Geri Dön

Identification of the roles played by IKKε in hepatocellular and colorectal carcinogenesis

Hepatosellüler ve kolorektal karsinogenezde IKKε'un oynadığı rollerin belirlenmesi

PDF İndir

  1. Tez No: 519412
  2. Yazar: UĞUR KAHYA
  3. Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ SERKAN İSMAİL GÖKTUNA
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Bilim ve Teknoloji, Biyoloji, Biyoteknoloji, Science and Technology, Biology, Biotechnology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2018
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: İhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi
  10. Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: 113

Özet

Hepatoselüler karsinomlar (HSK) ve kolorektal karsinomlar (KRK), yüksek mortalite oranlarıyla dünya çapında en sık görülen kanserler arasındadır. HSK çoğunlukla azgelişmiş ülkeleri etkilerken, KRK esas olarak daha gelişmiş ülkelerde görülen bir hastalıktır. Bilindiği gibi, KRK en sık görülen üçüncü kanserdir ve tümörlerin erken teşhisi üzerine cerrahi olarak çıkarılması hala elimizdeki en iyi araç olmakla birlikte, ileri KRK'lı hastaları iyileştirmek için daha iyi stratejiler geliştirmek son derece önemlidir. Dahası, HSK hastalarının hayatta kalma oranları, kötü prognoz nedeniyle çok düşüktür ve HSK için en etkili tedavi organ naklidir. Bir multikinaz inhibitörü olan Sorafenib, HSK için kullanılan en etkili kemoterapötik ajandır ancak ilaç direncine neden olmaktadır. Bu nedenle, hastalıksız sağkalımı uzatmak ve bu kanseri tedavi etmek için alternatif stratejiler geliştirilmelidir. Kanser için en önemli risk faktörlerinden biri kronik iltihaptır ve vakaların yaklaşık olarak % 90'ı inflamasyon ve karaciğer hasarından kaynaklanması nedeniyle, HSK enflamasyonla ilişkili kansere iyi bir örnektir. Çözülmemiş kronik inflamasyonun bir sonucu olarak, HSK sıralı bir şekilde fibrozis ve siroz'u takip ederek meydana gelir. Ayrıca, tümörle ilişkili inflamasyon bağırsaktaki tümör gelişimini teşvik edebilir, bu da hem sporadik KRK hem de kolit ilgili KRK gelişiminde inflamasyonun merkezi rolünü gösterir. Bu tez çalışmasında, IKKε'nin hepatoselüler ve kolorektal karsinogenezde oynadığı rolleri anlamak amaçlanmıştır. Halka açık verilerle yapılan ilk biyoinformatik analizimiz, in siliko olarak HSK hastalarında yüksek IKKε amplifikasyonu göstermiştir. Ayrıca çalışmamızda, IKKε'nın HSK hücre proliferasyonu ve canlılığında önemli rol oynadığını gösterdik. Özellikle, IKKε tükenmesi üzerine, hem in vivo hem de in vitro olarak HSK hücre çoğalmasında azalma gözlemledik. Ayrıca, IKKε kaybı üzerine epitel markörların artması, HEP3B hücrelerinde tersine çevrilmiş EMT sürecini düşündürdü. Sonuç olarak, IKKε değerli bir prognostik biyobelirteç olabilir ve IKKε'u hedeflemek HSK tümörlerine karşı potansiyel bir tedavi stratejisi olabilir. Diğer taraftan, KRK'da, IKKε tükenmesinin, IKKε susturulmuş DLD1 ve SW480 hücrelerine bir büyüme avantajı sağladığını, bu tükenmenin in vivo ve in vitro proliferasyon artışı ile sonuçlandığını ve DLD1 hücrelerinde kısmi-EMT benzeri özelliklerin indüklenmesini sağladığını gösterdik. Bu nedenle IKKε tamamlanması, KRK tümörlerine karşı değerli bir potansiyel tedavi stratejisi olabilir.

Özet (Çeviri)

Hepatocellular carcinomas (HCC) and colorectal carcinomas (CRC) are among the most common cancers worldwide with high mortality rates. While HCC affecting mostly underdeveloped countries, CRC is a disease that mainly occur in more developed countries. As is known, CRC is the third most common cancer and the surgical removal of tumors upon early diagnosis is still the best tool in our hands, developing better strategies to cure patients with an advanced CRC has utmost importance. Furthermore, survival rates of HCC patients are very low as a result of poor prognosis and the most efficient therapy for HCC is organ transplantation. Sorafenib, a multikinase inhibitor, is the most effective chemotherapeutic agent in use for HCC leading drug resistance in HCC cells. Thus, alternative strategies should be developed to extend disease-free survival and to treat this cancer. One of the major risk factor for cancer is chronic inflammation and HCC is a good example of inflammation related cancer due to the fact that 90% of HCC cases are stem from inflammation and hepatic injury. As a result of unresolved chronic inflammation, sequential development of HCC occurs from fibrosis and cirrhosis. Moreover, tumor-associated inflammation can encourage tumor development in the gut, indicating central role for inflammation in the development of both sporadic CRC and CAC. In this thesis, our aim was to understand the roles played by IKKε in hepatocellular and colorectal carcinogenesis. Our preliminary bioinformatics analysis with publicly available data has shown high amplification of IKKε in HCC patients in silico. Also, we showed that IKKε plays important roles in HCC cell proliferation and viability. Specifically, upon IKKε depletion, we observed reductions in HCC cell proliferation both in vivo and in vitro. Furthermore, increase epithelial markers upon IKKε loss was suggesting reversed EMT process in HEP3B cells. Consequently, IKKε could be a valuable prognostic biomarker and targeting IKKε may be a potential therapeutic strategy against HCC tumors. On the other hand, in CRC, we demonstrated that IKKε depletion conferred a growth advantage to IKKε depleted DLD1 and SW480 cells and resulted in an increased proliferation in vivo and in vitro, and induced formation of partial-EMT like features in DLD1 cells. Therefore, IKKε complementation may be a valuable potential therapeutic strategy against CRC tumors.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    601583

    Kemençe, tanbur, ud, kanun ve bağlama çalgılarının 20. yüzyılda geçirdiği fiziksel değişimler

    The physical changes kemencha, tambour, oud, qanun and bağlama went through in the 20th century

    ZEKİ YILDIRIM

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    Müzikİstanbul Teknik Üniversitesi

    Müzikoloji ve Müzik Teorisi Ana Bilim Dalı

    PROF. SONGÜL KARAHASANOĞLU

  2. Tez No

    349002

    İstanbul Rum Ortodoks dini ritüellerde aidiyet algısı temsili

    Representation and identification of the Istanbulite Greek Orthodox in religious rituals

    NURDAN TÜRKER

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    AntropolojiYeditepe Üniversitesi

    Antropoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. AYBİL GÖKER

  3. Tez No

    414087

    Tamoxifen ve trastuzumab'a duyarlı meme kanseri hücrelerinde tamoxifen ve trastuzumab'a cevap veren mikroRNA (miRNA) profillerinin araştırılması

    The investigation of tamoxifen and trasuzumab responsive mirnas in tamoxifen and trastuzumab sensitive breast cancer cell lines

    SENEM NOYAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    BiyoteknolojiAnkara Üniversitesi

    Temel Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. BALA GÜR DEDEOĞLU

  4. Tez No

    85403

    Ürün kimliğinin belirleyiciliğinde amlalaj ve kimlik ilişkilerinin temel ilkeleri

    Basic principles of package and identity relations in product identity determination

    SANİYE MELTEM ÖZKARAMAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    1999

    Endüstri Ürünleri TasarımıMimar Sinan Güzel Sanatlar Üniversitesi

    Endüstri Ürünleri Tasarımı Ana Bilim Dalı

    PROF. GÜRKUT UYSAL

  5. Tez No

    647352

    Identification of genes conferring resistance to chemotherapeutic drugs

    Kemoterapötik ilaçlara karşı direnç kazandıran genlerin belirlenmesi

    İRFAN BAKİ KILIÇ

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2020

    BiyoteknolojiAcıbadem Mehmet Ali Aydınlar Üniversitesi

    Moleküler ve Translasyonel Biyotıp Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ EMRE DENİZ

Geri Dön