Geri Dön

Klinik pseudomonas aeroginosa izolatlarının antibiyotik direncinde resistance nodulation division (RND) dışa atım pompası etkinliğinin araştırılması

Nvestigation of the effectiveness of resistance nodulation division (RND) extraction PUMP on antibiotic resistance of clinical pseudomonas aeruginosa isolates

PDF İndir

  1. Tez No: 757808
  2. Yazar: MUHAMMED FURKAN KÜRKÇÜ
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. TUĞRUL HOŞBUL
  4. Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Gen ifadesi, Karbapenemler, Membran proteinleri, Polimeraz zincirleme reaksiyonu, Pseudomonas aeruginosa, İlaçlara direnç, Gene expression, Carbapenems, Membrane proteins, Polymerase chain reaction, Pseudomonas aeruginosa, Drug resistance
  7. Yıl: 2022
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Sağlık Bilimleri Üniversitesi
  10. Enstitü: Gülhane Tıp Fakültesi
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Dışa atım pompaları, dış membran porin geçirgenliğinin azalması ve karbapenemaz üretimi Pseudomonas aeruginosa'da antibiyotik direnci gelişiminde önemli mekanizmalardandır. Çalışmamızda Resistance Nodulation Division (RND) dışa atım pompalarının, OprD dış membran porin proteininin ve karbapenemaz üretiminin direnç gelişimindeki etkinliğinin belirlenmesi amaçlanmıştır. Çalışmamıza 50 karbapenem duyarlı ve 30 dirençli P. aeruginosa izolatı dahil edildi. İzolatların tanımlanması MALDI-TOF MS (Brucker Daltonics, Almanya) ile yapıldı ve duyarlılık sonuçları VITEK® 2 (Biomerieux, Fransa) ile EUCAST kriterlerine göre belirlendi. Dışa atım pompalarının düzenleyici genleri olan MexB, MexC, MexE ve MexX ile OprD dış membran proteininin ekspresyon düzeyleri belirlendi ve çeşitli antibiyotiklere duyarlı ve dirençli izolatlar arasındaki ekspresyon düzeyleri gerçek zamanlı kantitatif revers transkriptaz PCR (RT-qPCR) yöntemi ile saptandı ve karşılaştırıldı. Karbapenem dirençli izolatlarda bla KPC, bla NDM, bla OXA-48, bla IMP, ve bla VIM varlığı PCR ile araştırıldı. (Çalışmada kullanılan primerler tablo 1 ve 2'de sunulmuştur) İzolatlar arasındaki klonal ilişki M13 primerinin kullanıldığı Arbitrarily Primed Polimerize Zincir Reaksiyonu (AP-PCR) yöntemi araştırıldı. Çalışmamızda izolatların 50 tanesi (% 62,5) karbapenem dirençli, 30 tanesi (% 37,5) karbapenem duyarlı idi. Karbapenemlere dirençli 50 izolatın %74'ünde OprD ekspresyon düzeyinde azalma saptandı (p=0014). Karbapenem dirençli izolatların %82'sinde MexB, aşırı ekspresyonu tespit edildi ve bu artış istatistiksel olarak anlamlı düzeyde bulundu (p<0,01). (Tablo 3) Amikasin ve gentamisine dirençli izolatlar ile duyarlı izolatlar karşılaştırıldığında yalnızca MexX aşırı ekspresyonunda anlamlı fark saptanırken. MexX aşırı ekspresyonu amikasin dirençli izolatların %68'inde, gentamisin dirençlilerin ise %64,3'ünde saptandı (p=0,020, p=0,041). Çok ilaca direnç gözlenen izolatların %76,6'sında MexB, %61,7'sinde de MexX genlerinde aşırı ekspresyon saptandı. MexB ve MexX aşırı ekspresyonu çok ilaca dirençli grupta istatistiksel olarak anlamlı düzeydeydi (p=0,04; p=0,05).Karbapenem dirençli izolatlarda çalışmada araştırılan karbapenemaz direnç genleri saptanmadı. AP-PCR ile izolatlar 64 farklı genotipte gruplandırıldı. Çalışmamızda karbapenemlere direnç gelişiminde MexB aşırı ekspresyonu ve OprD geçirgenliğinde azalmanın etkili olduğu; MexX aşırı ekspresyonunun aminoglikozid direnci; MexAB-OprM ve MexXY dışa atım pompalarının aşırı aktivasyonunun ise çok ilaca direnç gelişiminde etkili olduğu gösterilmiştir.

Özet (Çeviri)

Excretion pumps, decreased outer membrane porin permeability and carbapenemase production are important mechanisms in the development of antibiotic resistance in Pseudomonas aeruginosa. In our study, it was aimed to determine the effectiveness of Resistance Nodulation Division (RND) efflux pumps, OprD outer membrane porin protein and carbapenemase production in the development of resistance. 50 carbapenem-susceptible and 30 resistant P. aeruginosa isolates were included in our study. Identification of isolates was done with MALDI-TOF MS (Brucker Daltonics, Germany) and susceptibility results were determined according to EUCAST criteria with VITEK® 2 (Biomerieux, France). Expression levels of MexB, MexC, MexE and MexX, and OprD outer membrane protein, which are regulatory genes of efflux pumps, were determined and expression levels between isolates sensitive to and resistant to various antibiotics were determined and compared by real-time quantitative reverse transcriptase PCR (RT-qPCR). The presence of bla KPC, bla NDM, bla OXA-48, bla IMP, and bla VIM in carbapenem resistant isolates was investigated by PCR. (Primers used in the study are presented in Tables 1 and 2) Clonal relationship between isolates Arbitrarily Primed Polymerized Chain Reaction (AP-PCR) method using M13 primer was investigated. In our study, 50 (62.5%) of the isolates were carbapenem resistant and 30 (37.5%) carbapenem sensitive. OprD expression level decreased in 74% of 50 isolates resistant to carbapenems (p=0014). MexB overexpression was detected in 82% of carbapenem resistant isolates, and this increase was found to be statistically significant (p<0.01). (Table 3) When amikacin and gentamicin resistant isolates were compared with susceptible isolates, only MexX overexpression showed a significant difference. MexX overexpression was detected in 68% of amikacin resistant isolates and 64.3% of gentamicin resistant isolates (p=0.020, p=0.041). Overexpression of MexB genes was detected in 76.6% and MexX genes in 61.7% of the isolates with multidrug resistance. Overexpression of MexB and MexX was statistically significant in the multidrug resistant group (p=0.04; p=0.05). Carbapenemase resistance genes investigated in the study were not detected in carbapenem resistant isolates. The isolates were grouped into 64 different genotypes by AP-PCR. In our study, it was found that MexB overexpression and decreased OprD permeability were effective in the development of resistance to carbapenems; aminoglycoside resistance of MexX overexpression; Overactivation of the MexAB-OprM and MexXY efflux pumps has been shown to be effective in the development of multidrug resistance.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    390030

    Pseudomonas aeruginosa izolatlarının antibiyotiklere direnç mekanizmalarında aktif atım pompaları ve porin proteinlerinin etkisinin araştırılması

    Investigation of the effects of active efflux pumps and porine proteins in antibiotic resistance mechanism of Pseudomonas aeruginosa isolates

    HÜSEYİN AGAH TERZİ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2012

    MikrobiyolojiSakarya Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. İHSAN HAKKI ÇİFTCİ

    DOÇ. DR. CANAN KÜLAH

  2. Tez No

    837592

    Klinik Pseudomonas aeruginosa izolatlarında antibiyotik duyarlılıklarının, biyofilm üretiminin ve quorum sensing genlerinin belirlenmesi

    Determination of antibitic susceptibility, biofilm production and quorum sensing genes in clinical Pseudomonas aeruginosa isolates

    ALI HUSSEIN BHA ALDAN ALTURKI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    BiyolojiSelçuk Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. EMİNE ARSLAN

  3. Tez No

    617382

    Pseudomonas aeruginosa izolatlarında biyofilm üretimi ile antibiyotik dirençlilik ilişkisinin karşılaştırmalı değerlendirilmesi

    The comparative evaluation of biofilm production and antibiotic resistance in pseudomonas aeruginosa isolates

    SERVET EKSELLİ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    MikrobiyolojiOndokuz Mayıs Üniversitesi

    Veterinerlik Mikrobiyolojisi Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ALPER ÇİFTCİ

  4. Tez No

    1007186

    İnvaziv enfeksiyon etkeni olan Pseudomonas aeruginosa izolatlarının antimikrobiyal direnç genlerinin ve epidemiyolojilerinin araştırılması

    Investigation of antimicrobial resistance genes and epidemiology of Pseudomonas aeruginosa isolates causing invasive infections

    MELTEM AFACAN CESUR

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2026

    MikrobiyolojiAnkara Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. EBRU US

  5. Tez No

    787825

    Karbapenem dirençli pseudomonas aeruginosa izolatlarının direnç ve virülans genlerinin taranması ve PFGE ile moleküler epidemiyolojisinin incelenmesi

    Determination of the resistance and virulence genes is carbapenem resistant pseudomonas aeruginosa isolates and investigation of its molecular epidemiology by PFGE

    HAMİYET BÜŞRA GÜNDOĞDU

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    MikrobiyolojiRecep Tayyip Erdoğan Üniversitesi

    Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. OSMAN BİROL ÖZGÜMÜŞ

Geri Dön