Pelemir ( Cephalaria syriaca ) genomunda yer alan tekrarlayan DNA dizilerinin moleküler klonlanması
Molecular cloning of repetitive DNA sequences in the genome of cephalaria ( Cephalaria syriaca )
- Tez No: 514571
- Danışmanlar: DOÇ. DR. AHMET LATİF TEK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Ziraat, Biotechnology, Agriculture
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2018
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Niğde Ömer Halisdemir Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tarımsal Genetik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 111
Özet
Yeryüzündeki yaşamın sürekliliği için bitkiler mutlak gereklidir. Bir bitkinin hücre çekirdeğindeki haploid kromozom setini oluşturan DNA miktarının tamamı, o bitkinin genomunu oluşturur. Genellikle bitki genom büyüklüğü, genom yapısı ve bu yapının özellikleri türe özgüdür. Genom büyüklüğündeki değişkenliklerin temelini genomda farklı yaygınlıkta ve farklı özellikleriyle yer alan tekrarlayan DNA dizileri oluşturmaktadır. Bu çalışmada yeni kültüre alınıp çeşit tescili yapılan pelemir (Cephalaria syriaca L.) bitkisinin genomunu oluşturan ve genom içinde yaygın olarak bulunan tekrarlayan DNA elementlerinin tanımlanması hedeflenmiştir. Bu amaca sistematik olarak ulaşmak için pelemir bitkisinin genom ve kromozom özelliklerinin analizine yönelik ribozomal DNA'ların kromozom üzerindeki yerlerinin tespit edilmesi, rekombinant klon temelli tekrar dizilerinin izolasyonu, yeni nesil dizileme verilerinin biyoinformatik analizi ve elde edilen satelit tekrarların FISH yöntemiyle haritalanması gerçekleştirilmiştir. Bu tanımlamalar, pelemir genom yapısını oluşturan DNA elementlerinin içeriğine ve dinamiklerine ışık tutan ilk kapsamlı çalışmayı oluşturmaktadır.
Özet (Çeviri)
Plants are necessary for the continuity of life on Earth. The amount of DNA that makes up the haploid chromosome set in the cell nucleus of a plant is called the genome. Generally, plant genome size, genome structure, and features of this structure are species specific. The basis of variability in genome size is the repetitive DNA sequences present in the genome with different abundance and different characteristics. In this study, we aimed to identify the repetitive DNA elements, which are common in the genome of Cephalaria syriaca L.. In order to systematically achieve this goal, mapping of ribosomal DNA sites on chromosomes, isolation of recombinant clone-based repeat sequences, and bioinformatics analysis of next generation sequencing data were performed for analysis of genomic and chromosomal characteristics of Cephalaria syriaca L.. Our results constitute the first comprehensive study that sheds light on the content and dynamics of the DNA elements forming the Cephalaria genome structure.
Benzer Tezler
- Pelemir (Cephalarıa syrıaca) unu katkısının unlu mamullerde protein kompozisyonuna etkisi
The effect of pelemir (Cephalaria syriaca) flour additive on protein composition in bakery products
ESMA ÖNDER
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
Beslenme ve Diyetetikİstanbul Sabahattin Zaim ÜniversitesiBeslenme ve Diyetetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. GÖKÇE MEREY
- Zayıf unların ekmeklik kalitelerinin pelemir (Cephalaria syriaca) ekstraktı ilavesiyle geliştirilmesi
Improvement of bread quality of weak flour with pelemir (Cephalaria syriaca) extract
ELİF ŞEYMA USLU
Yüksek Lisans
Türkçe
2016
Gıda MühendisliğiYıldız Teknik ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. FATİH TÖRNÜK
- Farklı doğal bitkisel katkıların organik ekmek üretiminde kullanılması ve kalite üzerine etkileri
The usage of different natural additives in organic bread baking and effects on the qualty
HÜSEYİN BOZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2008
Gıda MühendisliğiAtatürk ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. M. MURAT KARAOĞLU
- Türkiye doğal florasından toplanmış pelemir (Cephalaria syriaca) genotiplerinin moleküler karakterizasyonu ve ıslahta kullanılacak genotiplerin belirlenmesi
Molecular characterization of pelemir (Cephalaria syriaca) genotypes collected from the natural flora of turkey and determination of genotyes to be used in breeding
BERFİN İŞLER
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
BiyoteknolojiBolu Abant İzzet Baysal ÜniversitesiTarla Bitkileri Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. YUSUF ARSLAN
PROF. DR. FAHEEM SHAHZAD BALOCH
- Türkiye doğal florasından toplanmış pelemir (Cephalaria syriaca L.) genotiplerinin agromorfolojik özelliklerinin araştırılması ve ıslahta kullanılacak genotiplerin belirlenmesi
Investigation of agromorphological characteristics of pelemir (Cephalaria syriaca L.) genotypes collocted from natural flora of Turkey and determination of genotypes to be used in breeding
FATİH PARLAK
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
ZiraatBolu Abant İzzet Baysal ÜniversitesiTarla Bitkileri Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. YUSUF ARSLAN
DOÇ. DR. İLHAN SUBAŞI