Hepatit olgusunda (HBX) NF-kB ve AHR etkileşimleri ilişkisinin araştırılması
Investigation of NF-kB and AHR gene interaction in relation to the development of hepatitis
- Tez No: 548118
- Danışmanlar: PROF. DR. ALAATTİN ŞEN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2018
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Pamukkale Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 89
Özet
daPrimer karaciğer kanserlerinin %85-90'ını oluşturan Hepatosellüler Karsinom (HCC) dünyada en sık rastlanan kanserlerden olup, risk faktörleri olarak en başta kronik hepatit B (HBV) ve hepatit C virüs (HCV) enfeksiyonlarıdır. Bu çalışmada, Hepatit B X (HBX) olgusunda, Aril Hidrokarbon Reseptörü (AHR) ve Nüklear Faktör kappa B (NF-κB) genlerinin Hepatit B virüsü ile enfekte edilen insan hepatosellüler karsinom hücre hattında (HepG2-HBV (HBX) ) protein-protein etkileşim potansiyelinin moleküler yaklaşımlar ile aydınlatılması amaçlanmışdı. Bu amaçla etki mekanizma çalışmaları HepG2-HBV (HBX) hücre hattında gerçekleştirildi. Total RNA, HBX pozitif hücrelerden izole edildi. Daha sonra cDNA, oligo-dT primerler kullanılarak toplam RNA'dan ters transkriptaz ile sentezlendi. NF-κBve AHR genleri gen spesifik primerler kullanılarak Polimeraz zincir reaksiyonu(PZR) ile amplifiye edildi ve DNA ürünleri“pGEM-T easy vector”ile klonlandı. Klonlanan NF-κB ve AHR plazmidleri DH-5a 'ya transforme edildi ve daha sonra saf plazmidler izole edildi.Plazmit NF-κBve AHR genlerinin PZR ürünleri, spesifik restriksiyon enzimleri ile kesildi ve“Flexi Vector System”kullanılarak alıcı plazmitlerin uygun bölgesine klonlandı.Rekombinant plazmitler daha sonra lusiferaz plazmid ile birlikte HBX hücre hattına transfekte edildi. Uygun inkübasyon süresinin sonunda, Renilla geni içeren pGL4.31[luc2P/Gal4UAS/Hygro] pGL4.31 plazmiti transfekte edilen hücrelere eklendi. 'Firefly lusiferaz' aktivitesi ölçüldü. Yapılan çalışmalar sonucundaNF-κBve AHR genlerinin hepatit B olgusunda etkileşime girdiğini kuvvetle desteklemektedir. Hepatokarsinogenez oluşumunda bu iki transkripsiyon faktörünün etkilişim halinde olup, ekspresyon artışına sebep olmaktadır. Bu etkileşimin nasıl durduralacağı konusunda yapılacak çalışmalarla desteklenirse HBX varlığında oluşan hepatokarsinogenezin önüne geçilerek yeni tedavi yöntemleri ortaya çıkartılabilir. Bu veriler literatürde yenidir.
Özet (Çeviri)
Hepatocellular carcinoma (HCC), which constitutes 85-90% of primary liver cancers, is one of the most common cancers in the world, and is the most common risk factors for chronic hepatitis B (HBV) and hepatitis C virus (HCV) infections. In this study, protein-protein interaction in human hepatocellular carcinoma cell line (HepG2-HBV (HBX)) infected with Hepatitis B virus of Aryl Hydrocarbon Receptor (AHR) and Nuclear Factor kappa B (NF-κB) genes in Hepatitis BX (HBX) case The aim of this study was to elucidate its potential with molecular approaches. For this purpose, mechanism studies were performed in HepG2-HBV (HBX) cell line. Total RNA was isolated from HBX-positive cells. The cDNA was then synthesized by reverse transcriptase from total RNA using oligo-dT primers. NF-κBand AHR genes were amplified by Polymerase chain reaction (PCR) using gene-specific primers and the DNA products were cloned with“pGEM-T easy vector”. The cloned NF-κBand AHR plasmids were transformed into DH-5α and then pure plasmids were isolated. The PCR products of plasmid NF-κB and AHR genes were cut with specific restriction enzymes and cloned into the appropriate site of the recipient plasmids using the“Flexi Vector System”. Recombinant plasmids were then transfected into the HBX cell line with the luciferase plasmid. At the end of the appropriate incubation period, the plasmid pGL4.31 [luc2P / Gal4UAS / Hygro] pGL4.31 containing the Renilla gene was added to the transfected cells. Dü Firefly luciferase l activity was measured. As a result of the studies, it strongly supports that NF-κBand AHR genes interact in the hepatitis B case. In the formation of hepatocarcinogenesis, these two transcription factors are affected and cause an increase in expression. If these studies are supported by the studies on how to stop it, new treatment methods can be created by preventing hepatocarcinogenesis in the presence of HBX. These data are new in the literature.
Benzer Tezler
- Hepatit B virus X genindeki hepatosellüler karsinoma ile muhtemel ilişkisi olan mutasyonların retrospektif olarak araştırılması
Retrospective analysis of Hepatit B Virus X gene mutations potentially related with hepatocellular carcinoma
ENGİN KAPLAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2010
MikrobiyolojiMersin ÜniversitesiFarmasötik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MEHMET SAMİ SERİN
- Viral hepatit ve karaciğer sirozlu olgularda eritrosit fosfolipid değişimleri
Başlık çevirisi yok
SEMRA ARIKAN
- Non A-E hepatit olgularında TT virus DNA'sının PCR yöntemi ile saptanması
Başlık çevirisi yok
KORAY ERGÜNAY
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2002
MikrobiyolojiHacettepe ÜniversitesiMikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF.DR. ŞEMSETTİN USTAÇELEBİ
- Hepatit B virusuna bağlı olarak gelişen karaciğer sirozu ve hepatosellüler kanser patogenezinde p53 ve BCL-2 onkogenlerinin önemi
Başlık çevirisi yok
YUSUF KARABULUT
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
1998
OnkolojiUludağ Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ENVER DOLAR
- Hemodiyaliz hastalarında hepatit G virusu (HGV-GBV/C) infeksiyonunun cDNA polimeraz zincir tepkimesi ile gösterilmesi ve HGV genotiplerinin belirlenmesi
Determining the HGV infection in hemodialysis patients with cDNA polymerase chain reaction and evaluating the HGV genotype
TUNCER TOKLU
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2000
MikrobiyolojiDokuz Eylül ÜniversitesiMikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. Y. HAKAN ABACIOĞLU