisit ve insektisitlerin yoğun bir şekilde kullanıldığı Samsun'un Terme ilçesindeki bir tarım arazisinden izole edildi. İzole edilen izolatlar 2,2-dikloropropionik asiti yegâne karbon kaynağı olarak kullanmaktadır. Yapılan çeşitli biyokimyasal ve morfolojik testler sonucunda bu izolatların Pseudomonas' ın hangi suşuna ait olduğu belirlendi. Bununla birlikte genomik DNA izolasyonu yapılarak 16S rRNA metoduyla filogenetik ilişki açığa çıkarıldı. Bu sonuca göre bakteri %99 oranında Pseudomonas putida ve Pseudomonas mosselii bakterilerine benzerlik gösterildi. Bu bakteri dalaponlu minimal media besiyerinde yavaş bir şekilde büyüme gösterdi. Bu da bu bakterinin dalaponu karbon ve enerji kaynağı olarak kullandığının göstergesidir. Minimal media besiyerine 10 mM dalapon eklendi. Minimal media besiyerinden izole edilen bakterilerden genomik DNA izolasyonu yapıldı ve dehE geni PCR ile analiz edildi. İstenilen büyüklükte bantlar elde edildi.

Özet (Çeviri)

2,2-dichloropropionate (2,2-DCP), is xenobiotic which used as herbicide. Bacteria were isolated from an agricultural area in the Terme district of Samsun where the herbicides and insecticides were used intensively. The bacteria was able to utilize 2,2 DCP as sole carbon source. As a result of various biochemical and morphological tests performed, it was determined which strain of these bacteria belong to Pseudomonas. Also, From16S rRNA analysis, the bacteria had 99% identity to Pseudomonas putida and Pseudomonas mosselii strains and shared many similarities in terms of biochemical reactions and microscopic observation. The bacteria was able to grow slowly in minimal medium contain only 2,2-dichloropropionate as sole carbon source and energy and growth were evident in minimal media containing 10mM 2,2 dichloropropionate. Genomic DNA isolation from bacteria isolated from minimal media medium was performed and dehE gene was analyzed by PCR. Bands of the desired size were obtained.

Benzer Tezler

  1. Isolation of monobromoacetate and dichlaroacetate degrading bacteria from polluten seawater and analysis of haloacid de halogenaze geofypes by using polymerase choun reaction (PCR)

    Monobromoasetat ve dikloroasetat parçalayan bakterilerin kirlenmiş deniz suyundan izolasyonu ve haloasit dehalogenaz genotiplerinin polimeraz zincir reaksiyonu ile analizi

    BANU FIRAT

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2000

    BiyolojiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SEMRA KOCABIYIK

  2. Detection of monochloroacetate degrading genotypes of pseudomonas SP.Using PCR/DNA probe assays

    Pseudomonas Sp'nin monokloroasetat yıkımından sorumlu genotiplerinin PCR/DNA PROB yöntemleri kullanılarak tanınması

    EBRU CABA

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    1996

    BiyolojiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SEMRA KOCABIYIK

  3. Topraktan ve yapraktan bor uygulamalarının pamuğun (Gossypium hirsutum L.) verim, verim unsurları ve lif özelliklerine etkisi

    The effect of soil and foliar applied boron on yield, yield components and fiber traits of cotton (Gossypium hirsutum L.)

    SERDAL KUTLU

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    ZiraatHarran Üniversitesi

    Tarla Bitkileri Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. HASAN HALİLOĞLU

  4. Topraktan nitramin, nitroaromatik ve nitrat ester grubu patlayıcıların LC-MS/MS ile tayini

    Determination of nitroaromatic, nitramine and nitrate ester explosives in soil by LC-MS/MS

    HARUN ŞENER

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    Adli Tıpİstanbul Üniversitesi

    Fen Bilimleri Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SALİH CENGİZ