Flexibility of C-terminus of cryptochrome protein for photoreceptor function
Fotoreseptör fonksiyonu için kriptokrom proteini'nin karboksi (C) ucunun esnekliği
- Tez No: 526413
- Danışmanlar: DOÇ. DR. NURİ ÖZTÜRK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biyoteknoloji, Genetik, Biology, Biotechnology, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2018
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Gebze Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 66
Özet
Kriptokrom (CRY) proteinleri, sirkadiyen saatte fotoreseptör ya da çekirdek osilatör mekanizmasının bir parçası olarak işlev görür. Drosophila CRY (dCRY) proteini ışığa mazur kalınca, normalde FAD-bağlama alanına doğru kıvrılarak protein gövdesine yapışık olarak kapalı olan C-terminal ucu gevşeyerek açılır. FAD-bağlanma alanının C-terminalce maskelenmiş yüzeylerinin açılmasıyla JETLAG (JET) ve TIMELESS (TIM) proteininlerine bağlanmasını sağlar. Bu proteinlerin dCRY'ye bağlanması bir sinyal kaskadı başlatır. TIM degradasyonu saati sıfırlarken, CRY bozulması ise fotoreseptörün ortadan kaldırılmasıyla saatin sıfırlanmasını sağlar. dCRY'nin C-terminali fotoreseptör fonksiyonu için önemlidir. Çünkü C-terminalin silinmesi, sineklerde aritmiye neden olan konstitütif aktif bir form oluşturur. dCRY'nin C-terminalinin esnekliğini belirlemek için, dCRY'nin C-terminalini farklı organizmalardan Tip1, 2 ve Tip 4 CRY'leriyle değiştirdik. Daha sonra meyve sinek hücre hattı S2R+'daki bu rekombinant kimerik dCRY varyantlarını eksprese ettik. Bu hücre hattında, eksprese edilen dCRY, ışığa maruz kalmanın ardından proteazom yolağı tarafından degrade edilebilir ve bu rekombinant dCRY üzerindeki etiketlere karşı antikorlar kullanılarak immünoblot tekniği ile takip edilir. Kimeraların ışıkla aktive olan degradayonunu ölçtük. Uzak akraba CRY'lerin C-terminallerinin, Tip2 CRY'ler de bile dCRY'nin ışık-bağımlı proteolizi destekleyebildiğini gösterdik. CRY'nin tiplerinde korunmuş olan Arjinin amino asidinin mutasyonunun bile dCRY'nin ışık-bağımlı proteolizini engellemediğini de bulduk. Bu bulgular C-terminalin ışık-bağımlı fonksiyon(ları) için çok esnek olduğunu göstermektedir.
Özet (Çeviri)
Cryptochrome (CRY) proteins function as a photoreceptor or a component in the core circadian clock. Light exposure opens the C-terminus of Drosophila CRY (dCRY), which is normally bent towards the FAD-binding domain. This opening makes the masked surface of the FAD-binding domain accessible to JETLAG (JET) and TIMELESS (TIM) proteins for binding. The binding of these proteins to dCRY starts a signaling cascade resulting in the degradation of TIM and CRY TIM degradation resets the clock while CRY degradation gates the resetting of the clock by disrupting the photoreceptor function. The C-terminus of dCRY is important for photoreception because its deletion generates a constitutively active form causing arrhythmicity in flies. To determine the flexibility of the C-terminus, we replaced the C-terminus of dCRY with C-termini of Type1, 2, and 4 CRYs from different organisms. Then we expressed these chimeric dCRY variants in fruit fly cell line S2R+. In this cell line, expressed dCRY can be degraded by the proteasome pathway following light exposure and this degradation is followed by immunoblot technique. We measured the light activated degradation of chimera. We found that the replacement of C-terminus of dCRY with the C-termini from very distant CRYs, even from Type2 CRYs, can support the light-dependent proteolysis of dCRY. We also found that the mutation of an arginine residue in the C-terminus of dCRY, which is conserved in all types of CRYs, does not interfere with the light-dependent proteolysis of dCRY. These findings suggest that C-terminus is very flexible for the light-dependent function(s).
Benzer Tezler
- The ubiquitin/proteasome system related role of Bag-1L in breast cancer
Bag-1L'in ubikuitin/proteazom sisteminde rolünün meme kanserinde incelenmesi
SEVİLAY ACAR
Yüksek Lisans
İngilizce
2018
Biyolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. GİZEM DİNLER DOĞANAY
- Association analysis of glutathione S-transferase omega 1 and omega 2 genetic polymorphisms and ischemic stroke risk in Turkish population
Glutatyon S-transferaz omega 1 ve omega 2 gen polimorfizimleri ile Türk populasyonunda iskemik inme riski ilişkisinin incelenmesi
ESRA BİLGİN
Yüksek Lisans
İngilizce
2014
BiyokimyaOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyokimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ORHAN ADALI
- Caryophyllaeus laticeps'in (Cestoda) DNA tabanlı moleküler tanımlaması
Molecular identification of Caryophyllaeus laticeps (Cestoda) on DNA-based
SEMA DEMİRAYAK
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
MikrobiyolojiAfyon Kocatepe ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET OĞUZ ÖZTÜRK
- Amorf silisyum katkılı schottky diyotların optik ve elektriksel özelliklerinin incelenmesi
Investigation optical and electrical properties of amorphous silicon doped schottky diodes
GİZEM ÇELİKOK
Yüksek Lisans
Türkçe
2011
Fizik ve Fizik MühendisliğiYıldız Teknik ÜniversitesiFizik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. KUBİLAY KUTLU
- Yatay yönde zorlanmış silindirik sıvı tanklarının zemin-yapı etkileşimi üzerine bir çalışma
Başlık çevirisi yok
CEM AKTURAN