Salmonella typhimurium biyofilm yapılarında eDNA' nın rolü ve biyofilm ile mücadelede enzim ve antibiyotik uygulaması yoluyla biyofilm yapılarının zayıflatılması
The role of eDNA on biofilm structures of salmonella typhimurium and combat with biofilm structures via enzyme and antibiotic treatment to weakening of the biofilm
- Tez No: 507053
- Danışmanlar: PROF. DR. MUSTAFA AKÇELİK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Mikrobiyoloji, Biology, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2018
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ankara Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 116
Özet
Çalışmamızda gıda kökenli bir patojen olan Salmonella cinsine ait bir serovaryetenin iki suşunda (S. Typhimurium SL1344 ve DMC4) biyofilm oluşumu üzerine eDNA' nın rolünün belirlenmesi ve çeşitli nükleazların konvansiyonel antibiyotiklerle kombine edilerek biyofilm ile mücadelede etkinliklerinin tanımlanması amaçlanmıştır. Bu doğrultuda gerçekleştirilen denemeler sonucunda, denemeye alınan her iki suşta da kullanılan antibiyotiklerin biyofilm oluşumunu büyük oranda eradike etmesine rağmen, deoksiribonükleazların (DNaz I ve Benzonase®) Salmonella biyofilmlerinin eradikasyonunda etkin ajanlar olmadığı saptanmıştır. Bunun yanı sıra antibiyotikler ve enzimler kombine edilerek Salmonella biyofilmlerine uygulandığında, biyofilm biyokütlesine yine enzimlerden ziyade antibiyotiklerin etki gösterdiği belirlenmiştir. Çeşitli enzimlerle muamele edilen ve enzim muamelesi yapılmayan nükleik asitlerin varlığında geliştirilen Salmonella biyofilmlerinde eDNA' nın biyofilm miktarını azalttığı; bunun yanında özellikle nükleazlarla muamele edilen nükleik asitlerin bulunduğu kuyularda biyofilm miktarının arttığı tespit edilmiştir. Bu sonuçlar Salmonella biyofilmlerinin olgunlaşması üzerinde hücre dışı DNA' nın (eDNA ve gDNA) inhibisyon etkisine sahip olduğunu kanıtlamaktadır.
Özet (Çeviri)
In our study, it was aimed to determine the role of eDNA in the formation of biofilms in two strains (S. Typhimurium SL1344 and DMC4) of a serovar of a genus Salmonella, a foodborne pathogen, and to identify the activities of various nucleases in combat with biofilms by combining them with conventional antibiotics. As a result of the experiments carried out in this direction, it was determined that deoxyribonucleases did not act as effective agents in the eradication of Salmonella biofilms, although the antibiotics used in both tested strains eradicated biofilm formation. Furthermore, when antibiotics and enzymes were combined and applied to Salmonella biofilms, it was determined that antibiotics were more effective than enzymes on biofilm biomass. In Salmonella biofilms developed in the presence of nucleic acids treated with various enzymes and not subjected to enzyme treatment, it has been found that the amount of biofilm is increased in the wells when the eDNA reduces the amount of biofilm, as well as the nucleic acids treated with nucleases in particular. These results demonstrate that Salmonella extracellular DNA (eDNA and gDNA) have an inhibitory effect on maturation of Salmonella biofilms.
Benzer Tezler
- Türkiye'den izole edilen Salmonella suşlarının biyofilm oluşturma özelliklerinin tanımlanması
Identification of biofilm forming abilities of Salmonella strains isolated from Turkey
BAŞAR KARACA
- Salmonella ınfantis suşlarının oluşturduğu biyofilm üzerine çevresel ve genetik faktörlerin etkisinin araştırılması
Effect of environmental and genetic factors on biofilm formation of the salmonella infantis strains in turkey
HAFİZE DİLŞAD AÇIKALIN
Yüksek Lisans
Türkçe
2017
MikrobiyolojiAnkara ÜniversitesiMikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. H.KAAN MÜŞTAK
- Karbon kaynaklarının salmonella typhimurium'da biyofilm oluşumu üzerindeki etkinliğinin matematiksel modellemesi
Mathematical modeling of the efficacy of carbon sources on biofilm formation in salmonella typhimurium
HALE ELÇİN LATİFİ
- Laktik asit bakterilerinin Salmonella biyofilmi üzerine inhibisyon etkisi
Inhibition effect of lactic acid bacteria on Salmonella biofilm
ŞEYMA GÖKSEL
- Salmonella typhimurium'da CsgD regülasyonunun otoindüktör-2 aktivitesine ve quorum sensing ilişkili küçük RNA'ların ekspresyon seviyelerine etkilerinin belirlenmesi
Determination of the effects CsgD regulation on autoinducer-2 activity and expression levels of quorum sensing related small RNAs in salmonella typhimurium
MELİH AŞAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
BiyoteknolojiAnkara ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. NEFİSE AKÇELİK