Yerfıstığında (Arachis hypogaea L.) mutagen uygulaması ile agro-morfolojik varyasyonun oluşturulması ve Tillıng metodu kullanılarak yağ asidi sentezi ve alerjiniteden sorumlu genlerdeki tek baz değişikliklerinin belirlenmesi
Yerfistiğinda (Arachis hypogaea L.) mutagen uygulamasi ile agro-morfoloji̇k varyasyonun oluşturulmasi ve Tilling metodu kullanilarak yağ asidi sentezi ve alerjiniteden sorumlu genlerdeki tek baz değişikliklerinin belirlenmesi
- Tez No: 562809
- Danışmanlar: DOÇ. DR. ENGİN YOL
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Ziraat, Agriculture
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2019
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Akdeniz Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tarla Bitkileri Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 87
Özet
Yerfıstığı (Arachis hypogaea L.) içerdiği yüksek yağ ve protein oranı ile dünyada kültürü yapılan önemli bir yağlı tohum bitkisidir. Bu çalışmada yerfıstığının tohum kalitesinin artırılması amacıyla TILLING çalışması yürütülmüştür. Genetik kaynak olarak ülkemizde yaygın olarak yetiştirilen NC-7 yerfıstığı çeşidi kullanılmıştır. Varyasyon oluşturma amacıyla bu çeşidin tohumları %0,4 ve %1,2 etil metan sülfanat (EMS) mutageni ile muamele edilmiş ve ardında tohumlar M1 popülasyonu oluşturmak amacıyla tarla şartlarında ekilmiştir. M1 popülasyonundan elde edilen tohumlar M2 popülasyonu için sera şartlarında yetiştirilmiş ve yapraklardan numuneler alınarak DNA izolasyonu yapılmıştır. Çalışmada alerjiniteden sorumlu genler ara h 1.01, ara h 1.02, ara h 2.01, ara h 2.02 ve yağ asit sentezinden sorumlu genler ah FAD2A ve ah FAD2B TILLING metodunda kullanılmak üzere seçilmiştir. Belirlenen gen bölgeleri için geliştirilmiş markerler kullanılarak PCR ile tarama yapılmış ve heterodupleks PCR ile prosedüre devam edilmiştir. Fragment AnalyzerTM cihazında potansiyel mutant genotipler belirlenmiş ve bu genotiplere ait PCR ürünleri doğrulama için sekanslamaya gönderilmiştir. Sekanslama sonuçlarına göre alerjiniteden sorumlu genlerde mutasyon yakalanamamıştır. Ancak yağ asidi sentezinden sorumlu ah FAD2A ve ah FAD2B genlerinde beklenen mutasyonlar yakalanmıştır. %0,4 EMS M2 popülasyonunda ah FAD2A geni için 1 SNP/317 kb, %1,2 EMS M2 popülasyonunda ah FAD2B geni için 1 SNP/466 kb mutasyon frekansı hesaplanmıştır. Böylece yürütülen tez çalışması ile yüksek oleik/linoleik oranına sahip potansiyel genotipler geliştirilmiştir. Bu mutant genetik kaynaklar ileri yerfıstığı ıslah çalışmalarında yüksek oleik asitli çeşitler geliştirmek amacıyla kullanılabilecektir. Ayrıca bu yüksek lisans tezi ile farklı çalışmalarda kullanılmak üzere M2 popülasyonu geliştirilmiştir. Bu çalışma ülkemizde yerfıstığı bitkisi üzerine yürütülen ilk TILLING çalışmasıdır.
Özet (Çeviri)
Peanut or groundnut (Arachis hypogaea L.) includes high oil and protein content and is cultivated worldwide. The present thesis was conducted to improve its seed quality with the TILLING method. The groundnut variety, NC-7, which is widely grown in Turkey was used as a genetic resource. The seeds of this variety were treated with 0.4% and 1.2% ethyl methane sulfanate (EMS) mutagen for variation, and seeds were planted under field conditions to form M1 population. The seeds obtained from the M1 population were grown under greenhouse conditions for M2 population and DNA samples were taken from the leaves. In the study, the genes responsible for allergenicity (ara h 1.01, ara h 1.02, ara h 2.01, ara h 2.02) and fatty acid synthesis genes (ah FAD2A and ah FAD2B) were selected for TILLING method. PCR screening was performed using markers developed for the identified gene regions and procedure was continued with heteroduplex PCR. Potential mutant genotypes were identified on the Fragment AnalyzerTM and PCR products of these genotypes were sequenced for verification. According to the sequencing results, mutation was not detected in the genes responsible for the allergen. However, expected mutations in the ah FAD2A and ah FAD2B genes responsible for fatty acid synthesis were detected. The mutation frequency was estimated 1 SNP / 317 kb for the ah FAD2A gene in the 0.4% EMS M2 population and 1 SNP / 466 kb for the ah FAD2B gene in the 1.2% EMS M2 population. Thus, potential genotypes with high oleic / linoleic ratio were developed by the thesis study. These mutant genetic resources can be used to develop varieties with high oleic acid in advanced groundnut breeding studies. In addition, M2 population has been developed for different researches. This is the first TILLING study on groundut crop in Turkey.
Benzer Tezler
- Yerfıstığında (Arachis hypogaea L.) verim ve verim unsurlarının korelasyon ve path katsayısı analizi üzerinde bir araştırma
An investigation of determination for correlation and path analysis of yield and yield component in peanut (Arachis hypogaea L.)
MELTEM TÜRKERİ
Yüksek Lisans
Türkçe
2006
ZiraatÇukurova ÜniversitesiTarla Bitkileri Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SEZER SİNAN
- Yerfıstığında (Arachis hypogaea L.) yüksek verim ve oleik asit içeriğine sahip hatların seleksiyonu
Selection of lines with high yield and oleic acid content in groundnut (Arachis hypogaea L.)
HASAN TALHA GÜLTEN
- Silikonun kuraklık ve tuz stresi altındaki yerfıstığında (Arachis hypogaea L.) çeşitli antioksidatif sistem bileşenleri ve gen aktiviteleri üzerine etkisi
Effect of silicon on various antioxidative system components and gene activities of peanut (Arachis hypogaea L.) under drougt and salt stress
HANDE NUR KURU
Yüksek Lisans
Türkçe
2014
BiyoteknolojiSüleyman Demirel ÜniversitesiTarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. UFUK ÇELİKKOL AKÇAY
- Farklı dozlarda uygulanan organik gübrelerin yerfıstığında (Arachis hypogaea L.) verim ve verim öğelerine etkisi
Effect of organic fertilizers applied at different doses on yield and yield components in peanut (Arachis hypogaea L.)
HAKAN KARA
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
ZiraatBayburt ÜniversitesiOrganik Tarım İşletmeciliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. VOLKAN GÜL
- Yerfıstığında yeni nesil dizileme verileri kullanarak SSR ve InDel markerlerın geliştirilmesi
Development of SSR and InDel markers with the use of next generation sequencing data in groundnut
MOIN QURESHI