Karbapenem dirençli Pseudomonas aeruginosa izolatlarında VIM, IMP, NDM, KPC, OXA-48 ve GES tipi karbapenemazların moleküler yöntemlerle araştırılması
Investigation of VIM, IMP, NDM, KPC, OXA-48 and GES carbapenemases in carbapenem resistant pseudomonas aeruginosa isolates with molecular methods
- Tez No: 503315
- Danışmanlar: DOÇ. DR. ELİF AKTAŞ
- Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Pseudomonas aeruginosa, karbapenemaz, polimeraz zincir reaksiyonu, Pseudomonas aeruginosa, carbapenemase, polymerase chain reaction
- Yıl: 2015
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Sağlık Bakanlığı
- Enstitü: İstanbul Şişli Hamidiye Etfal Eğitim ve Araştırma Hastanesi
- Ana Bilim Dalı: Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 84
Özet
Malkoçoğlu G. Karbapenem dirençli Pseudomonas aeruginosa izolatlarında VIM, IMP, NDM, KPC, OXA-48 ve GES tipi karbapenemazların moleküler yöntemlerle araştırılması. Şişli Hamidiye Etfal Eğitim ve Araştırma Hastanesi. Klinik Mikrobiyoloji Laboratuvarı. Tıpta Uzmanlık Tezi. İstanbul. 2015. Pseudomonas aeruginosa, hastane enfeksiyonlarında sık karşılaşılan ve çoğul antibiyotik direnci göstermesi nedeniyle tedavisi oldukça güç bir patojendir. Yaşamı tehdit eden ciddi enfeksiyonlarda son seçenek olan karbapenem grubu antibiyotiklere direnç önemli bir sorun teşkil etmektedir. Pseudomonas aeruginosa izolatlarında karbapenem direnci tüm dünyada artış göstermektedir. Karbapenem direnci gelişmesinde en sık mekanizmalar OprD porin proteini kaybı ve efluks pompa enzimlerinin salınımının artmasıdır. Bunun yanı sıra karbapenemaz üretimine bağlı direnç de P. aeruginosa'da son yıllarda sıklıkla bildirilmektedir. Karbapenemazların birçoğu diğer karbapenem direnç mekanizmalarının aksine, plazmidler aracılığı ile hızla yayılma yeteneğine sahiptirler. Bu nedenle, karbapenemaz üreten etkenlerin yayılımının takip ve kontrolü toplum sağlığı açısından önem taşımaktadır. Bu çalışmada amaç, karbapenemlere dirençli Pseudomonas aeruginosa izolatlarında karbapenemaz üretimine neden olan blaVIM, blaIMP, blaNDM, blaKPC, blaOXA-48 ve blaGES genlerinin varlığının araştırılmasıdır. Bu amaca yönelik olarak Şişli Hamidiye Etfal Eğitim ve Araştırma Hastanesi Klinik Mikrobiyoloji Laboratuvarına Haziran 2011-Ağustos 2015 tarihleri arasında rutin olarak gönderilen örneklerden izole edilen ve imipenem veya meropenem grubu antibiyotiklerden en az birine dirençli olduğu tespit edilen 84 adet P. aeruginosa izolatı incelendi. Karbapenemaz varlığının araştırılmasında fenotipik tarama testi olarak yeni geliştirilen 'karbapenemaz inaktivasyon metodu' (CIM) kullanıldı. Karbapenemaz üretimine sıklıkla neden olan blaVIM, blaIMP, blaNDM, blaKPC, blaOXA-48 ve blaGES genleri tüm izolatlarda polimeraz zincir reaksiyonu (PZR) ile araştırıldı. CIM deneyi sonucunda üç izolatta (%3.5) karbapenemaz üretimi tespit edildi. PZR ile bunlardan ikisinde blaVIM ve birinde blaGES genleri saptandı. Buna karşın araştırdığımız diğer gen bölgeleri tüm izolatlarda negatif bulundu. Bu çalışma ile hastanemizdeki P. aeruginosa izolatlarında VIM ve GES tipi karbapenemazların varlığı moleküler yöntemlerle ilk olarak ortaya konmuştur. Bulgularımız karbapenemaz enzimlerinin yayılımını kontrol altına alma stratejilerine ve direnç epidemiyolojisi verilerine katkı sağlayacaktır.
Özet (Çeviri)
Malkoçoğlu G. Investigation of VIM, IMP, NDM, KPC, OXA-48 and GES type carbapenemases in carbapenem resistant Pseudomonas aeruginosa isolates with molecular methods. Sisli Hamidiye Etfal Training and Research Hospital Clinical Microbiology Laboratory. Thesis for specialization in medicine. Istanbul. 2015. Pseudomonas aeruginosa is a leading cause of hospital acquired infections and a serious pathogen showing multipl drug resistance. Carbapenem resistance is an important problem since they are last option antibiotics in life threatening infections. Carbapenem resistance in P. aeruginosa isolates has been increasing worldwide. The most common mechanisms of carbapenem resistance are down-regulation of the porin OprD and increased activity of the efflux pumps. Beside these, resistance due to production of carbapenemases has often been observed in recent years. Unlike other resistance mechanisms, most of the carbapenemases have the ability to spread rapidly via plasmids. Thus, monitoring and controlling the spread of the carbapenemases is important in terms of public health. In this study, investigation of the existence of blaVIM, blaIMP, blaNDM, blaKPC, blaOXA-48 and blaGES genes responsible for carbapenemase production in carbapenem resistant P. aeruginosa isolates was aimed. For this purpose, a total number of 84 P. aeruginosa isolates, resistant at least one of imipenem or meropenem, obtained from samples sent to Şişli Hamidiye Etfal Training and Research Hospital Clinical Microbiology Laboratory between June 2011 to Agust 2015 were examined. For screening of carbapenemase production, a newly developed phenotyping method named 'carbapenemase inactivation method' (CIM) was used. blaKPC, blaNDM, blaIMP, blaVIM, blaOXA-48 and blaGES genes frequently responsible for the production of carbapenemase were investigated by polimerase chain reaction (PCR). Three isolates (3.5%) were identified as carbapenemase producers by CIM tests. The PCR tests demonstrated the presence of blaVIM gene in two isolates and blaGES gene in one isolate . However, the remaining isolates yielded none of the other gene regions investigated in this study. In conclusion, the presence of VIM and GES type carbapenemases in P. aeruginosa isolates was demonstrated for the first time in our hospital. Our findings will contribute to the strategies for controlling the spread of carbapenemase enzymes and to the epidemiologic data.
Benzer Tezler
- Karbapeneme dirençli pseudomonas aeruginosa suşlarında seftazidim avibaktam'a karşı in vitro duyarlılık yöntemlerinin karşılaştırılması ve bazı karbapenemaz genlerinin araştırılması
Comparison of in vitro susceptibility methods against ceftazidime avibactam in carbapenem-resistant pseudomonas aeruginosa strains and investigation of some carbapenemase genes
İSMAİL AYTAÇ ACAR
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2023
MikrobiyolojiHitit ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ HANDE AFŞARLAR
- Klinik pseudomonas aeroginosa izolatlarının antibiyotik direncinde resistance nodulation division (RND) dışa atım pompası etkinliğinin araştırılması
Nvestigation of the effectiveness of resistance nodulation division (RND) extraction PUMP on antibiotic resistance of clinical pseudomonas aeruginosa isolates
MUHAMMED FURKAN KÜRKÇÜ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2022
MikrobiyolojiSağlık Bilimleri ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. TUĞRUL HOŞBUL
- Klinik örneklerden izole edilen pseudomonas aeruginosa izolatlarında metallobetalaktamaz üretiminin araştırılması
Investigation of metallo beta lactamase production in pseudomonas aeruginosa isolated from clinical samples
ELİF VURAL TAŞDEMİR
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2016
MikrobiyolojiMersin ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NURAN DELİALİOĞLU
- Hastanemiz yoğun bakım ünitelerinden izole edilen çoklu ilaç dirençli acinetobacter ve pseudomonas izolatlarında metallobetalaktamaz (MBL) varlığının fenotipik ve genotipik yöntemlerle araştırılması
Investigation of the phenotypic and genotypic methods of the metallobetalactamase presence in multidrug resistance acinetobacter and pseudomonas isolates from an intensive care unit infections in our hospital
CENNET RAĞBETLİ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2016
MikrobiyolojiYüzüncü Yıl ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HÜSEYİN GÜDÜCÜOĞLU
- Hastane enfeksiyonu etkeni olan pseudomonas aeruginosa suşlarında karbapenem direnci ve direncin moleküler olarak saptanması
Başlık çevirisi yok
GÜLİZ SARAÇ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2011
Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıMersin ÜniversitesiEnfeksiyon Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ALİ KAYA