Tokat ili bağ alanlarında Grapevine fanleaf virus ve Grapevine leafroll-associated virus-1,2,3,4,9 virüslerinin varlığının moleküler olarak belirlenmesi
Molecular identification of Grapevine fanleaf Virus and Grapevine leafroll-associated virus-1,2,3,4,9 in vineyards in Tokat province
- Tez No: 570932
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ ŞERİFE TOPKAYA
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Ziraat, Agriculture
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2019
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Tokat Gaziosmanpaşa Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Bitki Koruma Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 69
Özet
2018 yılında Tokat ilinde yapılan bu çalışmada, bağcılığın yoğun olarak yapıldığı Merkez, Erbaa, Niksar ve Pazar ilçelerindeki bazı bağ alanlarından asmaların virüs belirtisi gösteren genç yapraklarından ve bir yaşlı sürgünlerinden örnekler toplanmıştır. Toplanan 197 adet asma örneği Grapevine fanleaf virus (GFLV), Grapevine leafroll-associated virus-1 (GLRaV-1), Grapevine leafroll-associated virus-2 (GLRaV-2), Grapevine leafroll-associated virus-3 (GLRaV-3), Grapevine leafroll-associated virus-4 (GLRaV-4) ve Grapevine leafroll-associated virus-9 (GLRaV-9) virüslerinin varlığını tespit etmek amacıyla, virüslere spesifik primerler kullanılarak moleküler bir yöntem olan RT-PCR testine tabi tutulmuştur. Test edilen 197 adet örneğin 106 (%53.80) tanesinde bir veya birden fazla virüse rastlanmıştır. Toplam 197 bitki örneğinin 103'ü GLRaV-1 (%52.28), 10'u GLRaV-3 (%5.18), 5'i GLRaV-4 (%2.53), 2'si GLRaV-2 (%1.03), 2'si GLRaV-9 (%1.01) ve 2'si GFLV (%1.01) ile enfekteli bulunmuştur. Tokat Merkez ve ilçelerinden toplanan bitki örneklerinde en yaygın görülen virüsün GLRaV-1 olduğu ve bunu GLRaV-3'ün izlediği saptanmıştır. En az saptanan virüsler ise GFLV, GLRaV-2 ve GLRaV-9 olarak tespit edilmiştir. Tespit edilen çoklu enfeksiyonlar içerisinde en fazla GLRaV-1 + GLRaV-3'ün birlikte enfeksiyonu olduğu belirlenmiştir. GLRaV-1 ve GLRaV-3 ile enfekteli izolatların çift yönlü sekans analizleri yapılmış ve MEGA10 bilgisayar programında hizalanmış ve gen bankasına kayıtlı izolatlarla karşılaştırması yapılarak filogenetik ağaç oluşturulmuştur. Filogenetik analiz çalışmalarına göre, GLRaV-1 gen bankasında kayıtlı farklı izolatlarla ve kendi içinde de farklı dallanmalar göstermiştir. GLRaV-3 ile enfekteli ÜÖ3-3 izolatı ise kayıtlı diğer izolatlarla %99-100 oranlarında benzerlik göstermiştir.
Özet (Çeviri)
In this present research, during the 2018 summer season, samples were collected from fresh leaf and a one year old shoots showing virus-like symptoms from vineyards from Centrum, Erbaa, Niksar and Pazar districts of Tokat. Total 197 grapevine samples were tested molecularly and two step polymerase chain reaction (PCR) was performed with virus-specific primers to Grapevine fanleaf virus (GFLV), Grapevine leafroll-associated virus-1 (GLRaV-1), Grapevine leafroll-associated virus-2 (GLRaV-2), Grapevine leafroll-associated virus-3 (GLRaV-3), Grapevine leafroll-associated virus-4 (GLRaV-4) and Grapevine leafroll-associated virus-9 (GLRaV-9). Detection single or dual infections of these viruses have been determined in 106 (53.80%) samples. 103 (52.28%) out of 197 samples, tested resulted in positive with GLRaV-1, 10 out of 197 samples with GLRaV-3 (%5.18), 5 of samples with GLRaV-4 (%2.53), 2 of samples with GLRaV-2 (%1.03), 2 of samples with GLRaV-9 (%1.01) and 2 of samples with GFLV (%1.01). Positive PCR products of GLRaV-1 and GLRaV-3 were sequenced in two directions, aligned with MEGA10 and analysed in BLAST for multiple comparison of other isolates in Genebank. According to phlogenetic analaysis of GLRaV-1 and GLRaV-3 isolates, isolates infected with GLRaV-1 showed 94-96% of identity with others in NCBI Genebank. UO3-3 isolate infected with GLRaV-3 showed 99-100% of identity with those from Genebank
Benzer Tezler
- Çalışanların iç ve dış kontrol odaklarının duygusal zekayla ilişkisi: Kamuda bir alan araştırması.
A research about a relation between interior and exterior locus of control and the emotional intelligence which the workers in an organisation
ZAFER OKTAY
Yüksek Lisans
Türkçe
2013
İşletmeGaziosmanpaşa ÜniversitesiYönetim ve Organizasyon Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. KUBİLAY ÖZYER
- Çalışanların iş tatminini etkileyen faktörlerin belirlenmesi: Eğitim sektörü örneği
Factors affecting the determination of employee job satisfaction: The case of education sector
SONER YILMAZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2013
İşletmeGaziosmanpaşa Üniversitesiİşletme Ana Bilim Dalı
PROF. DR. OSMAN KARKACIER
- Roger Garaudy'de İslam algısı
Roger Garaudy's perception of Islam
NERMİN HANAY
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
DinRecep Tayyip Erdoğan ÜniversitesiFelsefe ve Din Bilimleri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. LATİF TOKAT
- Tokat metamorfik masifi içindeki metagabroyik kayaçların petrolojisi ve jeodinamik ortamı (Amasya, KD Türkiye)
Petrology and geodynamic setting of metagabbroic rocks within Tokat meta-morphic massif (Amasya, NE Turkey)
SABİRE YUVA
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
Jeoloji MühendisliğiKaradeniz Teknik ÜniversitesiJeoloji Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. YENER EYÜBOĞLU
- Türkiye'deki bazı önemli rosa spp. yayılım alanlarında gül gal arıları (Diplolepis spp., Cynipidae, Hymenoptera) ile ilişkili kommünite bileşenlerinin araştırılması
Research on the community components associated with rose gall wasps (Diplolepis spp., Cynipidae, Hymenoptera) in some areas with important rosa spp. distribution in Turkey
ÖZLEM METE
Doktora
Türkçe
2015
BiyolojiHacettepe ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. YUSUF ORHAN MERGEN