Geri Dön

Flexibility of C-terminus of cryptochrome protein for photoreceptor function

Fotoreseptör fonksiyonu için kriptokrom proteini'nin karboksi (C) ucunun esnekliği

PDF İndir

  1. Tez No: 526413
  2. Yazar: BİHTER MURATOĞLU
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. NURİ ÖZTÜRK
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Genetik, Biyoloji, Biyoteknoloji, Genetics, Biology, Biotechnology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2018
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Gebze Teknik Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Kriptokrom (CRY) proteinleri, sirkadiyen saatte fotoreseptör ya da çekirdek osilatör mekanizmasının bir parçası olarak işlev görür. Drosophila CRY (dCRY) proteini ışığa mazur kalınca, normalde FAD-bağlama alanına doğru kıvrılarak protein gövdesine yapışık olarak kapalı olan C-terminal ucu gevşeyerek açılır. FAD-bağlanma alanının C-terminalce maskelenmiş yüzeylerinin açılmasıyla JETLAG (JET) ve TIMELESS (TIM) proteininlerine bağlanmasını sağlar. Bu proteinlerin dCRY'ye bağlanması bir sinyal kaskadı başlatır. TIM degradasyonu saati sıfırlarken, CRY bozulması ise fotoreseptörün ortadan kaldırılmasıyla saatin sıfırlanmasını sağlar. dCRY'nin C-terminali fotoreseptör fonksiyonu için önemlidir. Çünkü C-terminalin silinmesi, sineklerde aritmiye neden olan konstitütif aktif bir form oluşturur. dCRY'nin C-terminalinin esnekliğini belirlemek için, dCRY'nin C-terminalini farklı organizmalardan Tip1, 2 ve Tip 4 CRY'leriyle değiştirdik. Daha sonra meyve sinek hücre hattı S2R+'daki bu rekombinant kimerik dCRY varyantlarını eksprese ettik. Bu hücre hattında, eksprese edilen dCRY, ışığa maruz kalmanın ardından proteazom yolağı tarafından degrade edilebilir ve bu rekombinant dCRY üzerindeki etiketlere karşı antikorlar kullanılarak immünoblot tekniği ile takip edilir. Kimeraların ışıkla aktive olan degradayonunu ölçtük. Uzak akraba CRY'lerin C-terminallerinin, Tip2 CRY'ler de bile dCRY'nin ışık-bağımlı proteolizi destekleyebildiğini gösterdik. CRY'nin tiplerinde korunmuş olan Arjinin amino asidinin mutasyonunun bile dCRY'nin ışık-bağımlı proteolizini engellemediğini de bulduk. Bu bulgular C-terminalin ışık-bağımlı fonksiyon(ları) için çok esnek olduğunu göstermektedir.

Özet (Çeviri)

Cryptochrome (CRY) proteins function as a photoreceptor or a component in the core circadian clock. Light exposure opens the C-terminus of Drosophila CRY (dCRY), which is normally bent towards the FAD-binding domain. This opening makes the masked surface of the FAD-binding domain accessible to JETLAG (JET) and TIMELESS (TIM) proteins for binding. The binding of these proteins to dCRY starts a signaling cascade resulting in the degradation of TIM and CRY TIM degradation resets the clock while CRY degradation gates the resetting of the clock by disrupting the photoreceptor function. The C-terminus of dCRY is important for photoreception because its deletion generates a constitutively active form causing arrhythmicity in flies. To determine the flexibility of the C-terminus, we replaced the C-terminus of dCRY with C-termini of Type1, 2, and 4 CRYs from different organisms. Then we expressed these chimeric dCRY variants in fruit fly cell line S2R+. In this cell line, expressed dCRY can be degraded by the proteasome pathway following light exposure and this degradation is followed by immunoblot technique. We measured the light activated degradation of chimera. We found that the replacement of C-terminus of dCRY with the C-termini from very distant CRYs, even from Type2 CRYs, can support the light-dependent proteolysis of dCRY. We also found that the mutation of an arginine residue in the C-terminus of dCRY, which is conserved in all types of CRYs, does not interfere with the light-dependent proteolysis of dCRY. These findings suggest that C-terminus is very flexible for the light-dependent function(s).

Benzer Tezler

  1. Tez No

    521377

    The ubiquitin/proteasome system related role of Bag-1L in breast cancer

    Bag-1L'in ubikuitin/proteazom sisteminde rolünün meme kanserinde incelenmesi

    SEVİLAY ACAR

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2018

    Genetikİstanbul Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)

    DOÇ. DR. GİZEM DİNLER DOĞANAY

  2. Tez No

    698677

    An exploration of alexithymia in adulthood: The predictive power of perceived parenting attitudes and cognitive flexibility

    Yetişkinlerde aleksitiminin incelenmesi: Algılanan ebeveyn tutumları ve bilişsel esnekliğin yordama gücü

    GİZEM AKKAYA

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2021

    PsikolojiYeditepe Üniversitesi

    Rehberlik ve Psikolojik Danışmanlık Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ AYŞEN KÖSE ŞİRİN

  3. Tez No

    65553

    Analysis of making plans for development and flexibility

    Üniversitelerin gelişme planlarının ve esnekliğinin analizi

    VEHBİ CANER ÖCAL

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    1997

    MimarlıkDokuz Eylül Üniversitesi

    DR. NERİME CİMCOZ

  4. Tez No

    1015882

    Molecular dynamıcs analysıs of chk2 mutatıons at the C-lobe of the kınase domaın

    Kinaz domaininin C-lobundaki chk2 mutasyonlarının moleküler dinamik analizi

    CİHAN UĞUR OTÇU

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2026

    Biyoteknolojiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)

    DOÇ. DR. MERT GÜR

  5. Tez No

    824065

    Virtual Prototypes of different Galileo/GPS Correlation Engines in System-C

    Farklı Galileo/GPS İlinti Motorları için System-C Dilinde Sanal Prototipler

    AHMET GÜNEŞ

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2006

    Elektrik ve Elektronik MühendisliğiUnıversıtat Duısburg-Essen

    Bilgisayar Bilimi ve Mühendisliği Bilim Dalı

    PROF. DR. AXEL HUNGER

Geri Dön