Geri Dön

Investigation of the occurrence of siderophore genes in E. coli isolated from foodborne and clinical samples and identification of genotypic relationship of Escherichia coli by using PFGE method

Gıda kaynaklı ve klinik örneklerden izole edilen E. coli'de siderofor genlerinin oluşumunun araştırılması ve PFGE yöntemi ile Escherichia coli genotipik ilişkisinin belirlenmesi

  1. Tez No: 496519
  2. Yazar: OSMAN ALBARRI
  3. Danışmanlar: PROF. DR. IŞIL VAR ÖNGEL, PROF. DR. FATİH KÖKSAL
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2018
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Çukurova Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 110

Özet

Demir, konak hücrelerinde ve dış ortamda Escherichia coli büyümesi ve hayatta kalması için gereklidir, ancak ferrik formunun sulu ortamlarda zayıf çözünürlüğü ve konakta demir tutan proteinlerin varlığına bağlı olarak kullanılabilirliği genellikle düşüktür. Çoğu E. coli, Fe3+ 'ya karşı güçlü bir afiniteye sahip olan enterobactin gibi sideroforları oluşturarak demir erişimini artırabilir. İzolatların daha küçük bir kısmı, patogenezle bağlantılı olarak 3 ek siderofor oluşturabilir; Bunlar aerobaktin, salmochelin ve yersiniabaktindir. Bu çalışmada, klinik ve gıda örneklerinden izole edilen E.coli suşlarında siderofor genlerinin varlığını araştırılmış ve Escherichia coli suşlarının genotipik ilişkisi incelemiştir. Çalışmamızda, klinik örneklerden izole edilmiş altmış beş E. coli suşundan gıda örneklerinden izole edilen 35 E.coli suşu kullanılmıştır. E.coli suşlarında Sideroforla ilişkili genlerin prevalansı, enterobaktin reseptörü (Fep A),% 18; Enterobactin biyosentezi (Ent A),% 18; yersiniabactin reseptörü (Fyu A),% 17; heme reseptörü (Chu A)% 16; aerobaktin reseptörü (iut A),% 12; aerobaktin biyosentez (iuc A),% 15; ve salmochelin reseptörü (iro N),% 3 ve demir cevabı veren element (ire A),% 1 olarak PCR yöntemi ile belirlendi. E.coli suşları arasındaki genotipik ilişki PFGE metodu kullanılarak incelenmiş ve PFGE analizinin değerlendirilmesinde, insan ve gıda kaynaklı izolatların 89 izolatından 6'sının (% 6.8) klonal bir ilişki sergilediğini, diğerleri arasında anlamlı bir ilişki bulunmadığını göstermiştir. Sonuç: Sonuçlarımız klinik örneklerden izole edilen E.coli suşlarının gıda örneklerinden elde edilen suşlara göre daha yüksek prevalansa sahip olduğununu; Sideroforla ilişkili genlerin, E.coli klinik suşlarının büyümesi, hayatta kalması ve demir sınırlayıcı çevreye adaptasyonu için ana faktörlerden olduğunu göstermiştir.

Özet (Çeviri)

Iron is essential for Escherichia coli growth and survival in the host and the external environment, but its availability is generally low due to the poor solubility of its ferric form in aqueous environments and the presence of iron-withholding proteins in the host. Most E. coli can increase access to iron by excreting siderophores such as enterobactin, which have a very strong affinity for Fe3+. A smaller proportion of isolates can generate up to 3 additional siderophores linked with pathogenesis; aerobactin, salmochelin, and yersiniabactin. This study compared the presence of siderophore genes in E.coli strains isolated from clinical and food samples, and studied genotypic relationship of Escherichia coli strains. Sixty five of E. coli strains were isolated from the clinical samples and 35 of E.coli isolated from the food samples were our material in this study. The prevalence of the siderophore-related genes were determined in the E.coli strains by the PCR method which was as follow: enterobactin receptor (Fep A), 18%; enterobactin biosynthesis (Ent A), 18 % ; yersiniabactin receptor (Fyu A), 17%; heme receptor (Chu A) 16%; aerobactin receptor (iut A),12%; aerobactin biosynthesis (iuc A),15%; and salmochelin receptor (iro N), 3%, and iron-responsive element (ire A), 1 %. The genotypic relationship of E.coli strains have also studied by using PFGE method and the evaluation of PFGE analysis showed that 6 (6.8%) out of 89 isolates of human and foodborne isolates had a clonal relationship while there was no significant relationship between the other isolates. Conclusion: The siderophore-related genes are main factors in the growth and survival of the E.coli clinical strains and their adaptation to the iron limiting environment, our results supported that and found that siderophore genes are higher prevalence in E.coli isolated from clinical samples than food samples.

Benzer Tezler

  1. Bazı yeni kinolin türevlerinin sentezi, antimikrobiyal ve DNA giraz inhibitörü etkilerinin araştırılması

    Synthesis of new quinoline derivatives and investigation of their antimicrobial and DNA gyrase inhibition effects

    ASAF EVRİM EVREN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    Eczacılık ve FarmakolojiAnadolu Üniversitesi

    Farmasötik Kimya Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. LEYLA YURTTAŞ

    PROF. DR. YUSUF ÖZKAY

  2. Şizofreni tanılı hastalarda obsesif kompulsif belirtilerin klinik sosyodemografik veriler, yeti yitimi derecesi ve hasta yakınlarındaki obsesif kompulsif belirtiler, bakım veren yükü ile ilişkisinin incelenmesi

    Investigation of the relationship between obsessive-compulsive symptoms in patients with schizophrenia and clinical sociodemographic data, degree of disability, obsessive-compulsive symptoms in relatives of the patients and caregiver burden

    SİNEM ALTI KELEŞ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    PsikiyatriSağlık Bakanlığı

    Ruh Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ MELTEM DERYA ŞAHİN

  3. Investigation of existence of denitrifying phosphate accumulating organisms at wastewater treatment plants in Turkey

    Türkiye'deki atık su arıtma tesislerinde anoksik fosfor giderimi yapabilen organizmaların varlığının incelenmesi

    MURAT AYHAN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2011

    Çevre MühendisliğiMarmara Üniversitesi

    Çevre Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. NESLİHAN SEMERCİ

  4. Denizli ili yerleşim alanı zemin malzemesinin sıvılaşma özelliklerinin incelenmesi

    Investigation of liquefaction properties of soils of Denizli province settlement area

    ALİ KOCABAŞ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    Jeoloji MühendisliğiBurdur Mehmet Akif Ersoy Üniversitesi

    Malzeme Teknolojileri Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ İBRAHİM İSKENDER SOYASLAN

  5. Akrilamidin gıda maddelerinde oluşumuna etki eden faktörlerin incelenmesi ve miktarının tayini

    Investigation of factors that influence the occurrence of acrylamide in foods and its determination

    NAFİZ ÖNCÜ CAN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2007

    Eczacılık ve FarmakolojiAnadolu Üniversitesi

    Analitik Kimya Ana Bilim Dalı

    DOÇ. GÖKSEL ALTIOKKA