Peynirden izole edilen yüksek seviyede aminoglikozid dirençli (YSAD) enterokoklarda virülens faktörlerin fenotipik ve genotipik yöntemlerle araştırılması
Investigation of virulence factors in high-level aminoglycoside resistant (HLAR) enterococci isolated from cheese
- Tez No: 507778
- Danışmanlar: PROF. DR. YASİN TUNCER
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Gıda Mühendisliği, Food Engineering
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2018
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Süleyman Demirel Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 76
Özet
Bu çalışmada, önceden peynir örneklerinden izole edilmiş 54 yüksek-seviyede aminoglikozid dirençli (YSAD) enterokok suşunda (25 E. faecalis, 15 E. faecium, 12 E. durans ve 2 E. gallinarum) jelatinaz (gelE), hücre duvarı adhezinleri (efaAfm, efaAfs) , seks feromonları (cdp, cob, ccf, cad), kollojen bağalayan protein (ace, acm), agregasyon maddesi (agg), sitolizin (cylM, cylB, cylA), hiyaluronidaz (hyl) ve hücre duvarı ile ilişkili proteini (espfm, espfs) kodlayan virülens faktör genlerinin varlığı polimeraz zincir reaksiyonu (PZR) ile araştırıldı. Ayrıca jelatinaz ve hemolitik aktivite özellikleri fenotipik olarak test edildi. Bu suşların jelatinaz ve hemolitik aktiviteleri fenotipik yötemlerle incelendi. PCR sonuçları, E. faecium RS32.2 hariç tüm suşlarda en az bir virülens genin tespit edildiğini gösterdi. YSAD enterokok suşlarında en sık tespit edilen virülens genler ccf (48/54, % 88.89), efaAfs (46/54, % 85.19), acm (42/54, % 77.78), gelE (32/54, % 59.2), cpd (28/54, % 51.85), espfs (27/54, % 50) ve ace (20/54, % 37.04)' dir. efaAfm, cob, agg, cylA, hyl, cylB ve espfm genleri sırasıyla YSAD enterokok suşlarının % 20.37 (11/54), % 9.26 (5/54), % 9.26 (5/54), % 9.26 (5/54), % 5.56 (3/54), % 3.70 (2/54) ve % 1.85 (1/54)' inde tespit edildi. Enterokok suşlarının hiçbirinin cad ve cylM geni içermerdiği gösterilmiştir. Hemolitik aktivite test sonuçları, % 48.15 (26/54), % 46.30 (25/54) ve % 5.55 (3/54) suşun sırasıyla α, γ ve β hemolitik olduğunu göstermiştir. Sadece 3 YSAD suşunun jelatinaz ürettiği belirlenmiştir. Bu sonuç 30 YSAD enterokok suşunun sessiz gelE geni içerdiğini göstermiştir. Sonuç olarak, peynir örneklerinden izole edilen YSAD enterokok suşlarında yüksek oranda virülens faktör kodlayan gen tespit edilmesi tüketici sağlığı için endişe uyandırıcıdır.
Özet (Çeviri)
In this study, 54 high-level aminoglycoside resistant (HLAR) enterococci (25 E. faecalis, 15 E. faecium, 12 E. durans and 2 E. gallinarum) previously isolated from cheese samples were investigated by polymerase chain reaction (PCR) for presence of virulence factor genes encoding gelatinase (gelE), cell wall adhesin (efaAfm, efaAfs), sex pheromones (cpd, cob, ccf, cad), collagen-binding protein (ace, acm), aggregation substance (agg), cytolysin (cylM, cylB, cylA), hyaluronidase (hyl) and cell wall-associated protein (espfm, espfs). In addition, gelatinase and haemolytic activities of strains were also investigated by phenotypic methods. PCR results showed that at least one virulence gene was detected in all strains, except for E. faecium RS32.2. Most frequently detected virulence genes in HLAR enterococci strains were ccf (48/54, 88.89%), efaAfs (46/54, 85.19%), acm (42/54, 77.78%), gelE (32/54, 59.26%), cpd (28/54, 51.85%), espfs (27/54, 50%) and ace (20/54, 37.04%). The efaAfm, cob, agg, cylA, hyl, cylB and espfm genes were detected in 20.37% (11/54), 9.26% (5/54), 9.26% (5/54), 9.26% (5/54), 5.56% (3/54), 3.70% (2/54) and 1.85% (1/54) of HLAR enterococci strains, respectively. None of the strains carried the cad and cylM genes. Haemolytic activity test result showed that 48.15 % (26/54), 46.30 % (25/54) and 5.55 % (3/54) of strains were found α, γ and β haemolytic, respectively. It has been determined that only three HLAR strains produce gelatinase. This result showed that 30 HLAR enterococci strains contain silent gelE gene. In conclusion, high incidence of virulence factors encoding gene detection in HLAR enterococci strains isolated from cheese samples is a concern for consumer health.
Benzer Tezler
- Beyaz peynirden izole edilen antimikrobiyel aktiviteye sahip muhtemel enterokok suşunun tanısı ve fonksiyonel özelliklerinin belirlenmesi
Identification of presumptive enterococcus strain with antimicrobial activity isolated from white cheese and determination of its functional properties
MELİKE SEDA TOPLU
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
Gıda MühendisliğiSüleyman Demirel ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. BANU ÖZDEN TUNCER
- Mihaliç peynirinden izole edilen propiyonik asit bakterileri ile konjuge linoleik asidi arttırılmış peynir üretimi
Production of cheese with high cla content by propionibacterium isolated from Mihaliç cheese
GÖKSEL TIRPANCI SİVRİ
Doktora
Türkçe
2020
Gıda MühendisliğiTekirdağ Namık Kemal ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ÖMER ÖKSÜZ
- Peynirden izole edilen çeşitli Bacillus türlerinin 16S sRNA yöntemi ile tanılanması
Identification of various Bacillus species isolated from cheese by 16S sRNA method
EMRE DAVARCI
Yüksek Lisans
Türkçe
2017
BiyoteknolojiAtatürk ÜniversitesiTarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. NESLİHAN DİKBAŞ
- Beyaz peynirden izole edilen cyrptococcus humicola suşlarının starter aktivitelerinin araştırılması
Investigation of starter activity of the yeast species cryptococcus humicola isolated from white cheese
SELDA MOTAMENİ
- Yöresel peynirden izole edilen gram pozitif bir bakterinin ürettiği bakteriyosinin karakterizasyonu
Characterization of bacteriocin produced by a gram positive bacteria isolated from traditional cheese
HİLAL İŞLEROĞLU
Yüksek Lisans
Türkçe
2006
Gıda MühendisliğiGaziosmanpaşa ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ.DR. ZELİHA YILDIRIM