Trakya'da yayılış gösteren bazı Vicia L. (Fabaceae) taksonlarının morfolojik özellikleri ve DNA sekans yöntemiyle moleküler filogenetik özelliklerinin belirlenmesi
Determination of morphological and molecular phylogenetic properties of some Vicia L. (Fabaceae) taxa growing in european Turkey using DNA sequencing
- Tez No: 535491
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ NECMETTİN GÜLER
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Botanik, Botany
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2018
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Trakya Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Botanik Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 145
Özet
Bu çalışmada Fabaceae familyasının Vicia cinsine ait 13 taksonun (V. articulata, V. cracca subsp. cracca, V. cracca subsp. gerardii, V. cracca subsp. stenophylla, V. crocea, V. hirsuta, V. meyeri, V. parviflora, V. sibthorpii, V. tetrasperma ve V. villosa subsp. dasycarpa, V. villosa subsp. eriocarpa ve V. villosa subsp. villosa) moleküler filogenetik özellikleri sahip oldukları genomik DNA'larının ITS bölgeleri sekanslanarak ortaya konulmuştur. Morfolojik çalışmalarda EDTU, İSTE ve İSTO herbaryumlarında bulunan örnekler ve 2014-2016 yıllarında yapılan arazi çalışmalarında toplanan örnekler kullanılmıştır. Türlerin monografları hazırlanarak morfolojik özellikleri, dağılışları, çiçeklenme zamanı ve bölgedeki, Türkiye'deki ve Dünyadaki yayılışları verilmiştir. Moleküler çalışmalarda araziden toplanan canlı bitki örneklerinin yapraklarından genomik DNA'ları izole edilmiş ve ITS bölgeleri önceden hazırlanmış primerler kullanılarak çoğaltılmıştır. Elde edilen DNA bölgelerin sekanslaması yapılarak, abi formatında alınan veriler, biyoinformatik ve filogenetik programlarla değerlendirilmiştir. CLUSTALW2 yazılımı kullanılarak üzerinde çalışılan bitkilerin diğer Vicia türleri ile olan hizalamaları tespit edilirken, MEGA 7,0 (STABLE) ve PAUP 4.0 yazılımları ile Neighbour Joining, UPGMA ve Maximum likelihood metoduyla da filogenetik ağaçları oluşturulmuştur. Hizalama sonucu oluşan distans matrix çizelgesi ve filogenetik ağaç oluşturma işlemi sonucu elde edilen veriler klasik taksonomi verileri ile karşılaştırılmıştır.
Özet (Çeviri)
In this study, systematic and phylogenetic properties of 13 taxa (V. articulata, V. cracca subsp. cracca, V. cracca subsp. gerardii, V. cracca subsp. stenophylla, V. crocea, V. hirsuta, V. meyeri, V. parviflora, V. sibthorpii, V. tetrasperma and V. villosa subsp. dasycarpa, V. villosa subsp. eriocarpa and V. villosa subsp. villosa) of the genus Vicia from the Fabaceae family were determined by morphological investigations and sequencing ITS regions of their genomic DNA. In the morphological studies, specimens collected from the study area during field studies between 2014-2016 and specimens already deposited in herbaria in EDTU, ISTE and ISTO were used. The monographs were prepared and morphological characteristics, flowering times and distributions of the studied species in the region, Turkey and the world were given. Genomic DNAs were isolated from basal leaf cells of fresh plant samples collected from the field and the ITS regions were amplified by previously prepared primers. The data obtained in the abi format by sequencing of the amplified DNA regions were evaluated by applying bioinfomations and phylogenetics programs. CLUSTALW2 program was used to determine the leveling of the species in question within the other Vicia species. The phylogenetic trees were built by using the Neighbour Joining, UPGMA ve Maximum likelihood methods of MEGA 4,0 (STABLE) and PAUP 4.0 programs. The data obtained from the distance matrix table and phylogenetic trees were compared with the classical taxonomical data.
Benzer Tezler
- Trakya'da yayılış gösteren bazı Trifolium L. Sect. Chronomesium (Fabaceae) taksonlarının morfolojik özellikleri ve DNA sekans yöntemiyle moleküler filogenetik özelliklerinin belirlenmesi
Determination of morphological and molecular phylogenetic properties of some Trifolium L. Sect. Chronosemium (Fabaceae) taxa growing European Turkey using the technique of DNA sequencing
ASLIHAN BALKAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
BotanikTrakya ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ NECMETTİN GÜLER
- Türkiye'de yayılış gösteren glis glis (Lınnaeus, 1766) (mammalia:rodentia) populasyonlarının morfolojik ve filogenetik analizi
Morphologic and phylogenetic analysis of Glis glis (Linnaeus, 1766)(mammalia: rodentia) populations distributed in Turkey
SİBEL EYLEM EROĞLU
- Leucojum aestivum L.'den tirozin dekarboksilaz (TYDC) geninin izolasyonu ve klonlanması
Isolation and cloning of the tyrosine decarboxylase (TYDC) gene from Leucojum aestivum L.
ÖZLEM BALTA
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
BiyoteknolojiTrakya ÜniversitesiBiyoteknoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SEMRA HASANÇEBİ
DR. ÖĞR. ÜYESİ EMEL ORDU
- Anadolu karaçamı (Pinus nigra Arn.ssp.pallasiana Lamb.Holmboe)nın coğrafik varyasyonları
Variabilite geographique de Pinus nigra Arn.ssp.pallasiana Lamb. Holmboe
C. ÜNAL ALPTEKİN
Doktora
Türkçe
1986
Ormancılık ve Orman Mühendisliğiİstanbul ÜniversitesiSilvikültür Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SUAD ÜRGENÇ
- İnfeksiyöz Bronşitis Virusu (IBV)'nun üç patogen suşu ile infekte edilen civcivlerdeki nefrolojik bulguların histopatolojik karşılaştırılması
Histopathological comparison of chicks infected with three pathogenic strains of infectious bronchitis virus (IBV)
İBRAHİM FIRAT
Doktora
Türkçe
1995
Veteriner Hekimliğiİstanbul ÜniversitesiPatoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
PROF.DR. TAHSİN YEŞİLDERE