Pelemir ( Cephalaria syriaca ) genomunda yer alan tekrarlayan DNA dizilerinin moleküler klonlanması
Molecular cloning of repetitive DNA sequences in the genome of cephalaria ( Cephalaria syriaca )
- Tez No: 514571
- Danışmanlar: DOÇ. DR. AHMET LATİF TEK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Ziraat, Biyoteknoloji, Agriculture, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: DNA, DNA restriksiyon enzimleri, DNA-satellit, Dizi analizi-DNA, FISH, Plazmit DNA, Rekombinant DNA teknolojisi, DNA, DNA restriction enzymes, DNA-satellite, Sequence analysis-DNA, FISH, Plasmit DNA, Recombinant DNA technology
- Yıl: 2018
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Niğde Ömer Halisdemir Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tarımsal Genetik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Yeryüzündeki yaşamın sürekliliği için bitkiler mutlak gereklidir. Bir bitkinin hücre çekirdeğindeki haploid kromozom setini oluşturan DNA miktarının tamamı, o bitkinin genomunu oluşturur. Genellikle bitki genom büyüklüğü, genom yapısı ve bu yapının özellikleri türe özgüdür. Genom büyüklüğündeki değişkenliklerin temelini genomda farklı yaygınlıkta ve farklı özellikleriyle yer alan tekrarlayan DNA dizileri oluşturmaktadır. Bu çalışmada yeni kültüre alınıp çeşit tescili yapılan pelemir (Cephalaria syriaca L.) bitkisinin genomunu oluşturan ve genom içinde yaygın olarak bulunan tekrarlayan DNA elementlerinin tanımlanması hedeflenmiştir. Bu amaca sistematik olarak ulaşmak için pelemir bitkisinin genom ve kromozom özelliklerinin analizine yönelik ribozomal DNA'ların kromozom üzerindeki yerlerinin tespit edilmesi, rekombinant klon temelli tekrar dizilerinin izolasyonu, yeni nesil dizileme verilerinin biyoinformatik analizi ve elde edilen satelit tekrarların FISH yöntemiyle haritalanması gerçekleştirilmiştir. Bu tanımlamalar, pelemir genom yapısını oluşturan DNA elementlerinin içeriğine ve dinamiklerine ışık tutan ilk kapsamlı çalışmayı oluşturmaktadır.
Özet (Çeviri)
Plants are necessary for the continuity of life on Earth. The amount of DNA that makes up the haploid chromosome set in the cell nucleus of a plant is called the genome. Generally, plant genome size, genome structure, and features of this structure are species specific. The basis of variability in genome size is the repetitive DNA sequences present in the genome with different abundance and different characteristics. In this study, we aimed to identify the repetitive DNA elements, which are common in the genome of Cephalaria syriaca L.. In order to systematically achieve this goal, mapping of ribosomal DNA sites on chromosomes, isolation of recombinant clone-based repeat sequences, and bioinformatics analysis of next generation sequencing data were performed for analysis of genomic and chromosomal characteristics of Cephalaria syriaca L.. Our results constitute the first comprehensive study that sheds light on the content and dynamics of the DNA elements forming the Cephalaria genome structure.
Benzer Tezler
- Bazı yabancı ot tohumlarının unun kalitesine etkileri
Başlık çevirisi yok
HAKKI KARADELİ
Yüksek Lisans
Türkçe
1993
Gıda MühendisliğiAnkara ÜniversitesiGıda Bilimi ve Teknolojisi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HAZIM ÖZKAYA
- Bayburt ili, arpa, buğday, mercimek ve şeker pancarı tarlalarında görülen yabancı otlar, yoğunlukları, topluluk oluşturma durumları ve tohumlarının ürüne karışma oranları üzerinde araştırmalar
Determination of weed species, their density and community in the field of barley, wheat, lentil and sugar beat, their ration in seed of barley, wheat and lentil grown in the province of Bayburt
ŞABAN KORDALİ
- Salat Tepe'de arkeobotanik çalışmalar
Archeobotanical studies at Salat Tepe
ELİF CİHANGİR
Yüksek Lisans
Türkçe
2006
BotanikHacettepe ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ.DR. EMEL OYBAK DÖNMEZ
- Farklı doğal bitkisel katkıların organik ekmek üretiminde kullanılması ve kalite üzerine etkileri
The usage of different natural additives in organic bread baking and effects on the qualty
HÜSEYİN BOZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2008
Gıda MühendisliğiAtatürk ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. M. MURAT KARAOĞLU
- Süne (Eurygaster spp.) zararı görmüş buğdaylara farklı seviyelerde pelemir unu (Cephalaria syriaca spp.) uygulamasının ekmekçilik kalitesi üzerine etkisi
The effects of Cephalaria syriaca spp. flour treatment at different levels on breadmaking quality of wheat damaged by bugs
ŞULE AKBAŞ
Yüksek Lisans
Türkçe
2010
Gıda MühendisliğiAtatürk ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. M. MURAT KARAOĞLU