Gossypium hirsutum format dehidrogenaz enziminin oksidatif stresle mücadeledeki rolünün araştırılması
Investigation of the role of Gossypium hirsutum format dehydrogenase enzyme in combating oxidative stress
- Tez No: 548961
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ EMEL ORDU
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biyoteknoloji, Genetik, Biology, Biotechnology, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2019
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Yıldız Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 74
Özet
Besin zincirine doğrudan dahil olmayan pamuk (Gossypium hirsutum L.), ağır metalleri besin zincirinden uzaklaştırmak için, kirlenmiş topraklara ekilebilecek ticari bir ürün olarak uygun bir adaydır. Bu nedenle, ağır metal stresini tolere edebilen doğru pamuk genotiplerinin seçebilmesi amacıyla pamuk bitkisinde ağır metal stresine karşı tepki mekanizmalarının çözümlenmesi önem taşımaktadır. Çalışmamızda bakır stresi altında yetiştirilen G. hirsutum genotipi, Erşan-92'nin ağır metal tolerans yanıtında ilk kez NAD+ bağımlı format dehidrojenaz enziminin rolü araştırılmıştır.Bitkinin yaprak ve kök dokularının stres tepkisi, FDH ve SOD (Superoksit dismutaz) enzimlerinin aktivitesinin yanı sıra H2O2 (hidrojen peroksit) ve MDA (malondialdehit) seviyelerinin ölçülmesiyle belirlenmiştir. Erşan-92'nin köklerinde ağır metal stresi ile birlikte, ROS ve lipit peroksidasyon seviyelerinin artmasının yanısıra SOD ve FDH aktivitelerinde de artış tespit edilmiştir. Bu ölçümlerle örtüşen FDH transkript analizi, GhFDH ekspresyonunun Cu stresiyle arttığını göstermektedir. Yapraklarda 50 μM Cu varlığında FDH transkript seviyesi en yüksek seviyeye (17.88 kat artış) ulaştığı görülürken köklerde 100 μM Cu içeren ortamda 15.67 kat arttığı; 50 ve 75 μM Cu varlığındaki FDH transkripsiyon seviyesi kontrol bitkileri ile hemen hemen aynı olduğu belirlenmiştir. Erşan-92'nin köklerindeki artmış FDH ekspresyon seviyesi, kök büyümesindeki gerileme ile paraleldir. Diğer konsantrasyonlarda FDH enzim aktivitesi anlamlı bir farklılık göstermezken kök dokusunda, 100 μM Cu varlığında 6.35 kat daha yüksek ölçülmüştür. Sonuçlar FDH enziminin Erşan-92 genotipinde ağır metal stresine toleransta rol oynadığını ve bugenotipin 100 μM Cu seviyesine kadar mücadele etmeye devam ettiğini göstermektedir.
Özet (Çeviri)
Cotton (Gossypium hirsutum L.), which is not directly involved in the food chain, appears to be a suitable candidate to remove heavy metals from the food chain and as a commercial crop it can be planted on contaminated soils to remove heavy metals from the food chain. Therefore, in order to select the right cotton genotypes that can tolerate heavy metal stress, it is important to analyze the reaction mechanisms against heavy metal stress in the cotton plant. In our study, the role of NAD + dependent formate dehydrogenase enzyme in the heavy metal tolerance response of Ersan-92 which is G. hirsutum genotype grown under copper stress was investigated. The stress response of the leaf and root tissues of the plant was determined by measuring the activity of FDH and SOD (Superoxide dismutase) enzymes as well as H2O2 (hydrogen peroxide) and MDA (malondialdehyde) levels. With the heavy metal stress in the roots of Erşan-92, increased levels of ROS and lipid peroxidation as well as an increase in SOD and FDH activities were determined. The FDH transcript analysis, which coincides with these measurements, indicates that GhFDH expression increases with Cu stress. In the presence of 50 μM Cu in the leaves, the FDH transcript level reached the highest level (17.88 fold increase), while the roots increased 15.67 fold in the medium containing 100 μM Cu; The level of FDH transcription in the presence of 50 and 75 μM Cu was determined to be almost the same as the control plants. The increased level of FDH expression in the roots of Erşan-92 is parallel to the decline in root growth. Although FDH enzyme activity was not significantly different at other concentrations, it was 6.35 times higher in the presence of 100 μM Cu in the root tissue. The results show that FDH enzyme plays a role in the tolerance of heavy metal stress in the Erşan-92 genotype and this genotype continues to fight up to 100 μM Cu.
Benzer Tezler
- Serbest sistein bakiyelerinin gossypium hirsutum format dehidrogenaz stabilitesine etkilerinin araştırılması
Engineering of selected cysteine residues of nad+ dependent formate dehydrogenase to investigate their role in stability
ŞEBNEM PERİHAN GÖK
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
BiyoteknolojiYıldız Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. EMEL ORDU
- Pamuk bitkisinden izole edilen nikotinamid adenin dinükleotid bağımlı format dehidrogenazın stabilitesinin arttırılması
Increasing stability of nicotinamide adenine dinucleotide dependent format dehydrogenase isolated from cotton plant
REYHAN AKKUZU
Yüksek Lisans
Türkçe
2020
BiyolojiYıldız Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ EMEL ORDU
- Gossypium hirsutum format dehidrogenaz enzimi üzerine bölge doygunluk mutasyonu uygulamaları
Site saturation mutagenesis applications on Gossypium hirsutum formate dehydrogenase enzyme
KÜBRA ATİK
Yüksek Lisans
Türkçe
2020
BiyolojiYıldız Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ EMEL ORDU
- Mikrobiyal biyotransformasyon ile 4,5,6,7-tetrahidro-6-fenil-4-oksobenzofuranon türevlerinin sentezi
Synthesis of 4,5,6,7-tetrahydro-6-phenyl-4-oxobenzofuranone derivatives by microbial biotransformation
KÜBRA AVCI
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
Bilim ve TeknolojiYıldız Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ZERRİN ZERENLER ÇALIŞKAN
- Gossypium hirsutum L. ve gossypium barbadense L. türlerinden renkli lifli iki pamuk çeşidinin, morfolojik, fizyolojik ve teknolojik özellikleri ile bu iki türün F1 melez gücü üzerinde bir araştırma
A Research on morphological, physiological and technological protepties of two coloured cotton varieties of g. hirsutum L. and G. barbadense L. and their F1 hybrid vigor
PETEK TOKLU
Yüksek Lisans
Türkçe
1999
ZiraatÇukurova ÜniversitesiTarla Bitkileri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. OKTAY GENÇER