Acanthobrama thisbeae'nin filogenetik konumunun moleküler verilerle belirlenmesi
Determination of Acanthobrama thisbeae's phylogenetic status by molecular data
- Tez No: 572252
- Danışmanlar: PROF. DR. AHMET ALP, PROF. DR. EMİN ÖZKÖSE
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Su Ürünleri, Aquatic Products
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2019
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Su Ürünleri Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 60
Özet
Cyprinidea familyasında yeni bir tür olarak keşfedilen Acanthobrama thisbeae'nin üzerine yapılan çalışmalar son yıllarda yoğunlaşmış ve morfolojik tanımlaması yapılan Acanthobrama thisbeae'nın filogenetik konumunun moleküler verilerle belirlenmesi bu tez kapsamında hedeflenmiştir. Bu amaçla Acanthobrama thisbeae kuyruk yüzgeç dokularından DNA izolasyonu yapılmış ve mtDNA gen dizisi üzerine çalışılmıştır. Polimorfizmde hedef gen bölgeleri olarak 16S rDNA, 12S rDNA ve Cythocrome-b (Cyt-b) bölgeleri seçilmiş ve bu bölgeleri hedef alan ileri ve geri primerler tasarlanmıştır. Bu primer setleri kullanılarak belirlenen ilgili bölgeler için PZR yapılmış ve amplifikasyon ile çoğaltılan PZR ürünleri agaroz jel üzerinde Et-Br ile boyanarak UV altında gözlemlenmiştir. Elde edilen PZR ürünlerinin Cyt-b bölgesi için yaklaşık 359 bç, 12S bölgesi için yaklaşık 543 bç ve 16S bölgesi içinde yaklaşık 570 bç uzunluğunda olduğu belirlenmiştir. Her bir bölge için 4 örnek (1, 3, 5, 7 nolu örnekler) seçilerek ilgili bölgelerin dizi analizi gerçekleştirilmiş ve elde edilen bölgeler filogenetik analize tabi tutularak Türkiye'deki A. thisbeae'nın taksonomik pozisyonu hakkında ilk bilgiler ortaya konmuştur.
Özet (Çeviri)
The studies on Acanthobrama thisbeae, which was discovered as a new species in the family Cyprinidea, have been intensified in recent years and the phylogenetic position of Acanthobrama thisbeae, which has been described as morphological, has been targeted within the scope of this thesis. For this purpose (Acanthobrama thisbeae), DNA was isolated from the tail fin tissues and the mtDNA gene sequence was studied. 16S rDNA, 12S rDNA and Cythocrome-b (Cyt-b) regions were selected as target gene regions in the polymorphism and forward and reverse primers targeting these regions were designed. The PCR products which were prepared by using these primer sets and amplified by amplification were stained with Et-Br on agarose gel and plated with UB. was observed under. The obtained PCR products were determined to be about 359 bp for the Cyt-b region, about 543 bp for the 12S region and about 570 bp in the 16S region. To each of 4 samples (samples No. 1, 3, 5, 7) selected and performed, and analysis of the sequences obtained were subjected to phylogenetic analysis are set forth in the first information A. thisbeae taxonomic position in Turkey.
Benzer Tezler
- Determination of some biological characteristic of Acanthobrama thisbeae in Sir reservoir
Sır baraj gölündeki Acanthobrama thisbae'nin bazı biyolojik özelliklerinin belirlenmesi
MEHRABAN JALAL KUKHA ALI
Yüksek Lisans
İngilizce
2015
ZiraatKahramanmaraş Sütçü İmam ÜniversitesiZootekni Ana Bilim Dalı
PROF. DR. EMİN ÖZKÖSE
PROF. DR. AHMET ALP
- Acanthobrama thisbeae Freyhof & Özuluğ, 2014 Azaplı Gölü (Gölbaşı, Adıyaman) populasyonu için bazı populasyon dinamiği parametrelerinin belirlenmesi
Determination of some population dynamical parameters of Acanthobrama thisbeae Freyhof & Özuluğ, 2014 for Azaplı Lake (Gölbaşı, Adıyaman)
NURİYE AHSEN KILIÇ
Yüksek Lisans
Türkçe
2016
Balıkçılık TeknolojisiNevşehir Hacı Bektaş Veli ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ERDOĞAN ÇİÇEK
- Acanthobrama marmid (HECKEL, 1843) populasyonlarında mtDNA genetik varyasyonunun belirlenmesi
Determination of mtDNA genetic variation in Acanthobrama marmid
ARSLAN ALTUNDAĞ
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
GenetikHarran ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ ARİF PARMAKSIZ
- Keban Baraj Gölü'nde yaşayan acanthobrama marmid Heckel, 1843, chondrostoma regium (Heckel, 1843) ve chalcalburnus mossulensis (Heckel, 1843) balıklarında büyüme ve kan hücrelerindeki değişimlerin incelenme
Investigation the growth and changes of in blood cells acanthobrama marmid Heckel, 1843, chondrostoma regium (Heckel, 1843), and chalcalburnus mossulensis (Heckel, 1843) fishes living in Keban dam lake
ASİYE BAŞUSTA (GİRGİN)
Doktora
Türkçe
2000
Su ÜrünleriFırat ÜniversitesiSu Ürünleri Temel Bilimleri Ana Bilim Dalı
DOÇ.DR. DURSUN ŞEN