Tümör ile ilişkili peptidlerin sentezi ve kararlılıklarının incelenmesi
Synthesis and examination of stabilities of tumor-related peptides
- Tez No: 529178
- Danışmanlar: DOÇ. DR. MUHARREM AKCAN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyokimya, Biochemistry
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2018
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Dumlupınar Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyokimya Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 77
Özet
Bu tezde, lenf tümörü ile ilişkili LyP-1 peptidinin serum içerisindeki kararlılığının peptid omurgası siklizasyonu ve aşılama yöntemleri ile arttırılması çalışıldı. LyP-1 peptidinin halkalı homodimer ve SFTI-1 peptid iskelesinin iki ayrı hattına düz ve ters olarak aşılanmış versiyonları katı faz peptid sentez yöntemi (SPPS) ile sentezlendi. Sentezlenen peptidler ters faz yüksek basınçlı sıvı kromatografisi (RP-HPLC) ile saflaştırıldı ve fraksiyonların molekül ağırlıkları sıvı kromatografisi/kuadrupol-uçuş zamanlı kütle spektrometresi (LC-MS/QTOF) ile analiz edildi. Elde edilen peptidlerin saflığı analitik RP-HPLC ile kontrol edildikten sonra % 100 insan kan serumu içerisindeki kararlılıkları incelendi. Halkalı homodimer LyP-1 peptidi 24 saatin sonunda % 90 oranında serum içerisinde bozunmadan kalarak olağanüstü bir kararlılık gösterdi. Aşılama yöntemi ile de LyP-1 peptid epitopunun serum kararlılığı arttırılabildi. Sentezlenen peptidlerin hemolitik aktiviteleri incelendiğinde, hemolitik aktivitelerin maksimum % 10 oranında olduğu görüldü. Bu bulgular ilaç araştırma ve tasarım çalışmalarında yeni peptid yapılı terapötiklerin geliştirilmesi açısından faydalı olabilecektir.
Özet (Çeviri)
In this thesis, enhancement of the stability of lymph nodes related LyP-1 peptide in serum was studied by peptide backbone cyclization and grafting methods. Cyclic homodimer of LyP-1 peptide and its grafted versions as straight and retro sequences onto both SFTI-1 loops were synthesized using Fmoc solid phase peptide synthesis (SPPS). Synthesized peptides were purified by reversed phase high performance liquid chromatography (RP-HPLC) and the molecular weights of the fractions were analyzed with liquid chromatography/quadrupole-time-of-flight mass spectrometry (LC-MS/QTOF). After checking the purity, the stability of the peptides were determined in 100 % human blood serum. The cyclic homodimer LyP-1 peptide was showed an extraordinary stability as 90 % of the peptide remained intact in serum after 24 hour. In addition, the serum stability of LyP-1 peptide epitope can also be increased by grafting. While hemolytic activity of synthesized peptides were examined, the peptides have only maximum 10 % hemolytic activity. These findings may be useful in the development of new peptide based therapeutics in drug development and design studies.
Benzer Tezler
- Synthesis of dye-conjugated PD-L1 targeted peptides for use in pet/ct in diagnosis of lung cancer
Akciğer kanseri teşhisi için PET/CT sistemlerinde kullanılacak PD-L1 proteini hedefli boya takılı peptitlerin sentezi
SAADET YEŞİLMEN
Yüksek Lisans
İngilizce
2024
Biyokimyaİstanbul Teknik ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ONUR ALPTÜRK
DR. ÖZGÜR YILMAZ
- Mikozis fungoides ve Sezary sendromu tanısı alan hastalarda HLA tip tayini
Determination type of HLA in patients diagnosis with mycosis fungoides and Sezary syndrome
ALİ RIZA BAŞARAN FENJANCHİ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2015
Dermatolojiİstanbul ÜniversitesiDeri ve Zührevi Hast. Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SERVER SERDAROĞLU
- Targeting bag-1S/C-raf interaction for therapeutic intervention in cancer
Bag-1S/C-raf etkileşiminin kanserde terapötik bir yaklaşım olarak kullanılmak üzere hedeflenmesi
ÖZGE TATLI
Doktora
İngilizce
2022
Biyoteknolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. GİZEM DİNLER DOĞANAY
- Over kanser tedavisinde reseptör hedefli in siliko ligand tasarımının in vitro incelenmesi
In vitro investigation of receptor targeted in silico ligand design in ovarian cancer therapy
HİLAL ŞENTÜRK
Doktora
Türkçe
2024
BiyoteknolojiBezm-i Alem Vakıf ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FAHRİ AKBAŞ
- Tümörde jelatinaz aktivitesinin görüntülenmesi için 99mTc ile işaretli jelatinaz inhibitör peptidin radyofarmasötik potansiyelinin incelenmesi
Investigation of radiopharmaceutical potential of radiolabeled gelatinase inhibitor peptide 99mTc for the imaging of gelatinase activity in tumors
BURCU ALTIPARMAK