Bazı elemet ve organik moleküllerin X-ışınları kırınımı yöntemiyle tek kristal yapı analizi ve Hirshfeld yüzey analizi
Single crystal structure analysis and Hirshfeld surface analysis of some element and organic molecules by X-ray diffraction
- Tez No: 534074
- Danışmanlar: PROF. DR. ERTAN ŞAHİN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Kimya, Chemistry
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2019
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Atatürk Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Kriminalistik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 188
Özet
Bu çalışmada yedi adet element ve organik molekülden oluşan kristal yapı incelenmiştir. Bu organik moleküllerin Kristalografik ve moleküler yapısı X-ışınları tek kristal kırınım yöntemiyle belirlenmiştir. Yapısı çözülen kristallerin x-ışını kırınım verileri Rigaku R-axis rapid-S difraktometresi ile elde edilmiş, yapı faktörü verileri analiz edilerek, moleküllerin geometrik ve termal parametreleri ile molekül içi ve moleküller arası etkileşimler belirlenmiştir. DL-4,5-Dibromo-4,5-Dideoksi-3,6-0-Metil-chiro-inositol (C12H18Br2O6) bileşiği monoklinik P21/c uzay grubunda çözülmüş ve birim hücre parametreleri a=6.819(4)Å, b=13.207(8)Å, c=18.275(12)Å ve α=γ=90° ve β=93.590°(19), Siklooktasülfür (α-Ortorombik Sülfür) (S8) elementi ortorombik Fddd uzay grubunda çözülmüş ve birim hücre değişkenleri a=10.4645(9)Å, b=12.8664(9)Å, c=24.496(2)Å ve α=β=γ=90°,1-(2-Etoksi-2-metil-2H-kromen-3-il)-etanon (C28H32O6) bileşiği monoklinik C2/c uzay grubunda çözülmüş ve birim hücre parametreleri a=20.1989(17)Å, b=7.3837(6)Å, c=18.8593(17)Å ve α=γ=90° ve β=120.887°(3), [(E-4 -{[2- (4-hidroksibenzoil) hidrazin-1-il-iden]metil}Piridin-1-ium nitrat (C20H20N4O5) bileşiği monoklinik P21/n uzay grubunda çözülmüş birim hücre parametreleri a=8.335(3)Å, b=13.929(5)Å, c=12.184(4)Å ve α=γ=90° ve β=95.902°(10),3-Hiroksi-2-fenil-2,3,3a,4,7,7a-hekzahidro-1H-izoindol-1-on (C14H15NO2) kristali P-1 triklinik uzay grubunda çözülmüş birim hücre parametreleri a=6.5380(2)Å, b=7.2161(2)Å, c=12.8184(4)Å ve α=95.944°(2), β=99.4460°(10) ve γ=101.4860°(10),6-bromo-3-(4-metoksifenil)-3a,4,7a-tetrahidro-4,7-methanobenzo[d]izoksazol (C15H14BrNO2) bileşiği P21/c monoklinik uzay grubunda çözülmüş ve birim hücre parametreleri ise a=20.490(4)Å, b=6.8976(15)Å, c=9.7335(15)Å ve α=γ=90° ve β=102.532°(9) ve son olarak N-((3-amino-1,4-diokso-1,2,3,4-tetrahidro naftalen-2-il) karbomotioil)-2,6-diflorobenzamid (C18H11F2N3O3S) kristali P21/n monoklinik uzay grubunda çözülmüş ve birim hücre parametreleri ise a=6.2281(7) Å, b=13.7328(17)Å, c=19.485(3)Å ve α=γ=90° ve β=96.771°(5) olarak belirlenmiştir. Kristallere ait tek kristal kırınım verileri Olex2-2017 paket programı ile analiz edilmiş ve yapıların grafik sunumları için Mercury 3.1 programı kullanılmıştır. Crystal Explorer programı yardımıyla tüm yapıların Hirshfeld yüzeyi belirlenerek kristal örgü incelenmiş, molekül içi ve moleküler arası etkileşimler görüntülenerek parmak izi haritaları elde edilmiştir. Anahtar Kelimeler; X-ışınları kırınımı, Hirshfeld yüzey analizi, Olex2, Moleküler modelleme, Parmak izi haritası.
Özet (Çeviri)
In this study, crystal structure consisting of seven elements and organic molecules were investigated. Crystallographic and molecular structure of these organic molecules were determined by X-ray single crystal diffraction method. X-ray diffraction data of the crystals dissolving obtained by Rigaku R-axis rapid-S diffractometer, by analyzing structure factor data, the intermolecular and intermolecular interactions between the geometric and thermal parameters of the molecules were determined. The compound DL-4,5-dibromo-4,5-dideoxy-3,6-o-methyl-chiro-inositol (C12H18Br2O6) was dissolved in the monoclinic P21/c space group and the unit cell parameters a=6.819(4)Å,b=13.207(8)Å, c=18.275(12)Å ve α=γ=90° ve β=93.590°(19), Cycloctasulfide (α-Orthorombic Sulfide) (S8) compound dissolved in the orthorhombic Fddd space group, unit cell parameters a=10.4645(9)Å, b=12.8664(9)Å,c=24.496(2)Å ve α=β=γ=90°,1-(2-Ethoxy-2-methyl-2H-chromen-3-yl)-ethanone(C28H32O6) compound dissolved in the monoclinic C2/c space group and the unit cell parameters a=20.1989(17)Å, b=7.3837(6)Å,c=18.8593(17)Å ve α=γ=90° ve β=120.887°(3),[(E)-4-{[2-(4-hydroxybenzoyl) hydrazin-1-yl-yl-idene] methyl}Pyridin-1-yl nitrate (C20H20N4O5) compound dissolved in a monoclinic P21/n space group unit cell parameters a=8.335(3)Å, b=13.929(5)Å, c=12.184(4)Å ve α=γ=90° ve β=95.902°(10),3-Hidroxy-2-phenyl-2,3,3a, 4,7,7a-hexahydro-1H-isoindol-1-one (C14H15NO2) crystal dissolved in P-1 triclinic space group, unit cell parameters a=6.5380(2)Å, b=7.2161(2)Å, c=12.8184(4)Å ve α=95.944°(2), β=99.4460°(10) ve γ=101.4860°(10),6-bromo-3-(4-methoxyphenyl)-3a,4,7a-tetrahydro-4,7 methanobenzo [d] isoxazole (C15H14BrNO2) is dissolved in the P21/c monoclinic space group and the unit cell parameters a=20.490(4)Å, b=6.8976(15)Å, c=9.7335(15)Å ve α=γ=90° ve β=102.532°(9)and finally N-((3-amino-1,4-dioxo-1,2,3,4-tetrahydro-naphthalen-2-yl)carbamoyl)-2,6-difluorobenzamide (C18H11F2N3O3S) crystal in the P21/n monoclinic space group dissolved and unit cell parameters were determined as a=6.2281(7) Å, b=13.7328(17)Å, c=19.485(3)Å ve α=γ=90° ve β=96.771°(5). The single crystal diffraction data of the crystals were analyzed by the Olex2-2017 package program and the Mercury 3.1 program was used for the graphical presentation of the structures. With the help of the Crystal Explorer program, the Hirshfeld surface of all structures was determined, and the crystal lattice was examined. Keywords; X-ray diffraction, Hirshfeld surface analysis, Olex2, Molecular modeling, Fingerprint map.
Benzer Tezler
- Synthesis, development and characterization of some W-based compounds, composites and hybrid materials
Volfram esaslı bileşiklerin, kompozitlerin ve de hibrid malzemelerin üretimi, geliştirilmesi ve karakterizasyonu
SELİM COŞKUN
Doktora
İngilizce
2011
Bilim ve Teknolojiİstanbul Teknik Üniversitesiİleri Teknolojiler Ana Bilim Dalı
PROF. DR. M. LÜTFİ ÖVEÇOĞLU
- Crystal structure prediction and ammonia dynamics in strontium ammine complex
Stronsiyum amin kompleksinin kristal yapı tahmini ve amonyak dinamiğinin analizi
MEHMET ÇANKAYA
Yüksek Lisans
İngilizce
2016
Enerjiİstanbul Teknik ÜniversitesiEnerji Bilim ve Teknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ADEM TEKİN
- Silikon nano parçacıkların alınması ve özellikleri
Кремийдин нанобөлүкчөлөрүн алуу жана алардын касиеттери
ALTINAY ABDİRASHİT KIZI
Yüksek Lisans
Kırgızca
2022
Kimya MühendisliğiKırgızistan-Türkiye Manas ÜniversitesiKimya Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. EMİL OMURZAK UULU
- Hedef kimyasala duyarlı floresan malzemelerin sentezi ve kimyasal sensörlerde kullanımı
Synthesis of fluorescent materials sensitive to target chemicals and usage in chemical sensors
FEHMİ KARAGÖZ
- OLED uygulamaları için ditiyeno[3,2-b;2′,3'-d]tiyofen (DTT) temelli moleküllerin sentezleri ve özellikleri
Synthesis and properties of dithieno[3,2-b;2′,3'-d]thiophene (DTT) based molecules for OLED applications
CANAN ŞAHİN
