Soğan Sak nematodu (Ditylenchus dipsaci)' nun sarımsak bitkisinde moleküler karakterizasyonu
Molecular characterization of stem and bulb nematode (Ditylenchus dipsaci) on garlic
- Tez No: 524290
- Danışmanlar: DOÇ. DR. ÖZLEM ATEŞ SÖNMEZOĞLU
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2018
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Karamanoğlu Mehmetbey Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyomühendislik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Biyomühendislik Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 81
Özet
İnsan beslenmesinde olduğu kadar ekonomik olarak da önemli bir yere sahip olan sarımsak bitkisinin Türkiye' de geniş bir alanda üretimi yapılmaktadır. Sarımsak yetiştiriciliğinde üretimi kısıtlayan önemli biyotik streslerden biri olan, soğan sak nematodu olarak da bilinen Ditylenchus dipsaci (Kühn) karantinaya tabi olup bulunduğu yerlerde sarımsak üretimini büyük sekteye uğratmaktadır. Bu nedenle sarımsak yetiştirme alanlarında bölgesel olarak bulunan soğan sak nematodunun dağılım ve populasyon durumunun güncel olarak bilinmesi, sarımsak bitkisi üzerinde bulunan ırkların moleküler düzeyde tespiti ve o bölgede bulunan ırkların konukçu spektrumlarının bilinmesi büyük önem arz etmektedir. Bu çalışmanın amacı; Türkiye' nin en fazla sarımsak üretimi yapılan illerinden alınan soğan sak nematodu izolatlarının ITS-rDNA dizilerine spesifik moleküler markörler ile tür teşhislerinin yapılmasıdır. Çalışmada 2016 ve 2017 yıllarında Kastamonu, Amasya, Tokat, Aksaray, Tekirdağ, Balıkesir, Bursa, Hatay, Gaziantep, Kahramanmaraş, Adıyaman ve Kırklareli illerinde sarımsak yetiştirilen alanlardan alınan bitki ve toprak örneklerinden izole edilen nematodların moleküler taramaları sonucunda elde edilen verilerin filogenetik analizi ile incelenen nematodların tür teşhisleri yapılmıştır. Bu tezde türe spesifik 10 farklı SSR ve SCAR primeri ile moleküler taramalar yapılarak 58 adet nematod örneğinden 39 tanesinin Ditylenchus dipsaci olduğu tespit edilmiştir. Çalışma ile ülkemizde sarımsak yetiştirme alanlarında bulunan soğan sak nematodu ırklarının tespiti, bu nematoda karşı alınabilecek kontrol önlemlerinin daha bilinçli ve etkin bir şekilde yapılmasına yardımcı olacaktır.
Özet (Çeviri)
Garlic plant, which has an important place in the economy as well as in human nutrition, is grown extensively in Turkey. Ditylenchus dipsaci (Kühn), also known as the stem and bulb nematode, is one of the most important biotic stresses that limit the production in garlic cultivation and is under quarantine as it significantly interrupts garlic production wherever it emerges. Thus, being up to date regarding the distribution and population of the stem and bulb nematode, which is locally found in the areas of garlic cultivation, identification of the breeds found on the garlic plant at the molecular level and knowing the host spectra of the breeds found at the region are of great importance. The objective of this study is to perform species diagnosis of the ITS-rDNA sequences of the stem and bulb nematode isolates collected from the cities where the highest level of garlic cultivation is performed in Turkey using specific molecular markers. In the study, the types of nematodes have been identified using the phylogenetic analysis of the data obtained as a result of the molecular screening of the nematodes isolated from the plant and soil samples collected from the areas where garlic is cultivated in Kastamonu, Amasya, Aksaray, Tekirdağ, Balıkesir, Bursa, Hatay, Gaziantep, Kahramanmaraş, Adıyaman and Kırklareli provinces between 2016 and 2017. In this thesis, upon molecular screening using 10 different species-specific SSR and SCAR primers, it was found that 39 nematode samples of 58 are Ditylenchus dipsaci. Identification of the breeds of stem and bulb nematodes found in the areas of garlic cultivation in our country with this study will be useful in the conscious and efficient application of the preventive measures against this nematode.
Benzer Tezler
- Soğan sak nematodu (Ditylenchus dipsaci)'nun rDNA ITS bölgesine dayalı moleküler karakterizasyonu
Molecular characterization of stem and bulb nematode (Ditylenchus dipsaci) by rDNA ITS region
NİMET GENÇ
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
BiyomühendislikKaramanoğlu Mehmetbey ÜniversitesiBiyomühendislik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ÖZLEM ATEŞ SÖNMEZOĞLU
DR. ÖĞR. ÜYESİ ELİF YAVUZASLANOĞLU
- Karaman ili soğan yetiştirme alanlarında önemli bitki paraziti nematodların belirlenmesi ve soğan sak nematodu; ditylenchus dipsaci' nin biyolojisi ile kültürü üzerine çalışmalar
Determination of important plant parasitic nematodes on onion in karaman province and studies on biology and culture of stem and bulb nematode; di̇tylenchus di̇psaci̇
ABDULLAH DİKİCİ
Yüksek Lisans
Türkçe
2014
BiyolojiKaramanoğlu Mehmetbey ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. ELİF YAVUZASLANOĞLU
- Kök ur nematodları (Meloidogyne incognita, Meloidogyne javanica) ile soğan sak nematodu (Ditylenchus dipsaci)'nun bazı susam çeşitleri üzerinde gelişmelerinin araştırılması
Root-knot nematodes investigation of developments of (Meloidogyne incognita, Meloidogyne javanica) and stem nematode (Ditylenchus dipsaci) on some sesame types
İLAYDA ÜNSAL
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
ZiraatÇukurova ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
PROF. DR. İBRAHİM HALİL ELEKCİOĞLU
- Soğan bitkisinde (Allium cepa) soğan sak nematodu' nun (Ditylenchus dipsaci) zararına mikorizanın (Glomus intraradices) etkisinin araştırılması
Investigation of the effect of mycorrhizae (Glomus intraradices) on stem and bulb nematode (Ditylenchus dipsaci) on onion (Allium cepa)
BÜŞRA DELEN
Yüksek Lisans
Türkçe
2020
BiyomühendislikKaramanoğlu Mehmetbey ÜniversitesiBiyomühendislik Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ ELİF YAVUZASLANOĞLU
- Bazı bitki türlerinin soğan sak nematodu (Ditylenchus dipsaci) soğan ırkına konukçuluk durumlarının belirlenmesi
Determination of hosting ability of some plant species to stem and bulb nematode (Ditylenchus dipsaci) onion race
GAMZE ÇALIŞ
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
BiyomühendislikKaramanoğlu Mehmetbey ÜniversitesiBiyomühendislik Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ ELİF YAVUZASLANOĞLU