Geri Dön

Meyerozyma guilliermondii' de pulse field jel elektroforezi-genomik DNA'nın restriksiyon enzim analizi için uygun enzimin belirlenmesi

Determination of suitable enzyme for pulse field gel electrophoresis-restriction enyzme analysis of genomic dna in the meyerozyma guilliermondii

  1. Tez No: 546670
  2. Yazar: SALİHA KESTİ
  3. Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ NEJLA CEBECİ GÜLER
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Meyerozyma guilliermondii, Pulse Field Jel Elektroforezi, Restriksiyon Enzimi, Meyerozyma guilliermondii, Pulse Field Gel Electrophoresis, Restriction Enzyme
  7. Yıl: 2019
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Giresun Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 67

Özet

Amaç: Meyerozyma guilliermondii, fırsatçı insan patojeni olarak kan dolaşımı enfeksiyonu (kandidemi) gibi ciddi enfeksiyonların etkeni bir maya türüdür. Bu çalışmada, M. guilliermondii suşlarının moleküler epidemiyolojik analizlerinde kullanılabilecek Pulse Field Jel Elektroforezi-Genomik DNA'nın Restriksiyon Enzim Analizi (PFGE-REAG) yöntemi için uygun restriksiyon enziminin belirlenmesi amaçlandı. Gereç ve Yöntem: Bu çalışmaya, Karadeniz Teknik Üniversitesi Farabi Tıp Fakültesi Hastanesi Tıbbi Mikrobiyoloji Laboratuvarında izole edilen, 9 hastanın epidemiyolojik olarak ilişkili 12 M. guilliermondii suşu dahil edildi. PFGE-REAG yöntemi, CHEF DR III (BioRad, ABD) cihaz sistemi kullanılarak SfiI, NotI ve PacI restriksiyon endonükleaz enzimleri ile çalışıldı. Bulgular: SfiI ile kesim reaksiyonu sonucunda, moleküler büyüklük marker'ı aralığına dağılmış ve daha net ayırt edilebilen bantlar izlendi. SfiI ve NotI bant profilleri, karyotipleme bant profilleriyle karşılaştırıldığında; REAG protokolünün karyotiplemeden daha ayırt edici olduğu sonucuna varıldı. Sonuç: REAG-SfiI, epidemiyolojik olarak ilişkili M. guilliermondii suşlarının klonal ilişkisini belirlemede kullanılabilir. Bu çalışmayla, epidemiyolojik olarak ilişkili M. guilliermondii klinik izolatlarının klonal ilişkisinin değerlendirilmesine yardımcı olacak REAG metodunun belirlenmesine katkı sağlandı.

Özet (Çeviri)

Objective: Meyerozyma guilliermondii is a species of yeast that causes serious infections such as bloodstream infection (candidaemia) as an opportunistic human pathogen. In this study, it was aimed to determine the appropriate restriction enzyme for Pulse Field Gel Electrophoresis- Restriction Enzyme Analysis of Genomic DNA (PFGE-REAG) method which can be used in molecular epidemiological analysis of M. guilliermondii strains. Materials and Methods: In this study, epidemiologically related 12 M. guilliermondii strains of 9 patients isolated in the Medical Microbiology Laboratory of the Medical School Hospital of the Karadeniz Technical University were included. PFGE-REAG method was studied by using CHEF DR III (BioRad, USA) device system with SfiI, NotI and PacI restriction endonuclease enzymes. Results: As a result of restriction reaction with SfiI, bands that were scattered across the range of molecular size markers and were more clearly distinguishable were observed. SfiI and NotI band profiles were compared with the karyotyping band profiles; It was concluded that the REAG protocol was more distinctive than the karyotyping. Conclusion: REAG-SfiI can be used to determine the clonal relationship of epidemiologically related M. guilliermondii strains. This study contributed to the determination of the REAG method which will help to evaluate the clonal relatedness of epidemiologically related M. guilliermondii clinical isolates.

Benzer Tezler

  1. Biocontrol of fungal pathogens responsible for postharvest diseases in apple and lemon using antagonistic yeasts

    Elma ve limonda bozulma etmeni olan fungal patojenlerinantagonistik mayalar ile biyokontrolü

    BİLAL AĞIRMAN

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2021

    Gıda MühendisliğiÇukurova Üniversitesi

    Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HÜSEYİN ERTEN

  2. Probiyotik özellik gösteren bazı maya suşları ve laktik asit bakterilerinin etkileşimlerinin araştırılması

    Investigation of the interaction between probiotic yeasts and lactic acid bacteria

    HATİCE YILDIRAN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    Gıda MühendisliğiSüleyman Demirel Üniversitesi

    Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AYNUR GÜL KARAHAN

    DOÇ. DR. GÜLDEN BAŞYİĞİT KILIÇ

  3. Biological control of Aspergillus flavus growth and its aflatoxin b1 production by antagonistic yeasts

    Antagonistik mayalar ile Aspergillus flavus gelişimi ve aflatoksin b1 üretiminin biyolojik kontrolü

    DİLARA NUR DİKMETAŞ

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2022

    Gıda Mühendisliğiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. HATİCE FUNDA KARBANCIOĞLU GÜLER

    DR. HAYRETTİN ÖZER

  4. Bioprospection of antagonistic yeasts for biocontrolling postharvest pathogenic fungi and physicochemical characterization of a yeast exopolysaccharide

    Patojenik küflerin hasat sonrasi biyolojik kontrolünde antagonistik mayalarin biyoprospeksiyonu ve bir maya ekzopolisakkaritinin fizikokimyasal karakterizasyonu

    SEBAHAT ÖZTEKİN

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2023

    Gıda Mühendisliğiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. HATİCE FUNDA KARBANCIOĞLU GÜLER

  5. Albicans dışı candida türlerinin isimlendirilmesinde iki farklı MALDI-TOF MS yönteminin karşılaştırılması

    Comparative evaluation of the maldi biotyper and vitek MS matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight (MALDI-TOF) mass spectrometry systems for identification of non-albicans candida

    LEYLA TEKE

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    MikrobiyolojiSağlık Bilimleri Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. BANU BAYRAKTAR