Geri Dön

İnvaziv örneklerden izole edilen escherichia coli suşlarının aminoglikozid antibiyotiklere direncinin araştırılması

A research of aminoglycoside resistance on escherichia coli strains isolated from invasive samples

  1. Tez No: 558051
  2. Yazar: İFFET UZUN
  3. Danışmanlar: PROF. DR. NURVER ÜLGER
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Aminoglikozid, aminoglikozid modifiye edici enzimler, Escherichia coli, aminoglikozid direnç mekanizmaları, Aminoglycoside, aminoglycoside modifying enzymes, Escherichia coli, aminoglycoside resistance mechanisms
  7. Yıl: 2019
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Marmara Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 77

Özet

Amaç: Hastanemizde izole edilen invaziv Escherichia coli izolatlarında aminoglikozid direncinden sorumlu mekanizmaları ortaya koymaktır. Gereç ve Yöntem: Marmara Üniversitesi Hastanesi'nde Ocak-Aralık 2016 tarihleri arasında izole edilen 156 invaziv E. coli izolatı çalışmaya alınmıştır. VITEK 2 Compact (bioMérieux, France) ile amikasin ve/veya gentamisine dirençli saptanan 50 izolatta; amikasin, gentamisin, tobramisin, netilmisin, apramisin ve kanamisin minimum inhibitor konsantrasyonları (MİK) standart sıvı mikrodilüsyon yöntemiyle belirlenmiştir. Elli izolatta ayrıca aminoglikozid modifikasyon enzimlerini kodlayan genler (aac(3)-II, aac(3)-I, aac)6')-Ib, ant(2'')-I), PZT yöntemiyle araştırılmıştır. Bulgular ve Sonuçlar: Çalışmamızda, E. coli izolatlarına en etkili aminoglikozidin amikasin olduğu (%94) saptanmıştır. İzolatlarımızın %80'inde (40/50) aac(3)-II, %54'ünde (27/50) aac(6')-Ib ve %4'ünde (2/50) ant(2'')-I genleri tek başına veya birlikte saptanmıştır. aac(6')-Ib ve aac(3)-II birlikteliği izolatların %34'ünde (17/50) bulunmuştur. Direnç fenotipi ile direnç genlerinin varlığı arasında uyum saptanmıştır. Hastanemizde aminoglikozid direncine yol açan temel mekanizma aminoglikozid modifikasyon enzimlerini kodlayan aac(3)-II ve aac(6')-Ib'dir.

Özet (Çeviri)

ABSTRACT Aim: The purpose of this study is to determine aminoglycoside resistance mechanisms in Escherichia coli isolates collected in our University Hospital. Material and Method: A total of 156 invasive E. coli isolates collected in 2016 at Marmara University Hospital were included in the study. Fifty isolates which were found to be resistant to amikacin and/or gentamicin in VITEK 2 Compact (bioMérieux, France) were run to standart broth microdilution test to determine amikacin, netilmicin, gentamicin, tobramycin, kanamycin, apramycin MICs. The four genes (aac(3)-II, aac(3)-I, aac)6')-Ib, ant(2'')-I) encoding common aminoglicoside modifying enzymes were investigated by PCR. Results and Conclusion: Amikacin was the most active aminoglycoside with 94% susceptibility rate in E. coli isolates. aac(3)-II, aac(6')-Ib and ant(2'')-I genes alone or together were determined in 80% (40/50), 54% (27/50), and 4% (2/50) of the isoltes, respectively. In %34 (17/50) of the isoltes, aac(6')-Ib and aac(3)-II genes were found together. A general concordance was found between resistance phenotype and genetic determinants of resistance. Main mechanisms that cause aminoglycoside resistance in our hospital's samples are aac(3)-II and aac(6')-Ib, which encode aminoglycoside modifying enzymes.

Benzer Tezler

  1. Çeşitli antibiyotik kombinasyonlarının acinetobacter suşları üzerine ın vitro etkinliğinin araştırılması

    Investigation of in-vitro effects of various antibiotic combinations against acinetobacter species

    DURSUN MURAT ALADA

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    MikrobiyolojiAtatürk Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ÜLKÜ ALTOPARLAK

  2. İshal yakınmasıyla çocuk kliniğine başvuran hastalarda bakteriyel gastroenterit etkenlerin araştırılması

    The investigation of bacterial gastroenteritis agents in patients who admitted to pediatric clinic with complaints of diarrhea

    MUHAMMET ŞÜKRÜ AĞRALI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    MikrobiyolojiNecmettin Erbakan Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. METİN DOĞAN

  3. Menenjit ve şant infeksiyonlarında anaerobik ve aerobik bakteriyel ajanlar ve antibiyotik duyarlılıkları

    Başlık çevirisi yok

    FERDA AKTAŞ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2004

    MikrobiyolojiAtatürk Üniversitesi

    Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. SELAHATTİN ÇELEBİ

  4. Piperasilin- tazobaktam ve karbapenem kullanımının karbapeneme dirençli enterobacterales ile fekal kolonizasyon gelişmesi üzerindeki etkisinin karşılaştırılması

    Comparison of the effect of carbapenem and piperacillin-tazobactam on the development of fecal colonisation with carbapenem resistant enterobacterales

    TUĞBA PAMUKÇU

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik MikrobiyolojiHacettepe Üniversitesi

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. GÖKHAN METAN

  5. Nozokomiyal gram-negatif çomak bakteriyemisi olan hastalarda mortaliteye etki eden risk faktörleri

    Risk factors for mortality in patients with nosocomial gram-negative rod bacteremia

    ZEHRA ÇAĞLA KARAKOÇ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2007

    Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon Hastalıklarıİstanbul Üniversitesi

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ARİF ATAHAN ÇAĞATAY