Geri Dön

Özgün bir ışık kontrollü T7-promotoru-GFP ifade sisteminin geliştirilmesi ve GFP ifadesinin incelenmesi

Development of a novel opto-regulated T7 promoter-GFP expression system and investigation of GFP expression

  1. Tez No: 572358
  2. Yazar: EGE SOYDEMİR
  3. Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ EVREN DORUK ENGİN
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Biyoteknoloji, Biyomühendislik, Microbiology, Biotechnology, Bioengineering
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2019
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Ankara Üniversitesi
  10. Enstitü: Biyoteknoloji Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Mikrobiyal biyoteknolojinin önemli alanlarından biri sentetik biyoloji ve genetik mühendisliği araçları kullanılarak mikrobiyal hücre fabrikaları ile rekombinant protein üretimidir. Sentetik biyoloji araçları birçok vektör ve genetik devreyi içermektedir. Bu çalışmada pDawT ve pATG adı verilen iki farklı genetik mühendisliği aracı olan vektör üretilmiş ve test edilmiştir. Bu iki vektör aynı mikrobiyal hücre içerisine ko-transforme edilip pDawT+pATG genetik devresi tamamlanmıştır. pDawT plazmidinden T7 RNA polimeraz enzimi ~400nm uzun dalga UV ışığı indüklenmesi ile üretilmekte ve üretilen T7 RNA polimeraz, pATG plazmidi üzerinde bulunan PT7 promotorundan, bu promotorun kontrol ettiği genin transkripsiyonunu başlatmaktadır. Bu çalışmada E. coli DH5α bakterisinde, PT7 kontrolünde EGFP üretilmiş ve hücreler FITC filtresinde floresan mikroskop ile görüntülenmiştir. Görüntülenen hücrelerin RGB ve HSV piksel yoğunluğu ve dağılımı analiz edilmiş ve karşılaştırılmıştır. Üretilen pDawT+pATG genetik devresi ile birçok farklı bakteri veya mayada kullanılabilecek özgün bir optokontrollü rekombinant protein üretim aracı üretilmiştir.

Özet (Çeviri)

Recombinant protein production with microbial cell factories using synthetic biology and genetic engineering is one of the hot topics of microbial biotechnology. Many vectors and genetic circuits are used as synthetic biology tools. In this thesis study, we have produced plasmids pDawT and pATG as two different genetic engineering tools for recombinant protein production. pDawT+pATG genetic circuit is completed by co-transforming these plasmids into microbial cell factories. pDawT component of this genetic circuit is responsible for transcription of T7 RNA Polymerase gene by inducing with ~400nm long range UV. The produced T7 RNA polymerase enzyme then initiates the transcription of EGFP from PT7 promoter of the second component of the genetic circuit, pATG plasmid. In this thesis study we produced EGFP with pDawT+pATG genetic circuit in E. coli DH5α and visualized the cells under fluorescent microscopy via FITC filter. After imaging of the cells, the images' RGB and HSV pixel density and distribution are analyzed and compared. With the produced pDawT+pATG genetic circuit, a novel opto-regulated recombinant protein production tool is produced that can be used widely.

Benzer Tezler

  1. Behçet hastalığında endotelial nitrik oksit sentaz (eNOS) gen polimorfizmlerinin araştırılması

    Investigation of endothelial nitric oxide synthase (eNOS) gene polymorphisms in Behçet's disease

    REMİN AKÇAY

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2005

    Tıbbi BiyolojiAnkara Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. IŞIK BÖKESOY

  2. Piridazinon-üre türevi yeni bileşiklerin sentezi ve biyolojik aktiviteleri üzerine çalışmalar

    Studies on synthesis and biological activity of novel pyridazinon-urea derivatives

    AROOJ BAKHT

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2024

    Eczacılık ve FarmakolojiGazi Üniversitesi

    Farmasötik Kimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ERDEN BANOĞLU

  3. Adaptive shape from shading

    Uyarlanır düzenleme yöntemiyle görüntü tonlarından şekil elde etme

    ATİLLA GÜLTEKİN

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    1997

    Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve Kontrolİstanbul Teknik Üniversitesi

    Bilgisayar Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. MUHİTTİN GÖKMEN

  4. Nanokristal mnb alaşımının sentezlenmesi ve hipertermi uygulamasının araştırılması

    Synthesis of mnb nanocrystal alloy and investigation of hyperthermia application

    ÇAĞKAN PİYAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    Fizik ve Fizik MühendisliğiHacettepe Üniversitesi

    Nanoteknoloji ve Nanotıp Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ŞADAN ÖZCAN

  5. Investigation of novel genes in autosomal dominant Behçet syndrome

    Otozomal dominant Behçet sendromunda özgün genlerin araştırılması

    GAMZE TURAN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2019

    Genetikİstanbul Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)

    PROF. DR. EDA TAHİR TURANLI