Geri Dön

Rahnella aquatilis'da bulunan dehE geninin domates bitkisine genetik transformasyonu ve moleküler analizi

Genetic transformation to tomato plant and molecular analysis of the dehE gene of Rahnella aquatilis

  1. Tez No: 550527
  2. Yazar: FATEN AL REMI
  3. Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ YILMAZ KAYA
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
  6. Anahtar Kelimeler: Agrobacterium tumefaciensnes, dehE, pCAMBIA1301, herbisit direnci, Agrobacterium tumefaciens, dehE, pCAMBIA1301, herbicide resistance
  7. Yıl: 2019
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Ondokuz Mayıs Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 163

Özet

Domates Türkiye'de ve Dünya'da en çok üretimi yapılan sebzelerden birisidir. Özellikle tarla domates üretimin yoğun yapıldığı alanlarda, domates üretimini sınırlayan yabancı otlar ciddi etmenler arasında bulunmaktadır. Yabancı otlarla modern mücalede yöntemlerinden biri ise transgenik domates üretimidir. Tarımsal biyoteknolojinin gelişimi, domates bitkileri için büyük fırsatlar ortaya koymuştur. Küresel boyutta ticareti yapılan ilk bitki Flavr Savr adını alan domates olup 1994/1996 yıllarında marketlerdeki yerini almıştır ancak beklentileri karşılayamadığından üretimi durdurulmuştur. Bu tez projesi kapsamında bakla bitkisinin nodüllerinden dalapon herbisitini parçalayan bakteri izole edilmiştir. İzole edilen bakteri üzerinde biyokimyasal ve moleküler analizler yapılarak tanılanmıştır. NCBI veritabanına Rahnella Aquatilis omu001 olarak yüklenmiştir. Dalapon herbisitine dirençlilik sağlayan dehE geni Rahnella Aquatilis omu001 bakterisinden izole edilmiştir. Bakteriyel dehE geninin pCAMBIA1301 vektörüne ligasyonu gerçekleştirilmiştir. Ligasyon ürünü olan ve dehE geni barındıran yeni rekombinant vektöre pCAMdehE ismi verilmiştir. pCAMdehE vektörü Agrobacterium tumefaciens bakterisine aktarılarak domates bitkisine genetik transformasyonu gerçekleştirilmiştir. Elde edilen aday transgenik bitkiler öncelikle higromisin ve dalapon içerikli seçici besi ortamların büyütülmüştür. Daha sonra gDNA izole edilerek dehE geni PCR analizleri yapılarak incelenmiştir. Moleküler analizlerden sonra yaprak boyama testi yapılarak dalapona dirençlilik belirlenmiştir. Elde edilen aday transgenik domateslerin dehE geninin PCR ve dizileme sonuçları literatürle aynı çıkmıştır. Aday transgenik bitkilerin yabani formlarına göre daha dirençli olduğu da yaprak boyama sonuçlarıyla kanıtlanmıştır. Bu çalışma ile bakteriyel dehE genin bitkilerde anlatımın olabileceği ve herbisitlere dayanıklı transgenik bitkilerde kullanılabileceği ispatlanmıştır.

Özet (Çeviri)

Tomato is one of the most frequently produced vegetables in Turkey and the world. Weeds are among the serious factors which limit the production of tomatoes in areas where the tomato production is intense. One of the modern methods of struggle with weeds is transgenic tomato production. The development of agricultural biotechnology revealed great opportunities for tomato plants. The first plant traded globally was tomato named Flavr Savr and it took its place in the markets in 1994/1996 but its production was stopped because it could not meet the expectations. Within the scope of this thesis project, bacteria that break the dalapon herbicide were isolated from the nodules of the pod plant. Biochemical and molecular analyzes were performed on isolated bacteria. The bacteria was loaded on NCBI as Rahnella Aquatilis omu001. The dehE gene which is resistant to dalapon herbicide was isolated from Rahnella Aquatilis omu001 bacteria. The bacterial dehE gene was ligatated into pCAMBIA1301 vector. The ligation of the product and dehE gene harboring the new recombinant vector was named as pCAMdehE. Genetic transformation of tomato plant was performed by transferring of pCAMdehE vector to Agrobacterium tumefaciens bacteria. Obtained candidate transgenic plants were first grown in selective medium containing hygromycin and dalapon. Then, gDNA was isolated and dehE gene was investigated by PCR analyzes. After molecular analysis, the resistance to dalapon was determined by the leaf staining test. The results of the dehE gene PCR and sequencing results from obtainng candidate transgenic tomatoes were the same in literature. Moreover, candidate transgenic plants were proven to be more resistant than their wild forms as a result of leaf staning. This study demonstrates that the bacterial gene can be expressed in plants and can be used in herbicides-resistant transgenic plants.

Benzer Tezler

  1. Doğu Anadolu Bölgesinde bulunan su kaynaklarından soğuğa adapte olmuş bakterilerin izolasyonu, moleküler karakterizasyonu ve enzim üretme potansiyellerinin araştırılması

    Examining the isolation, molecular characterization and research of potentials of enzyme production of cold adapted bacteria from water resources in Eastern Anatolia

    SELMAN MUSLU

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    MikrobiyolojiAtatürk Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AHMET ADIGÜZEL

  2. Sensonsche, mikrobiologiscne, chemische und chemisch-physikalische Untersuchungen zur Haltbarkeit be-und verarbeiteter Sißwasserfische

    Başlık çevirisi yok

    FATMA ARIK

    Doktora

    Almanca

    Almanca

    2000

    BiyolojiLudwig-Maximilians Universität München

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. FRANZ FIEDLER

    PROF. DR. A. STOLLE

    PROF. DR. MATHIAS VON LUKOWICZ

  3. Endofit ve epifit bakterilerin turunçgillerde sorun olan bazı fungal patojenlere karşı in vitro biyokontrol etkinliklerinin belirlenmesi

    Determination of in vitro biocontrol efficiences of endophytic and epiphytic bacteria against some citrus fungal pathogens

    YUSUF GÜMÜŞ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    ZiraatHatay Mustafa Kemal Üniversitesi

    Bitki Koruma Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. EMİNE MİNE SOYLU

  4. Farklı sıcaklık koşullarında depolanan sardalyaların (Sardina pilchardus) mikrobiyal ekolojilerinin belirlenmesi

    Determination of the microbial ecology of sardines (Sardina pilchardus) stored at different temperatures

    FEVZİYE NİHAN BULAT

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    Su ÜrünleriEge Üniversitesi

    Su Ürünleri Avlama ve İşleme Teknolojisi Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. BERNA KILINÇ

  5. Determining the biocontrol potential of bacteria in the cherry fruit fly (Rhagoletis cerasi) microbiome

    Kiraz sineği (Rhagoletis cerasi) mikrobiyomundaki bakterilerin biyolojik kontrol potansiyelinin belirlenmesi.

    SEYITNUR PIRHANOV

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2024

    BiyoteknolojiKaradeniz Teknik Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. REMZİYE NALÇACIOĞLU