Geri Dön

Progresif miyoklonus epilepside KCNC1 geninin varyantlarının araştırılması

The detection of the variants of the KCNC1 in progressive myoclonus epilepsy

  1. Tez No: 505238
  2. Yazar: NURAN KOÇAK
  3. Danışmanlar: PROF. DR. NERSES BEBEK
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Genetik, Genetics
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2018
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: İstanbul Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Sinir Bilimi Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 93

Özet

Progresif miyoklonus epilepsileri (PME) nadir hastalıkların sebep olduğu; miyoklonus, tonik-klonik nöbetler ve ilerleyici kognitif gerileme bulguları gösteren bir epilepsi grubudur. PME türlerinin fenotipleri oldukça benzerdirler. Bu nedenle kesin klinik tanının konulması zorlaşmaktadır. Yakın geçmişte yapılan genetik çalışmalarda KCNC1 geninde c.959G>A değişimi ve CSTB geninin promotör bölgesindeki 5' dodekamer tekrarları genişlemesi PME'ye neden olan sık görülen gen mutasyonları olduğu gösterilmiştir. Bu çalışmada PME'nin sık iki genetik nedeni olan KCNC1 ve CSTB genlerinin PME tanısı için biyolojik belirteç olarak test etmek amacıyla Türk hastalarda araştırılmıştır. Gen analizleri İ.Ü. İstanbul Tıp Fakültesi, Nöroloji Anabilim Dalı'na başvuran PME tanısı ile takip edilen 19 Türk hastada incelenmiştir. ULH hastalığında CSTB geninin 5' promotör bölgesinde bulunan uzun dodekamer tekrarları Touchdown-PZR ile KCNC1 tek nokta polimorfizmi Sanger dizileme ile incelenmiştir. Ondokuz hastadan oluşan kohortta CSTB genindeki dodekamer ekspansiyonu analizi ile 2 olası ULH olarak kabul edilen hasta (%10) saptanmıştır. Bu hastaların klinik bulgular literatür ile uyumludur. Olası ULH olarak kabul edilen 2 hasta ön genetik tanının konfirmasyonu için beklemektedir. KCNC1 geninde c.959G>A mutasyonu analizi sonucunda Türk populasyonunda mutasyon saptanmamıştır. Bu çalışma Türkiye'de PME hastalarında KCNC1 ile ilgili mutasyonların araştırıldığı ilk çalışma olması nedeniyle önemlidir. Elde ettiğimiz veriler Türk populasyonunda KCNC1 geninde c.959G>A mutasyonunun PME'nin en yaygın nedenlerinden biri olmayabileceğini düşündürmektedir. Bununla birlikte Türk populasyonunda CSTB genindeki dodekamer tekrarların PME'ye neden olan en yaygın faktörlerden biri olabileceğini göstermektedir. PME ile ilgili diğer genlerin de analiz edilmesi amacıyla“Yeni Nesil Dizileme Tekniği”ile çalışmanın kapsamının genişletilmesi bu çalışmanın ilerideki hedefini oluşturacaktır.

Özet (Çeviri)

Progressive myoclonus epilepy (PME) is caused by rare diseases and show myoclonus, tonic-clonic seizures and progressive cognitive decline. The phenotypes of PMEs are quite similar. Therefore, it is difficult to establish a definite ethiological clinical diagnosis. Recent genetic studies have shown that c.959G> A change in the KCNC1 gene and 5' dodecamer repeats in the promoter region of the CSTB gene are common mutations that cause PME. In this study KCNC1 and CSTB genes were investigated to test for PME diagnosis as a biomarker. Genetic analysis were performed in 19 Turkish patients who followed up with PME. Dodecamer repeats in the 5' promoter region of CSTB gene in ULD patients were examined by Touchdown-PCR and KCNC1 single point polymorphism were examined by Sanger sequencing. In a cohort of 19 patients, two possible ULD patients (10%) were identified by dodecamer expansion analysis in CSTB gene and the clinical findings of these patients were consistent with the literature. These two patients are waiting for a confirmation of the pre-genetic diagnosis. The mutation analysis of c.959G> A in KCNC1 gene resulted in no mutation in the Turkish population. Our data suggest that c.959G> A mutation in KCNC1 gene may not be one of the most common causes of PME, whereas dodecamer expansion mutation in the CSTB gene may be one of the most common causes of PME in the Turkish population. In order to analyze other PME related genes“next-generation sequencing technique”will form the future goal of this work.

Benzer Tezler

  1. Progresif miyoklonik epilepsilerde tüm ekzom dizileme yöntemi ile ilişkili genlerinin araştırılması

    Investigation of genes in progressive myoclonic epilepsies with all whole exome sequencing

    GAREN HARYANYAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    Genetikİstanbul Üniversitesi

    Genetik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. SİBEL AYLİN UĞUR İŞERİ

  2. Progresif miyoklonik epilepsilerin klinik, genetik ve elektrofizyolojik özellikleri

    Genetic, clinic, and electrophysiologic features in progresive myoclonic epilepsy

    ÖZGÜL ESEN ÖRE

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2011

    Nörolojiİstanbul Üniversitesi

    Sinir Bilimi Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. NERSES BEBEK

  3. Glisin reseptör antikoru pozitif kriptojenik fokal epilepside periferik kan hücrelerinin immünfenotiplendirilmesi ve antijenik yanıtlarının araştırılması

    Immunophenotyping and investigation of antigenic responses of peripheral blood cells in glycine receptor antibody positive cryptogenic focal epilepsy

    ELİF ŞANLI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    Allerji ve İmmünolojiİstanbul Üniversitesi

    Sinir Bilimi Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ERDEM TÜZÜN

  4. Myoklonusun klinik ve elektrofizyolojik değerlendirilmesi

    Başlık çevirisi yok

    ÖMER HAKAN YAVAŞOĞLU

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    1995

    NörolojiErciyes Üniversitesi

    Nöroloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. FEHİM ARMAN

  5. Molecular genetic analysis of lafora disease and dravet's syndrome

    Lafora hastalığı ve dravet sendromunun moleküler genetik analizi

    SEDA SALAR

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2008

    GenetikBoğaziçi Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. S. HANDE ÇAĞLAYAN