Yoğunluk Fonksiyonel Teori Temelli Kantitatif Yapı-Etki Analizleri (QSAR): Kumarin Moleküllerinin Karbonik Anhidraz Enzimine Karşı İnhibisyon Etkisinin Modellenmesi
Yoğunluk Fonksiyonel Teori Temelli Kantitatif Yapı-Etki Analizleri (QSAR): Kumarin Moleküllerinin Karbonik Anhidraz Enzimine Karşı İnhibisyon Etkisinin Modellenmesi
- Tez No: 508198
- Danışmanlar: PROF. DR. SÜLEYMAN YILMAZ, DOÇ. DR. EROL EROĞLU
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Fizik ve Fizik Mühendisliği, Physics and Physics Engineering
- Anahtar Kelimeler: Kumarin, Karbonik Anhidraz, DFT, QSAR, Çoklu Doğrusal Regresyon Analizi, Coumarin, Carbonic Anyhrase, DFT, QSAR, Multi Linear Regression Analysis
- Yıl: 2017
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Aksaray Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Fizik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Fizik Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 128
Özet
Bu tez çalışmasında, 50 den fazla kumarin, kükürt içeren kumarin ve kükürt içermeyen kumarin türevlerinin Karbonik anhidraz izoformlarından IX (CAIX) ve II (CA II) ye karşı deneysel inhibisyon katsayısı (Ki) ve hesaplanmış moleküler tanımlayıcıları arasındaki korelasyon ile DFT (Yoğunluk Fonksiyonel Teorisi) bazlı QSAR(Kantitatif Yapı-Etki Analizi İlişkileri) modelleri elde edildi. Kumarinlerin 3 boyutlu yapıları Gaussian 09 yazılımı ile hesaplandı. Oluşturulan bu yapılar Codessa 3 programına yüklendi ve pek çok sayıda moleküler tanımlayıcı hesaplanarak deneysel olarak ölçülmüş biyolojik aktivite değerleri ile arasındaki korelasyon Çoklu Doğrusal Regresyon Analizi ile sağlandı. CAIX için kükürt içeren kumarin modeli, fiziksel olarak yorumlanabilir moleküler tanımlayıcılar içeren istatistiksel olarak önemli bir küresel model olan 3 parametreli lineer denklemin istatistiki değerleri N=17, R2=0.943, Q2=0.872, F=44.586 ve Rext2=0.993'dir.
Özet (Çeviri)
In this study present DFT (Density Functional Theory) based QSAR (Quantitative Structure Activity Relationship) models that demonstrate the correlations between calculated molecular descriptors and the experimental inhibition constant (Ki) data of more than fifty derivatives of coumarin, sulfo coumarin and nonsulfo coumarin measured against Carbonic anhydrase isoforms IX (CA IX) and II (CA II). 3D structures of coumarins have been calculated by Gaussian 09. These structures, was loaded into the Codessa 3 programme, and many moleculer descriptor values calculated and experimentally measured the correlation between biological activity with Multi Linear Regression Analysis was performed. The sulfo coumarin model for CA IX, statistically the most significant one which comprises physically interpretable molecular descriptors is a five-parameter linear equation with the statistical values N=17, R2=0.943, Q2=0.872, F=44.586 ve Rext2=0.99.
Benzer Tezler
- Computational design and analysis of nanostructured materials for neuromorphic engineering
Neuromorfik mühendislik için nano yapılı malzemelerin hesaplamalı tasarımı ve analizi
AYKUT TURFANDA
Doktora
İngilizce
2024
Mühendislik Bilimleriİstanbul Teknik ÜniversitesiNanobilim ve Nanomühendislik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HİLMİ ÜNLÜ
- Cis-platin ve carbo platin arasındaki eps farkının gaussian ile hesabı
Calculation of eps difference between cis-platin and carbo platinum with gaussian
HATİCE AKÇAM
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
Fizik ve Fizik Mühendisliğiİnönü ÜniversitesiFizik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ALİ BAYRİ
- Magneto-optical and multiferroic oxide thin films, integrated nonr eciprocal photonic devices and multiferroic memory devices
Manyeto-optik ve multiferroik oksit ince filmler, tümleşik karşılıklı olmayan fotonik aygıtlar ve multiferroik bellek aygıtları
MEHMET CENGİZ ONBAŞLI
Doktora
İngilizce
2015
Elektrik ve Elektronik MühendisliğiMassachusetts Institute of TechnologyMalzeme Bilimi ve Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. CAROLINE A ROSS
- Multiscale computational investigation of the kynurenine 3-monooxygenase catalyzed hydroxylation reaction
Kinürenin 3-monooksijenaz katalizli hidroksilasyon tepkimesinin çok boyutlu hesaplamalı kimya yöntemleriyle incelenmesi
YILMAZ ÖZKILIÇ
- Computational investigation of battery materials using density functional theory
Yoğunluk fonksiyonel teorisi kullanılarak pil malzemelerinin hesaplamalı incelenmesi
DOAA AASEF AHMED AHMED
Doktora
İngilizce
2023
EnerjiSakarya ÜniversitesiNanobilim ve Nanomühendislik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. TUĞRUL ÇETİNKAYA