Ülkemiz kayısı genetik kaynaklarında bazı agronomik özellikler ile DNA markörleri arasındaki ilişkilerin ilişki haritalama (association mapping) ile saptanması ve biyoçeşitliliğin moleküler düzeyde belirlenmesi
Identification of DNA markers associated with some agronomically important characters through association mapping and determination of biodiversity in molecular level in Turkey's apricot gerplasm
- Tez No: 537119
- Danışmanlar: PROF. DR. MUHAMMED BAHATTİN TANYOLAÇ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyomühendislik, Biyoteknoloji, Genetik, Bioengineering, Biotechnology, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2019
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ege Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyomühendislik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 56
Özet
İlişki haritalama (Association Mapping) isimli yöntem, farklı lokuslardaki allellerin bağlantı dengesizliğine (LD, Linkage disequilibrium) dayanan kantitatif özelliklerin haritalanması ve bu kantitatif özellikler ile markörler arasındaki ilişkinin belirlenmesi için geliştirilen güçlü ve etkili bir yöntemdir. Bu çalışmada Türkiye'nin ve dünyanın farklı yerlerinden elde edilmiş 259 kayısı genotipi kullanılarak (GBS) analizleri gerçekleştirilmiş ve analizler sonucunda 20.264 yüksek kalitede SNP markörü tespit edilmiştir. STRUCTURE programında, bu markörler kullanılarak popülasyon yapısı analiz edilmiş ve popülasyonun 3 (ΔK=3) alt gruba ayrıldığı belirlenmiştir. Saptanan SNP markörleri ile kayısı meyvelerinde meyve ağırlığı, meyve eti sertliği ve meyve eti rengine ait pomolojik veriler ile TASSEL (Trait Analysis by Association, Evoluation and Linkage) programı aracılığıyla MLM(Q+K) analizleri gerçekleştirilmiş ve bu 3 pomolojik özellik ile istatistiksel olarak yüksek ilişkili 4 SNP tanımlanmıştır. Bu çalışma kayısı meyvelerinde meyve ağırlığı, meyve eti sertliği ve meyve eti rengi özellikleri ile yapılan ilk ilişki haritalama çalışmasıdır ve gelecekteki ilişki haritalama, marker destekli seleksiyon ve ıslah çalışmalarına yardımcı olacaktır.
Özet (Çeviri)
Association Mapping is a powerful method which is based on linkage disequilibrium (LD) for determination of the correlations between phenotypes and genotypes. In this study, 259 apricot cultivars were genotyped with genotyping by sequencing (GBS). A total of 20.264 high quality SNP markers which were obtained from GBS analysis were used in STRUCTURE software to determine the subpopulatin number. After this analysis subpopulation number was determined as 3 (ΔK=3). GWAS were performed for fruit weight, fruit flesh color and fruit firmness according to MLM (Q+K) approach in Trait Analysis by Association, Evoluation and Linkage (TASSEL). After these analyses 4 SNP markers were identified which were significantly associated with these pomological traits. This is the first association mapping study with apricot for fruit weight, fruit flesh color and fruit firmness pomological traits. This study shows that association mapping is a powerful method and these markers can be used in marker assisted selection in apricot breeding studies.
Benzer Tezler
- Erzincan ovasında doğal olarak bulunan erik x kayısı melezlerinin morfolojik, biyokimyasal ve moleküler yöntemlerle karakterizasyonu
Characterization of the natural plum x apricot hybrid in the Erzincan lowland by morphological, biochemical and molecular methods
ÖZLEM ÇAKIR
- Türk sanatında melek tasvirleri (sanat eğitiminde bir uygulama modeli)
Başlık çevirisi yok
P. SEMA KEDİCİ
Yüksek Lisans
Türkçe
2000
Eğitim ve ÖğretimGazi ÜniversitesiResim-İş Eğitimi Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. SEMA BİLİCİ
- Iğdır Üniversitesi Tarımsal Araştırma ve Uygulama Merkezi'nde bulunan farklı kayısı çeşitlerinin genetik ilişkilerinin moleküker markırlarla belirlenmesi
Determination of genetic relationships of different apricot varieties with molecular markers at Iğdır University Agricultural Research and Application Center
SERKAN TOPAL
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
BiyomühendislikIğdır ÜniversitesiBiyomühendislik ve Bilimleri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET HAKKI ALMA
DR. ÖĞR. ÜYESİ ADNAN AYDIN
- Hacıhaliloğlu kayısı (Prunus armeniaca) çeşidinde transkriptom analizi
Transcriptome analysis of apricot (Prunus armeniaca) varriety 'Hacıhaliloğlu'
ONUR CANBULAT
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
ZiraatErciyes ÜniversitesiTarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. KAHRAMAN GÜRCAN
- Nevşehir ve Niğde yöresinde kurutmalık ve sofralık kayısı seleksiyonu ve seçilen genotiplerin moleküler karakterizasyonu
Selection studies on dry and table apricots in Nevşehir and Nigde provinces and characterization moleculer of them markers
VEYİS YURTKULU
Doktora
Türkçe
2016
Mühendislik BilimleriÇukurova ÜniversitesiBahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ALİ KÜDEN